规则DNA和含碱基的DNA(AP-DNA)与喹啉鎓(1a),线性稠合的苯并[ b ]喹啉鎓(2a),有角度稠合的苯并[ a ]喹啉鎓(3a),苯并[ c ]的相互作用通过光度和粘度滴定(常规DNA),荧光滴定和热DNA变性实验(常规DNA和AP-DNA)研究了喹唑鎓(4a)和二苯并[ a,f ]喹啉鎓(5a)及其衍生物。鉴于母体喹啉鎓离子(1a)和苯并退火的衍生物2a,图3a和4a显示对AP-DNA没有显着的亲和力,在5a中额外的苯并-退火导致该配体对AP-DNA的选择性稳定化增加。因此,后一种化合物代表不需要辅助取代基以实现有效的AP-DNA稳定的配体的第一个实例。此外,对具有不同取代模式的衍生物的研究表明,取代基对AP-DNA的稳定性有影响。我们发现氯取代基以与甲基取代基相似的方式影响配体与AP-DNA结合的倾向,并且可以与已知的甲基作用互补地用于增加配体的结合亲和力。
Targeting abasic site-containing DNA with annelated quinolizinium derivatives: the influence of size, shape and substituents
作者:Katja Benner、Heiko Ihmels、Sarah Kölsch、Phil M. Pithan
DOI:10.1039/c3ob42140f
日期:——
interactions of regular DNA and abasicsite-containingDNA (AP-DNA) with quinolizinium (1a), the linearly fused benzo[b]quinolizinium (2a), the angularly fused benzo[a]quinolizinium (3a), benzo[c]quinolizinium (4a), and dibenzo[a,f]quinolizinium (5a) as well as derivatives thereof were studied with photometric and viscosimetric titrations (regular DNA), fluorimetric titrations and thermal DNA denaturation experiments
规则DNA和含碱基的DNA(AP-DNA)与喹啉鎓(1a),线性稠合的苯并[ b ]喹啉鎓(2a),有角度稠合的苯并[ a ]喹啉鎓(3a),苯并[ c ]的相互作用通过光度和粘度滴定(常规DNA),荧光滴定和热DNA变性实验(常规DNA和AP-DNA)研究了喹唑鎓(4a)和二苯并[ a,f ]喹啉鎓(5a)及其衍生物。鉴于母体喹啉鎓离子(1a)和苯并退火的衍生物2a,图3a和4a显示对AP-DNA没有显着的亲和力,在5a中额外的苯并-退火导致该配体对AP-DNA的选择性稳定化增加。因此,后一种化合物代表不需要辅助取代基以实现有效的AP-DNA稳定的配体的第一个实例。此外,对具有不同取代模式的衍生物的研究表明,取代基对AP-DNA的稳定性有影响。我们发现氯取代基以与甲基取代基相似的方式影响配体与AP-DNA结合的倾向,并且可以与已知的甲基作用互补地用于增加配体的结合亲和力。