甲基百里酚蓝用作生物和细胞染色剂及金属滴定指示剂。
此外,它还是光度法测定Al3+、Ca2+、Mg2+、Hf4+、NbO 和Ti4+ 等金属的显色剂,以及络合滴定法测定Zr4+、Bi3+、Mg2+、Sc3+、Cu2+等金属指示剂。