8-(p-tolyl)-2'-deoxyadenosine

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 英文名称: 8-(p-tolyl)-2'-deoxyadenosine
• 英文别名: (2R,3S,5R)-5-[6-amino-8-(4-methylphenyl)purin-9-yl]-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-ol
• 化学式: C₁₇H₁₉N₅O₃
• 分子量: 341.37
• InChiKey: AZAYZDXZDKSDGI-YNEHKIRRSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.5
• 重原子数：
  25
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.35
• 拓扑面积：
  119
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N,N-二甲基甲酰胺二甲基缩醛 、 8-(p-tolyl)-2'-deoxyadenosine 以 甲醇 为溶剂， 反应 48.0h， 以97%的产率得到N6-(N,N-dimethylformamidine)-C8-p-tolyl-2'-deoxyadenosine
  参考文献：
  名称：

  A General Synthesis of C8-Arylpurine Phosphoramidites

  摘要：

  我们开发了一种合成 C8 芳基嘌呤磷酰胺的通用方案。C8-溴-2′-脱氧鸟苷的 C8-芳基化是关键步骤，是通过使用铃木偶联法实现的。由于偶联反应是在水性条件下进行的，因此不需要先保护羟基，然后再去保护羟基，从而节省了多个步骤，提高了总产率。一旦引入 C8 芳基，糖苷键就会对酸催化裂解变得非常敏感。用相应的 N,N-二甲基甲酰胺衍生物保护氨基基团可提高衍生物的稳定性。合成的 C8 芳基嘌呤被成功用于制备合成寡核苷酸。

  DOI：

  10.3390/molecules14093339
• 作为产物：
  描述：

  4-碘甲苯 、 2'-脱氧腺苷 在 copper(l) iodide 、 caesium carbonate 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 15.0h， 以38%的产率得到8-(p-tolyl)-2'-deoxyadenosine
  参考文献：
  名称：

  在杂芳烃的C–H键官能化过程中，定义明确的Pd纳米颗粒（PdNP）的形成和传播：纳米颗粒是垂死的Pd形式还是活性催化物质？

  摘要：

  对常用芳烃键官能化催化剂Pd（OAc）2介导的杂芳烃（例如，吲哚，苯并恶唑，苯并噻唑，苯并咪唑和嘌呤衍生物）的一系列CH键官能化反应的研究表明，定义明确的钯纳米粒子（PdNPs）在工作催化剂条件下迅速形成。PdNPs可以在包裹在聚合物基质（聚乙烯吡咯烷酮，PVP）中后异位表征。独立合成的Pd（PVP）NPs是具有催化作用的物质，其催化活性与Pd（OAc）2相称在几个CH键的官能化反应中。在一系列反应中，Pd浓度是一个共同变量，可以使用极性溶剂（例如DMF，DMSO和乙酸）在工作催化条件下与PdNP的扩散相关。

  DOI：

  10.1016/j.tet.2014.06.002

文献信息

• Pd(0)/Cu(I)-Mediated Direct Arylation of 2′-Deoxyadenosines: Mechanistic Role of Cu(I) and Reactivity Comparisons with Related Purine Nucleosides
  作者：Thomas E. Storr、Christoph G. Baumann、Robert J. Thatcher、Sara De Ornellas、Adrian C. Whitwood、Ian J. S. Fairlamb

  DOI：10.1021/jo9012282

  日期：2009.8.21

  8-arylated-2′-deoxyadenosines. Copper(I) appears to have a high binding affinity for 2′-deoxyadenosine, which explains the mandatory requirement for stoichiometric amounts of this key component. The conditions are compared with more general direct arylation protocols, e.g., catalytic Pd, ligand, acid additives, which do not employ copper(I). In each case, no detectable arylation of 2′-deoxyadenosine was noted

  Pd/Cu 介导的 2'-脱氧腺苷与各种芳基碘化物的直接芳基化以良好的产率提供了 8-芳基化的 2'-脱氧腺苷衍生物。在显着的反应优化之后，已经确定亚化学计量的哌啶（仲胺）与碳酸铯的组合对于有效的直接芳基化是必要的。一般合成方案允许较低温度的直接芳基化，从而最大限度地减少去糖基化。哌啶效应的起源主要来自原位生成 Pd(OAc) 2 [(CH 2 ) 5 NH] 2. 已经评估了各种铜（I）盐；只有 CuI 能提供良好的 8-芳基化-2'-脱氧腺苷产率。铜 (I) 似乎对 2'-脱氧腺苷具有高结合亲和力，这解释了对这一关键成分的化学计量数量的强制性要求。这些条件与更一般的直接芳基化方案进行比较，例如催化 Pd、配体、酸添加剂，它们不使用铜 (I)。在每种情况下，均未发现可检测到的 2'-脱氧腺苷芳基化。8-芳基-2'-脱氧腺苷产物的构象偏好已通过详细的光谱 (NMR) 和单晶 X 射线衍射研
• Water-Soluble Pd–Imidate Complexes: Broadly Applicable Catalysts for the Synthesis of Chemically Modified Nucleosides via Pd-Catalyzed Cross-Coupling
  作者：Vijay Gayakhe、Ajaykumar Ardhapure、Anant R. Kapdi、Yogesh S. Sanghvi、Jose Luis Serrano、Luis García、Jose Pérez、Joaquím García、Gregorio Sánchez、Christian Fischer、Carola Schulzke

  DOI：10.1021/acs.joc.5b02475

  日期：2016.4.1

  A broadly applicable catalyst system consisting of water-soluble Pd–imidate complexes has been enployed for the Suzuki–Miyaura cross-coupling of four different nucleosides in water under mild conditions. The efficient nature of the catalyst system also allowed its application in developing a microwave-assisted protocol with the purpose of expediting the catalytic reaction. Preliminary mechanistic studies

  已采用由水溶性Pd-亚氨酸盐络合物组成的广泛适用的催化剂体系，以在温和条件下将水中的四个不同核苷进行Suzuki-Miyaura交叉偶联。催化剂体系的有效性质也使其可用于开发微波辅助规程，以加快催化反应的速度。初步的机理研究，借助催化剂毒性试验和使用电喷雾电离光谱仪进行的化学计量测试，揭示了可能存在同位催化剂体系。
• Formation and propagation of well-defined Pd nanoparticles (PdNPs) during C–H bond functionalization of heteroarenes: are nanoparticles a moribund form of Pd or an active catalytic species?
  作者：Christoph G. Baumann、Sara De Ornellas、Jonathan P. Reeds、Thomas E. Storr、Thomas J. Williams、Ian J.S. Fairlamb

  DOI：10.1016/j.tet.2014.06.002

  日期：2014.9

  benzimidazole and purine derivatives) mediated by Pd(OAc)2, a commonly used C–H bond functionalization catalyst, reveals that well-defined Pd nanoparticles (PdNPs) are rapidly formed under working catalyst conditions. The PdNPs can be characterized ex situ after entrapment in a polymer matrix (polyvinylpyrrolidinone, PVP). Independently synthesized Pd(PVP)NPs are catalytically competent species, exhibiting catalyst

  对常用芳烃键官能化催化剂Pd（OAc）2介导的杂芳烃（例如，吲哚，苯并恶唑，苯并噻唑，苯并咪唑和嘌呤衍生物）的一系列CH键官能化反应的研究表明，定义明确的钯纳米粒子（PdNPs）在工作催化剂条件下迅速形成。PdNPs可以在包裹在聚合物基质（聚乙烯吡咯烷酮，PVP）中后异位表征。独立合成的Pd（PVP）NPs是具有催化作用的物质，其催化活性与Pd（OAc）2相称在几个CH键的官能化反应中。在一系列反应中，Pd浓度是一个共同变量，可以使用极性溶剂（例如DMF，DMSO和乙酸）在工作催化条件下与PdNP的扩散相关。
• Novel water-soluble phosphatriazenes: versatile ligands for Suzuki–Miyaura, Sonogashira and Heck reactions of nucleosides
  作者：Shatrughn Bhilare、Vijay Gayakhe、Ajaykumar V. Ardhapure、Yogesh S. Sanghvi、Carola Schulzke、Yulia Borozdina、Anant R. Kapdi

  DOI：10.1039/c6ra19039a

  日期：——

  complexation reactions with Pd(OAc)2 and utilized for catalyzing column-free Suzuki–Miyaura cross-coupling of various purine and pyrimidine halonucleosides in water. The water-solubility of the catalytic system simplified the isolation of the cross-coupled products to mere filtration, while the catalytically active solution in the filtrate was recycled eight times. A novel copper-free Sonogashira coupling

  两种新的水溶性磷三氮烯配体已被合成为与Pd（OAc）2络合反应的通用配体，并用于催化水中各种嘌呤和嘧啶卤代核苷的无柱铃木-宫浦交叉偶联。催化系统的水溶性简化了交叉偶合产物的分离，使其仅需过滤，而滤液中的催化活性溶液则循环了八次。通过一锅合成FV-100（一种基于核苷的药物，用于带状疱疹或带状疱疹治疗的3期临床试验），也已建立了针对核苷的新型无铜Sonogashira偶联方案。通过另一种抗病毒药物：BVDU的合成证明了Heck反应的应用。
• Efficient One-Step Suzuki Arylation of Unprotected Halonucleosides, Using Water-Soluble Palladium Catalysts
  作者：Elizabeth C. Western、Jonathan R. Daft、Edward M. Johnson、Peter M. Gannett、Kevin H. Shaughnessy

  DOI：10.1021/jo034289p

  日期：2003.8.1

  modification of unprotected halonucleosides is reported herein. Using a catalyst derived from tris(3-sulfonatophenyl)phosphine (TPPTS) and palladium acetate, 8-bromo-2'-deoxyguanosine (8-BrdG) is coupled with arylboronic acids to give 8-aryl-2'-deoxyguanosine adducts (8-ArdG) in excellent yield in a 2:1 water:acetonitrile solvent mixture. The TPPTS ligand was found to be superior to water-soluble alkylphosphines

  修饰核苷以产生药物活性化合物，诱变模型和寡核苷酸结构探针仍然是令人非常感兴趣的。本文报道了未保护的卤代核苷的水相修饰。使用衍生自三（3-磺酰基苯基）膦（TPPTS）和乙酸钯的催化剂，将8-溴2'-脱氧鸟苷（8-BrdG）与芳基硼酸偶合，得到8-芳基-2'-脱氧鸟苷加合物（8 -ArdG）在2：1的水：乙腈溶剂混合物中以优异的收率。对于该偶联反应，发现TPPTS配体优于水溶性烷基膦。偶联化学已扩展到8-溴-2'-脱氧腺苷（8-BrdA）和5-碘-2'-脱氧尿苷（5-IdU），以及核糖核苷8-溴鸟苷和8-溴腺苷。在所有情况下均获得芳基化加合物的良好至优异的收率。使用三（4,6-二甲基-3-磺酰基苯基）膦（TXPTS），可以在室温下不到1小时的时间内完成8-BrdA和5-IdU的Suzuki偶联。该方法学代表了不需要预先保护核苷的卤代核苷芳基化的有效且通用的方法。