3-amino-5-(1-((1-methylpiperidin-3-yl)methyl)-1H-indol-6-yl)-1H-pyrazole-4-carbonitrile

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吲哚及其衍生物
• 英文名称: 3-amino-5-(1-((1-methylpiperidin-3-yl)methyl)-1H-indol-6-yl)-1H-pyrazole-4-carbonitrile
• 英文别名: 3-amino-5-[1-[(1-methylpiperidin-3-yl)methyl]indol-6-yl]-1H-pyrazole-4-carbonitrile
• 化学式: C₁₉H₂₂N₆
• 分子量: 334.424
• InChiKey: AJRDTQMINSKQOE-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.6
• 重原子数：
  25
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.37
• 拓扑面积：
  86.7
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  1-甲基哌啶-3-甲醇 在 4-二甲氨基吡啶 、 正丁基锂 、 sodium acetate 、 sodium hydride 、 一水合肼 、 三乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 乙醇 、 正己烷 、 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 mineral oil 为溶剂， 反应 25.0h， 生成 3-amino-5-(1-((1-methylpiperidin-3-yl)methyl)-1H-indol-6-yl)-1H-pyrazole-4-carbonitrile
  参考文献：
  名称：

  使用基于片段的方法开发脓肿分枝杆菌 tRNA (m1G37) 甲基转移酶 (TrmD) 抑制剂。

  摘要：

  脓肿分枝杆菌 (Mab) 是一种快速增长的多重耐药非结核分枝杆菌，对囊性纤维化和其他已有慢性肺部疾病的患者构成越来越大的威胁。单克隆抗体肺部感染很难治疗，有时甚至不可能治疗，会导致肺功能加速衰退和过早死亡。因此，迫切需要开发具有改善功效的新型抗生素。tRNA (m1G37) 甲基转移酶 (TrmD) 是新型抗生素的一个有前景的靶标。它对于 Mab 和其他分枝杆菌至关重要，可改善核糖体上的读码框维护以防止移码错误。在这项工作中，采用基于片段的方法，合并与活性位点结合的两个片段，然后进行结构引导的精加工，以设计针对 Mab TrmD 的有效纳摩尔抑制剂。其中几种化合物对分枝杆菌物种表现出有希望的活性，除了 Mab 之外，还包括结核分枝杆菌和麻风分枝杆菌，支持使用 TrmD 作为开发抗分枝杆菌化合物的靶点。

  DOI：

  10.1021/acs.jmedchem.9b00809

文献信息

• Development of Inhibitors against <i>Mycobacterium abscessus</i> tRNA (m¹G37) Methyltransferase (TrmD) Using Fragment-Based Approaches
  作者：Andrew J. Whitehouse、Sherine E. Thomas、Karen P. Brown、Alexander Fanourakis、Daniel S.-H. Chan、M. Daben J. Libardo、Vitor Mendes、Helena I. M. Boshoff、R. Andres Floto、Chris Abell、Tom L. Blundell、Anthony G. Coyne

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.9b00809

  日期：2019.8.8

  with improved efficacy. tRNA (m1G37) methyltransferase (TrmD) is a promising target for novel antibiotics. It is essential in Mab and other mycobacteria, improving reading frame maintenance on the ribosome to prevent frameshift errors. In this work, a fragment-based approach was employed with the merging of two fragments bound to the active site, followed by structure-guided elaboration to design potent

  脓肿分枝杆菌 (Mab) 是一种快速增长的多重耐药非结核分枝杆菌，对囊性纤维化和其他已有慢性肺部疾病的患者构成越来越大的威胁。单克隆抗体肺部感染很难治疗，有时甚至不可能治疗，会导致肺功能加速衰退和过早死亡。因此，迫切需要开发具有改善功效的新型抗生素。tRNA (m1G37) 甲基转移酶 (TrmD) 是新型抗生素的一个有前景的靶标。它对于 Mab 和其他分枝杆菌至关重要，可改善核糖体上的读码框维护以防止移码错误。在这项工作中，采用基于片段的方法，合并与活性位点结合的两个片段，然后进行结构引导的精加工，以设计针对 Mab TrmD 的有效纳摩尔抑制剂。其中几种化合物对分枝杆菌物种表现出有希望的活性，除了 Mab 之外，还包括结核分枝杆菌和麻风分枝杆菌，支持使用 TrmD 作为开发抗分枝杆菌化合物的靶点。