3'-O-allyl-5-(3-amino-prop-1-ynyl)-5'-O-triphosphate-2'-deoxycytidine

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷酸
• 英文名称: 3'-O-allyl-5-(3-amino-prop-1-ynyl)-5'-O-triphosphate-2'-deoxycytidine
• 英文别名: [[(2R,3S,5R)-5-[4-amino-5-(3-aminoprop-1-ynyl)-2-oxopyrimidin-1-yl]-3-prop-2-enoxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl] phosphono hydrogen phosphate
• 化学式: C₁₅H₂₃N₄O₁₃P₃
• 分子量: 560.288
• InChiKey: RXINYRZKMKYQTL-YNEHKIRRSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -7.3
• 重原子数：
  35
• 可旋转键数：
  12
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.47
• 拓扑面积：
  263
• 氢给体数：
  6
• 氢受体数：
  14

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  、 3'-O-allyl-5-(3-amino-prop-1-ynyl)-5'-O-triphosphate-2'-deoxycytidine 在 4-二甲氨基吡啶 、 N,N'-二琥珀酰亚胺基碳酸酯 、 三正丁胺 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 16.17h， 生成
  参考文献：
  名称：

  Modified nucleotides for polynucleotide sequencing

  摘要：

  公开号：

  EP2607369B1
• 作为产物：
  描述：

  5-碘-2'-脱氧胞苷 在 咪唑 、 磷酸三甲酯 、 copper(l) iodide 、 四(三苯基膦)钯 、 三正丁胺 、 四丁基氟化铵 、 三乙基碳酸氢铵缓冲液 、 1,8-双二甲氨基萘 、 sodium hydride 、 叔丁基二甲基氯硅烷 、 三乙胺 、 三氯氧磷 作用下， 以 四氢呋喃 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 89.0h， 生成 3'-O-allyl-5-(3-amino-prop-1-ynyl)-5'-O-triphosphate-2'-deoxycytidine
  参考文献：
  名称：

  Modified nucleotides for polynucleotide sequencing

  摘要：

  公开号：

  EP2607369B1

文献信息

• SYNTHESIS OF FOUR COLOR 3'O-ALLYL, MODIFIED PHOTOCLEAVABLE FLUORESCENT NUCLEOTIDES AND RELATED METHODS
  申请人：Ju Jingyue

  公开号：US20100041029A1

  公开（公告）日：2010-02-18

  This invention provides a process for making 3′-O-allyl-dGTP-PC-Biodopy-FL-510, 3′-O-allyl-dATP-PC-ROX, 3′-O-allyl-dCTP-PC- and 3′-O-allyl-dUTP-PC-R6G, and related methods.

  本发明提供了制备3'-O-烯丙基-dGTP-PC-Biodopy-FL-510、3'-O-烯丙基-dATP-PC-ROX、3'-O-烯丙基-dCTP-PC-和3'-O-烯丙基-dUTP-PC-R6G及相关方法的过程。
• FOUR-COLOR DNA SEQUENCING BY SYNTHESIS USING CLEAVABLE FLUORESCENT NUCLEOTIDE REVERSIBLE TERMINATORS
  申请人：Ju Jingyue

  公开号：US20100092952A1

  公开（公告）日：2010-04-15

  This invention provides a process for sequencing single-stranded DNA by employing a nanopore and modified nucleotides.

  本发明提供了一种利用纳米孔和修饰核苷酸对单链DNA进行测序的方法。
• SYNTHESIS OF FOUR-COLOR 3'-O-ALLYL MODIFIED PHOTOCLEAVABLE FLUORESCENT NUCLEOTIDES AND RELATED METHODS
  申请人：Ju Jingyue

  公开号：US20160208313A1

  公开（公告）日：2016-07-21

  This invention provides a process for making 3′-O-allyl-dGTP-PC-Biodopy-FL-510, 3′-O-allyl-dATP-PC-ROX, 3′-O-allyl-dCTP-PC-Bodipy-650 and 3′-O-allyl-dUTP-PC-R6G, and related methods.

  本发明提供一种制备3'-O-烯丙基-dGTP-PC-Biodopy-FL-510、3'-O-烯丙基-dATP-PC-ROX、3'-O-烯丙基-dCTP-PC-Bodipy-650和3'-O-烯丙基-dUTP-PC-R6G及相关方法的过程。
• Four-color DNA sequencing by synthesis using cleavable fluorescent nucleotide reversible terminators
  申请人：The Trustees of Columbia University in the City of New York

  公开号：US10000801B2

  公开（公告）日：2018-06-19

  This invention provides a process for sequencing single-stranded DNA employing modified nucleotides.

  本发明提供了一种利用修饰核苷酸对单链 DNA 进行测序的方法。
• Synthesis of four-color 3′-O-allyl modified photocleavable fluorescent nucleotides and related methods
  申请人：The Trustees of Columbia University in the City of New York

  公开号：US10907194B2

  公开（公告）日：2021-02-02

  This invention provides a process for making 3′-O-allyl-dGTP-PC-Biodopy-FL-510, 3′-O-allyl-dATP-PC-ROX, 3′-O-allyl-dCTP-PC-Bodipy-650 and 3′-O-allyl-dUTP-PC-R6G, and related methods.

  本发明提供了一种制造 3′-O-烯丙基-dGTP-PC-Biodopy-FL-510、3′-O-烯丙基-dATP-PC-ROX、3′-O-烯丙基-dCTP-PC-Bodipy-650 和 3′-O-烯丙基-dUTP-PC-R6G 的工艺及相关方法。