1-methyl-4H-pyrrolo[2,3-d]imidazole-5-carboxylic acid

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吡咯
• 英文名称: 1-methyl-4H-pyrrolo[2,3-d]imidazole-5-carboxylic acid
• 英文别名: 1-methyl-1H,4H-pyrrolo[2,3-d]imidazole-5-carboxylicacid
• 化学式: C₇H₇N₃O₂
• 分子量: 165.151
• InChiKey: RUYLNKANJZFGNS-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.4
• 重原子数：
  12
• 可旋转键数：
  1
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.14
• 拓扑面积：
  70.9
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  3

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1-methyl-4H-pyrrolo[2,3-d]imidazole-5-carboxylic acid 、 苯胺 在 氯化亚砜 、 N,N-二甲基甲酰胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 、 吡啶 为溶剂， 反应 3.25h， 以4%的产率得到1-Methyl-N-phenyl-4H-pyrrolo[2,3-d]imidazole-5-carboxamide
  参考文献：
  名称：

  Thieno [3,2 - b ]吡咯-5-羧酰胺是组蛋白赖氨酸脱甲基酶KDM1A / LSD1的新型可逆抑制剂。第1部分：高通量筛选和初步探索

  摘要：

  赖氨酸特异性脱甲基酶1 KDM1A（LSD1）调节组蛋白甲基化，并日益被认为是肿瘤学中潜在的治疗靶标。我们报告了使用时间分辨荧光共振能量转移（TR-FRET）技术在KDM1A / CoREST上进行的高通量筛选活动，以鉴定可逆抑制剂。筛选导致115个结果，我们确定了它们的生化IC 50，从而确定了四个化学系列。经过数据分析，我们确定了N-苯基-4 H-噻吩并[3，2- b ]吡咯-5-羧酰胺的化学系列的优先级，为此，我们获得了最有力的X射线结构（化合物19，IC 50= 2.9μM）与酶复合。该化学类别的最初扩展，包括修饰核心结构和修饰苯甲酰胺部分，都指向负责与酶相互作用的部分的定义。初步优化产生了化合物90，该化合物具有亚微摩尔IC 50（0.162μM）抑制酶，能够抑制细胞中的靶标。

  DOI：

  10.1021/acs.jmedchem.6b01018
• 作为产物：
  描述：

  1-甲基-1氢-5-醛基-咪唑 在 potassium ethoxide 、 水 、 lithium hydroxide 作用下， 以 5,5-dimethyl-1,3-cyclohexadiene 、 乙醇 为溶剂， 反应 5.5h， 生成 1-methyl-4H-pyrrolo[2,3-d]imidazole-5-carboxylic acid
  参考文献：
  名称：

  Thieno [3,2 - b ]吡咯-5-羧酰胺是组蛋白赖氨酸脱甲基酶KDM1A / LSD1的新型可逆抑制剂。第1部分：高通量筛选和初步探索

  摘要：

  赖氨酸特异性脱甲基酶1 KDM1A（LSD1）调节组蛋白甲基化，并日益被认为是肿瘤学中潜在的治疗靶标。我们报告了使用时间分辨荧光共振能量转移（TR-FRET）技术在KDM1A / CoREST上进行的高通量筛选活动，以鉴定可逆抑制剂。筛选导致115个结果，我们确定了它们的生化IC 50，从而确定了四个化学系列。经过数据分析，我们确定了N-苯基-4 H-噻吩并[3，2- b ]吡咯-5-羧酰胺的化学系列的优先级，为此，我们获得了最有力的X射线结构（化合物19，IC 50= 2.9μM）与酶复合。该化学类别的最初扩展，包括修饰核心结构和修饰苯甲酰胺部分，都指向负责与酶相互作用的部分的定义。初步优化产生了化合物90，该化合物具有亚微摩尔IC 50（0.162μM）抑制酶，能够抑制细胞中的靶标。

  DOI：

  10.1021/acs.jmedchem.6b01018

文献信息

• Thieno[3,2-<i>b</i>]pyrrole-5-carboxamides as New Reversible Inhibitors of Histone Lysine Demethylase KDM1A/LSD1. Part 1: High-Throughput Screening and Preliminary Exploration
  作者：Luca Sartori、Ciro Mercurio、Federica Amigoni、Anna Cappa、Giovanni Fagá、Raimondo Fattori、Elena Legnaghi、Giuseppe Ciossani、Andrea Mattevi、Giuseppe Meroni、Loris Moretti、Valentina Cecatiello、Sebastiano Pasqualato、Alessia Romussi、Florian Thaler、Paolo Trifiró、Manuela Villa、Stefania Vultaggio、Oronza A. Botrugno、Paola Dessanti、Saverio Minucci、Elisa Zagarrí、Daniele Carettoni、Lucia Iuzzolino、Mario Varasi、Paola Vianello

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.6b01018

  日期：2017.3.9

  increasingly recognized as a potential therapeutic target in oncology. We report on a high-throughput screening campaign performed on KDM1A/CoREST, using a time-resolved fluorescence resonance energy transfer (TR-FRET) technology, to identify reversible inhibitors. The screening led to 115 hits for which we determined biochemical IC50, thus identifying four chemical series. After data analysis, we have

  赖氨酸特异性脱甲基酶1 KDM1A（LSD1）调节组蛋白甲基化，并日益被认为是肿瘤学中潜在的治疗靶标。我们报告了使用时间分辨荧光共振能量转移（TR-FRET）技术在KDM1A / CoREST上进行的高通量筛选活动，以鉴定可逆抑制剂。筛选导致115个结果，我们确定了它们的生化IC 50，从而确定了四个化学系列。经过数据分析，我们确定了N-苯基-4 H-噻吩并[3，2- b ]吡咯-5-羧酰胺的化学系列的优先级，为此，我们获得了最有力的X射线结构（化合物19，IC 50= 2.9μM）与酶复合。该化学类别的最初扩展，包括修饰核心结构和修饰苯甲酰胺部分，都指向负责与酶相互作用的部分的定义。初步优化产生了化合物90，该化合物具有亚微摩尔IC 50（0.162μM）抑制酶，能够抑制细胞中的靶标。