2-[2-[(1-Methylquinolin-1-ium-4-yl)methylidene]-1,3-benzothiazol-3-yl]acetate

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 喹啉及其衍生物
• 英文名称: 2-[2-[(1-Methylquinolin-1-ium-4-yl)methylidene]-1,3-benzothiazol-3-yl]acetate
• 英文别名: 2-[2-[(1-methylquinolin-1-ium-4-yl)methylidene]-1,3-benzothiazol-3-yl]acetate
• 化学式: C₂₀H₁₆N₂O₂S
• 分子量: 348.425
• InChiKey: IAQWRYLXCXUYTF-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5
• 重原子数：
  25
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.1
• 拓扑面积：
  72.6
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2-[2-[(1-Methylquinolin-1-ium-4-yl)methylidene]-1,3-benzothiazol-3-yl]acetate 在 O-(1H-benzotriazol-1-yl)-N,N,N',N'-tetramethyluronium hexafluorophosphate 、 N,N-二异丙基乙胺 、 三氟乙酸 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 4.11h， 生成
  参考文献：
  名称：

  双链 DNA 和 RNA 中极简非规范位点的筛选揭示了荧光碱基探针的背景和基序选择性结合

  摘要：

  一种半理性方法可检测双链 DNA 和 RNA 中非规范对 (NCP) 位点的低亲和力结合。针对具有单脱碱基、单 NCP 和串联 NCP 位点的 dsDNA 和 dsRNA 筛选一组带有非生物（三嗪、嘧啶）和天然 RNA 碱基的荧光噻唑橙探针。荧光探针的结合揭示了与 NCP 的新颖且选择性的碱基相互作用，为靶向 RNA 中非规范基序的新策略奠定了基础。

  DOI：

  10.1002/chem.202103616
• 作为产物：
  描述：

  2-甲基苯并噻唑 在 三乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 、 甲苯 为溶剂， 反应 48.0h， 生成 2-[2-[(1-Methylquinolin-1-ium-4-yl)methylidene]-1,3-benzothiazol-3-yl]acetate
  参考文献：
  名称：

  双链 DNA 和 RNA 中极简非规范位点的筛选揭示了荧光碱基探针的背景和基序选择性结合

  摘要：

  一种半理性方法可检测双链 DNA 和 RNA 中非规范对 (NCP) 位点的低亲和力结合。针对具有单脱碱基、单 NCP 和串联 NCP 位点的 dsDNA 和 dsRNA 筛选一组带有非生物（三嗪、嘧啶）和天然 RNA 碱基的荧光噻唑橙探针。荧光探针的结合揭示了与 NCP 的新颖且选择性的碱基相互作用，为靶向 RNA 中非规范基序的新策略奠定了基础。

  DOI：

  10.1002/chem.202103616

文献信息

• Selective probes targeting c-MYC Pu22 G-quadruplex and their application in live mice imaging
  作者：Zhuo Yu、Wenbo Huang、Liqiao Shi、Shaoyong Ke、Shengzhen Xu

  DOI：10.1016/j.cclet.2021.09.087

  日期：2022.3
• [EN] BIFACIAL PEPTIDE NUCLEIC ACID PROBES AND METHODS OF USING THEREOF<br/>[FR] SONDES D'ACIDES NUCLÉIQUES PEPTIDIQUES BIFACIALES ET LEURS PROCÉDÉS D'UTILISATION
  申请人：[en]OHIO STATE INNOVATION FOUNDATION

  公开号：WO2024010977A1

  公开（公告）日：2024-01-11

  Disclosed herein are bifacial peptide nucleic acid probes. These probes can include a triplex hybrid forming moiety (e.g., a plurality of binding motifs disposed along a peptidyl backbone) conjugated to a prosthetic group. The triplex hybrid forming moiety can bind to a non-canonical base pairing site in a target nucleic acid via triplex hybridization. In this way, a variety of prosthetic groups (e.g., dyes, labels, reactive groups, etc.) can be selectively delivered to a target nucleic acid (e.g.,in vivo,in vitro, orex vivo).
• Screening of Minimalist Noncanonical Sites in Duplex DNA and RNA Reveals Context and Motif‐Selective Binding by Fluorogenic Base Probes
  作者：Yufeng Liang、Shiqin Miao、Jie Mao、Shekaraiah Devari、Maricarmen Gonzalez、Dennis Bong

  DOI：10.1002/chem.202103616

  日期：2022.1.10

  A semi-rational approach to detect low affinity binding to noncanonical pair (NCP) sites in duplex DNA and RNA has been developed. A set of fluorogenic thiazole orange probes bearing abiotic (triazines, pyrimidines) and native RNA bases was screened against dsDNAs and dsRNAs with single abasic, single NCP and tandem NCP sites. Fluorogenic probe engagement revealed novel and selective base interactions

  一种半理性方法可检测双链 DNA 和 RNA 中非规范对 (NCP) 位点的低亲和力结合。针对具有单脱碱基、单 NCP 和串联 NCP 位点的 dsDNA 和 dsRNA 筛选一组带有非生物（三嗪、嘧啶）和天然 RNA 碱基的荧光噻唑橙探针。荧光探针的结合揭示了与 NCP 的新颖且选择性的碱基相互作用，为靶向 RNA 中非规范基序的新策略奠定了基础。