5'-O-([2-(carboxyl)phenyl]-3-(3-hydroxyphenyl)propanoyl)adenosine

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 英文名称: 5'-O-([2-(carboxyl)phenyl]-3-(3-hydroxyphenyl)propanoyl)adenosine
• 英文别名: 5'-O-{3-[3-(2-carboxyphenyl)-3-oxopropyl]phenyl}adenosine；2-[3-[3-[[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methoxy]phenyl]propanoyl]benzoic acid
• 化学式: C₂₆H₂₅N₅O₇
• 分子量: 519.514
• InChiKey: GEMGRSMVWNUQGG-PTGPVQHPSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.8
• 重原子数：
  38
• 可旋转键数：
  9
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.27
• 拓扑面积：
  183
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  11

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  邻苯二甲酸二甲酯 在 manganese(IV) oxide 、 lithium aluminium tetrahydride 、 [1,1'-二(二叔丁基膦)二茂铁]合二氯钯(II) 、 偶氮二甲酸二异丙酯 、 N-甲基二环己基胺 、 四丁基氟化铵 、 四丁基氯化铵 、 三苯基膦 作用下， 以 四氢呋喃 、 正己烷 、 N,N-二甲基乙酰胺 为溶剂， 生成 5'-O-([2-(carboxyl)phenyl]-3-(3-hydroxyphenyl)propanoyl)adenosine
  参考文献：
  名称：

  腺苷酸形成酶MenE的非酰基氨基磺酸盐抑制剂的基于结构的设计，合成和生物学评估。

  摘要：

  N-酰基氨磺酰基腺苷（酰基-AMS）已被广泛用于抑制参与广泛生物学过程的腺苷酸形成酶。这些酰基-AMS抑制剂是同源的酰基腺苷酸中间体的不可水解模拟物，这些中间体被形成腺苷酸的酶紧密结合。但是，阴离子酰基氨基磺酸酯部分具有药理作用，可能不利于细胞通透性和药代动力学特征。我们之前已经开发了酰基氨基磺酸酯OSB-AMS（1）作为形成腺苷酸化酶MenE的有效抑制剂，MenE是细菌性甲基萘醌生物合成所需的邻琥珀酰苯甲酸酯-CoA（OSB-CoA）合成酶。在这里，我们报告了使用计算对接开发MenE的新型，非酰基氨基磺酸盐抑制剂。发现与间苯醚连接的类似物（5）是最有效的抑制剂（IC50 = 8μM; Kd = 244 nM），并且确定了其X射线共晶体结构以表征其结合模式。计算预测。这项工作为将来开发其他形成腺苷酸的酶的非酰基氨基磺酸盐抑制剂提供了框架。

  DOI：

  10.1021/acs.biochem.9b00003

文献信息

• [EN] INHIBITORS OF ADENYLATE-FORMING ENZYME MENE<br/>[FR] INHIBITEURS DE L'ENZYME MENE FORMANT L'ADÉNYLATE CYCLASE
  申请人：MEMORIAL SLOAN KETTERING CANCER CENTER

  公开号：WO2020163673A1

  公开（公告）日：2020-08-13

  Provided herein are compounds of Formula (I) and pharmaceutically acceptable salts or tautomers thereof which may inhibit adenylate-forming enzymes. Also provided are pharmaceutical compositions, kits, uses, and methods involving the inventive compounds for the treatment and/or prevention of an infectious disease (e.g., bacterial infection (e.g., tuberculosis, methicillin- resistant Staphylococcus aureus)).

  本文提供了式（I）的化合物及其药用可接受的盐或互变异构体，这些化合物可能抑制腺苷酸形成酶。还提供了涉及这些创新化合物用于治疗和/或预防传染病（例如细菌感染（例如结核病、耐甲氧西林金黄色葡萄球菌））的药物组合物、试剂盒、用途和方法。
• Structure-Based Design, Synthesis, and Biological Evaluation of Non-Acyl Sulfamate Inhibitors of the Adenylate-Forming Enzyme MenE
  作者：Christopher E. Evans、Yuanyuan Si、Joe S. Matarlo、Yue Yin、Jarrod B. French、Peter J. Tonge、Derek S. Tan

  DOI：10.1021/acs.biochem.9b00003

  日期：2019.4.9

  sulfamoyladenosines (acyl-AMS) have been used extensively to inhibit adenylate-forming enzymes that are involved in a wide range of biological processes. These acyl-AMS inhibitors are nonhydrolyzable mimics of the cognate acyl adenylate intermediates that are bound tightly by adenylate-forming enzymes. However, the anionic acyl sulfamate moiety presents a pharmacological liability that may be detrimental to cell permeability

  N-酰基氨磺酰基腺苷（酰基-AMS）已被广泛用于抑制参与广泛生物学过程的腺苷酸形成酶。这些酰基-AMS抑制剂是同源的酰基腺苷酸中间体的不可水解模拟物，这些中间体被形成腺苷酸的酶紧密结合。但是，阴离子酰基氨基磺酸酯部分具有药理作用，可能不利于细胞通透性和药代动力学特征。我们之前已经开发了酰基氨基磺酸酯OSB-AMS（1）作为形成腺苷酸化酶MenE的有效抑制剂，MenE是细菌性甲基萘醌生物合成所需的邻琥珀酰苯甲酸酯-CoA（OSB-CoA）合成酶。在这里，我们报告了使用计算对接开发MenE的新型，非酰基氨基磺酸盐抑制剂。发现与间苯醚连接的类似物（5）是最有效的抑制剂（IC50 = 8μM; Kd = 244 nM），并且确定了其X射线共晶体结构以表征其结合模式。计算预测。这项工作为将来开发其他形成腺苷酸的酶的非酰基氨基磺酸盐抑制剂提供了框架。