Identification of a binding site on soluble RANKL that can be targeted to inhibit soluble RANK-RANKL interactions and treat osteoporosis
作者:Dane Huang、Chao Zhao、Ruyue Li、Bingyi Chen、Yuting Zhang、Zhejun Sun、Junkang Wei、Huihao Zhou、Qiong Gu、Jun Xu
DOI:10.1038/s41467-022-33006-4
日期:——
challenges for discovering protein-protein interaction inhibitors is identifying selective and druggable binding sites at the protein surface. Here, we report an approach to identify a small molecular binding site to selectively inhibit the interaction of soluble RANKL and RANK for designing anti-osteoporosis drugs without undesirable immunosuppressive effects. Through molecular dynamic simulations, we
发现蛋白质-蛋白质相互作用抑制剂的主要挑战之一是确定蛋白质表面的选择性和药物结合位点。在这里,我们报告了一种识别小分子结合位点以选择性抑制可溶性 RANKL 和 RANK 相互作用的方法,用于设计抗骨质疏松症药物而不会产生不良的免疫抑制作用。通过分子动力学模拟,我们发现了一个结合位点,它允许小分子选择性地中断可溶性 RANKL-RANK 相互作用,而不干扰膜 RANKL-RANK 相互作用。我们描述了一种高效抑制剂 S3-15,并通过体外和体内研究证明了其抑制可溶性 RANKL-RANK 相互作用的特异性。S3-15 具有抗骨质疏松作用,不会引起免疫抑制。通过计算机和体外实验,我们进一步证实了 S3-15 和可溶性 RANKL 的结合模型。这项工作可能会激发基于结构的药物发现,以靶向蛋白质-蛋白质相互作用。