N1-羟基-N3-(2-苯基乙基)-1,3-苯二甲酰胺 | 1440209-96-0

• 物质功能分类: 生物化工 - 抑制剂 - 表观遗传学(Epigenetics)
• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯和取代衍生物
• 中文名称: N1-羟基-N3-(2-苯基乙基)-1,3-苯二甲酰胺
• 中文别名: HDAC抑制剂(BRD73954)；N1-羟基-N3-(2-苯乙基)-1,3-苯二甲酰胺；BRD73954抑制剂
• 英文名称: BRD73954
• 英文别名: 3-N-hydroxy-1-N-(2-phenylethyl)benzene-1,3-dicarboxamide
• CAS: 1440209-96-0
• 化学式: C₁₆H₁₆N₂O₃
• 分子量: 284.315
• InChiKey: FIHKWEQJEDRIFS-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 熔点：
  172-175oC
• 密度：
  1.245±0.06 g/cm3(Predicted)
• 溶解度：
  可溶于DMSO（少许）、甲醇（少许）

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.9
• 重原子数：
  21
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.12
• 拓扑面积：
  78.4
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  3

安全信息

• 危险性防范说明：
  P261,P305+P351+P338
• 危险性描述：
  H302,H315,H319,H335

制备方法与用途

性状
BRD73954外观呈白色至类白色固体。

用途
BRD73954是一种有效抑制HDAC6和HDAC8的小分子抑制剂。

生物活性
BRD73954是一种有效的选择性HDAC抑制剂，对HDAC6和HDAC8的IC50分别为36 nM和120 nM。与其它类I和II组的组蛋白去乙酰化酶（HDACs）相比（如HDAC1、9 μM；HDAC2、9 μM；HDAC3、23 μM；HDAC4、＞33 μM；HDAC5、＞33 μM；HDAC7、13 μM；HDAC8、120 nM；HDAC9、＞33 μM），BRD73954对HDAC6和HDAC8表现出优异的选择性，IC50分别为36 nM和120 nM。使用BRD73954处理可显著增加α-突触蛋白的乙酰化水平。

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  Methyl 3-[(2-phenylethyl)carbamoyl]benzoate 在 羟胺 、 sodium hydroxide 作用下， 以 甲醇 、 二氯甲烷 、 水 为溶剂， 生成 N1-羟基-N3-(2-苯基乙基)-1,3-苯二甲酰胺
  参考文献：
  名称：

  Discovery of the First Histone Deacetylase 6/8 Dual Inhibitors

  摘要：

  We disclose the first small molecule histone deacetylase (HDAC) inhibitor (3, BRD73954) capable of potently and selectively inhibiting both HDAC6 and HDAC8 despite the fact that these isoforms belong to distinct phylogenetic classes within the HDAC family of enzymes. Our data demonstrate that meta substituents of phenyl hydroxamic acids are readily accommodated upon binding to HDAC6 and, furthermore, are necessary for the potent inhibition of HDAC8.

  DOI：

  10.1021/jm400390r

文献信息

• COMPOUNDS, SUBSTRATES AND METHODS RELATED TO HISTONE DEACETYLASES
  申请人：The Broad Institute, Inc.

  公开号：US20160060679A1

  公开（公告）日：2016-03-03

  The invention relates to methods for the identification of compounds, peptides and proteins that can act as substrates for histone deacetylases. The invention further relates to compounds of Formula I: F 1 -X 1 -L 1 -X 2 -P 1 -X 3 -G 1 (Formula I) The invention relates to the treatment of diseases or disorders mediated by ARID1A (BAF250A).

  该发明涉及一种用于识别可作为组蛋白去乙酰化酶底物的化合物、肽和蛋白质的方法。该发明还涉及Formula I的化合物：F1-X1-L1-X2-P1-X3-G1（Formula I）。该发明涉及通过ARID1A（BAF250A）介导的疾病或障碍的治疗。
• US9745613B2
  申请人：——

  公开号：US9745613B2

  公开（公告）日：2017-08-29
• Discovery of the First Histone Deacetylase 6/8 Dual Inhibitors
  作者：David E. Olson、Florence F. Wagner、Taner Kaya、Jennifer P. Gale、Nadia Aidoud、Emeline L. Davoine、Fanny Lazzaro、Michel Weïwer、Yan-Ling Zhang、Edward B. Holson

  DOI：10.1021/jm400390r

  日期：2013.6.13

  We disclose the first small molecule histone deacetylase (HDAC) inhibitor (3, BRD73954) capable of potently and selectively inhibiting both HDAC6 and HDAC8 despite the fact that these isoforms belong to distinct phylogenetic classes within the HDAC family of enzymes. Our data demonstrate that meta substituents of phenyl hydroxamic acids are readily accommodated upon binding to HDAC6 and, furthermore, are necessary for the potent inhibition of HDAC8.