A facile biodegradable chitosan‐SO3H catalyzed acridine‐1,8‐dione synthesis with molecular docking, molecular dynamics simulation and density functional theory against human topoisomerase II beta and Staphylococcus aureus tyrosyl‐tRNA synthetase
作者:Nusrat Sahiba、Ayushi Sethiya、Jay Soni、Pankaj Teli、Ankita Garg、Shikha Agarwal
DOI:10.1016/j.molstruc.2022.133676
日期:2022.11
molecular dynamics simulations, protein-ligand interaction energy calculations and DFT studies. Among all, compounds 4e, 4f (– 11.8 kcal/mol), 4g, 4x and 4c (– 10.8 kcal/mol), 4d, 4i, 4s were the most potent against Human Topoisomerase II beta (3QX3) and Staphylococcus aureus (S. aureus) tyrosyl-tRNA synthetase (1JIJ), respectively and displayed good binding affinity and interaction pattern. Easy availability
已经使用可生物降解的非均相催化剂壳聚糖-SO 3 H 在环境反应条件下研究了一种高效且环保的假一锅法合成吖啶-1,8-二酮。使用壳聚糖-SO 3 H 催化剂在室温下,二甲酮、醛和乙酸铵在乙醇水溶液中的高效反应显示出高产率,反应时间短。通过分子对接和分子动力学模拟、蛋白质-配体相互作用能计算和DFT研究,进一步研究了分子的生物活性。其中,化合物4e、4f (– 11.8 kcal/mol) 、4g、4x和4c (– 10.8 kcal/mol) 、4d、4i、4s分别对人拓扑异构酶 II β ( 3QX3) 和金黄色葡萄球菌( S. aureus)酪氨酰-tRNA 合成酶( 1JIJ) 最有效,并显示出良好的结合亲和力和相互作用模式。易于获得底物和催化剂,使用可生物降解和可回收的聚合固体酸催化剂,避免使用有毒和金属试剂,操作简单,无需柱层析,易于后处理,清洁反应曲线,高收率 (70–95%)