9-(β-D-xylofuranosyl)-2-chloroadenine

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 英文名称: 9-(β-D-xylofuranosyl)-2-chloroadenine
• 英文别名: Xylo-(2Cl)Ade；(2R,3R,4R,5R)-2-(6-amino-2-chloropurin-9-yl)-5-(hydroxymethyl)oxolane-3,4-diol
• 化学式: C₁₀H₁₂ClN₅O₄
• 分子量: 301.689
• InChiKey: BIXYYZIIJIXVFW-FTWQFJAYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.1
• 重原子数：
  20
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.5
• 拓扑面积：
  140
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2-(4-甲基苯基)乙醇 、 9-(β-D-xylofuranosyl)-2-chloroadenine 以38%的产率得到
  参考文献：
  名称：

  UEEDA, MASAYUKI;THOMPSON, ROBERT D.;ARROYO, LUIS H.;OLSSON, RAY A., J. MED. CHEM., 34,(1991) N, C. 1340-1344

  摘要：

  DOI：
• 作为产物：
  描述：

  D-木糖 、 2-氯-6-氨基嘌呤 在 potassium dihydrogenphosphate 、 recombinant E_.coli phosphopentomutase 、 recombinant E_.coli purine nucleoside phosphorylase 、 recombinant E_.coli ribokinase 、 potassium chloride 、 5’-三磷酸腺苷 、 manganese(ll) chloride 作用下， 以 aq. buffer 为溶剂， 反应 48.0h， 以8%的产率得到9-(β-D-xylofuranosyl)-2-chloroadenine
  参考文献：
  名称：

  The chemoenzymatic synthesis of clofarabine and related 2′-deoxyfluoroarabinosyl nucleosides: the electronic and stereochemical factors determining substrate recognition by E. coli nucleoside phosphorylases

  摘要：

  对2-氯-9-(2-脱氧-2-氟-β-D-阿拉伯呋喃核糖基)腺嘌呤（1，克洛法比林）的合成进行了两种方法的研究。第一种方法包括通过将1,3,5-三-O-苯甲酰基-2-脱氧-2-氟-α-D-阿拉伯呋喃糖（9）经过三步转化成磷酸2-脱氧-2-氟-α-D-阿拉伯呋喃糖（12a，2F Ara-1P）而无需中间产物的分离。使用重组大肠杆菌嘌呤核苷酸磷酸化酶（PNP）催化12a与2-氯腺嘌呤的缩合反应，形成克洛法比林，收率为67%。该反应还与多种嘌呤碱基（2-氨基腺嘌呤和次黄嘌呤）、它们的类似物（5-氮杂-7-脱氮鸟嘌呤和8-氮杂-7-脱氮次黄嘌呤）以及胸腺嘧啶进行了研究。结果与使用α-D-阿拉伯呋喃糖磷酸（13a，Ara-1P）的类似反应进行了比较。通过从头算计算分析了各种底物的反应性差异，考虑了电子结构（天然嘌呤与类似物）和立体化学特征（2F Ara-1P与Ara-1P）来确定大肠杆菌核苷酸磷酸酶对底物的识别。第二种方法从2-脱氧-2-氟-D-阿拉伯糖的级联一锅酶促转化开始，形成磷酸12a，然后与2-氯腺嘌呤缩合，从而在24小时内以约48%的产率制备克洛法比林。下列重组大肠杆菌酶催化了2-脱氧-2-氟-D-阿拉伯糖的顺序转化为磷酸12a：核糖激酶（2-脱氧-2-氟-D-阿拉伯呋喃糖-5-磷酸）、磷酸戊糖异构酶（PPN；不需要D-己糖的1,6-二磷酸作为辅因子）（12a），最后是PNP。研究了D-阿拉伯糖、D-核糖和D-木糖在相关2-氯腺嘌呤核苷的类似级联合成中的底物活性，并将其与2-脱氧-2-氟-D-阿拉伯糖的活性进行了比较。如预期，D-核糖表现出最佳的底物活性（30分钟内2-氯腺苷（8）产率达90%），D-阿拉伯糖在大约45分钟达到浓度平衡，形成2-氯-9-(β-D-阿拉伯呋喃核糖基)腺嘌呤（6），而形成2-氯-9-(β-D-木糖呋喃核糖基)腺嘌呤（7）的过程非常缓慢，在48小时内产率达到约8%。

  DOI：

  10.3762/bjoc.10.173

文献信息

• MODIFIED NUCLEOSIDES FOR TREATMENT OF VIRAL INFECTIONS AND ABNORMAL CELLULAR PROLIFERATION
  申请人：Pharmasset Limited

  公开号：EP1411954A2

  公开（公告）日：2004-04-28
• [EN] MODIFIED NUCLEOSIDES FOR TREATMENT OF VIRAL INFECTIONS AND ABNORMAL CELLULAR PROLIFERATION<br/>[FR] NUCLEOSIDES MODIFIES POUR TRAITER DES INFECTIONS VIRALES ET UNE PROLIFERATION CELLULAIRE ANORMALE
  申请人：PHARMASSET LTD

  公开号：WO2002032920A2

  公开（公告）日：2002-04-25

  The disclosed invention is a composition for and a method of treating a Flaviviridae (including BVDV and HCV), Orthomyxoviridae (including Influenza A and B) or Paramyxoviridae (including RSV) infection, or conditions related to abnormal cellular proliferation, in a host, including animals, and especially humans, using a nucleoside of general formula (I)-(XXIII) or its pharmaceutically acceptable salt or prodrug. This invention also provides an effective process to quantify the viral load, and in particular BVDV, HCV or West Nile Virus load, in a host, using real-time polymerase chain reaction ('TR-PCR'). Additionally, the invention discloses probe molecules that can fluoresce proportionally to the amount of virus present in a sample.