methyl (2S)-2-[[(2S)-2-amino-4-methyl-pentanoyl]amino]-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propanoate

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: methyl (2S)-2-[[(2S)-2-amino-4-methyl-pentanoyl]amino]-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propanoate
• 英文别名: methyl (2S)-2-[[(2S)-2-amino-4-methylpentanoyl]amino]-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propanoate
• 化学式: C₁₄H₂₅N₃O₄
• 分子量: 299.37
• InChiKey: QBWDVNBDRFGPIG-DCAQKATOSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.1
• 重原子数：
  21
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.79
• 拓扑面积：
  111
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  methyl (2S)-2-[[(2S)-2-amino-4-methyl-pentanoyl]amino]-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propanoate 在 4-二甲氨基吡啶 、 锂硼氢 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 、 2-碘酰基苯甲酸 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 、 二甲基亚砜 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 31.0h， 生成 N-[(1S)-1-[[(1S)-1-formyl-2-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]ethyl]carbamoyl]-3-methyl-butyl]-4-methoxy-1H-indole-2-carboxamide
  参考文献：
  名称：

  Inhibitors of cysteine proteases and methods of use thereof

  摘要：

  该披露提供了具有战斗头的化合物及其在治疗医学疾病或紊乱，如病毒感染方面的用途。提供了制药组合物和制备各种带有战斗头的化合物的方法。这些化合物被认为能够抑制蛋白酶，如3C、CL-或3CL样蛋白酶。提供的示例化合物包括Formula II-I，其中R3、RB如下所示：

  公开号：

  US11124497B1
• 作为产物：
  描述：

  (alphaS,3S)-alpha-[(叔-丁基氧羰基)氨基]-2-氧代-3-吡咯烷丙酸甲酯 在 三乙胺 、 三氟乙酸 、 N-[(dimethylamino)-3-oxo-1H-1,2,3-triazolo[4,5-b]pyridin-1-yl-methylene]-N-methylmethanaminium hexafluorophosphate 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 1.75h， 生成 methyl (2S)-2-[[(2S)-2-amino-4-methyl-pentanoyl]amino]-3-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propanoate
  参考文献：
  名称：

  作为 SARS-CoV-2 3CL 蛋白酶抑制剂的拟肽腈弹头

  摘要：

  悲惨的是，新冠肺炎 (COVID-19) 大流行造成的死亡人数持续上升，而且随着全球范围内观察到病毒变异，迫切需要新的治疗方法，特别是易于施用的直接作用抗病毒药物。针对 SARS-CoV-2 3CL 蛋白酶（对病毒复制至关重要）的研究以及不同的肽模拟物和弹头是潜在药物开发研究的活跃领域。然而，迄今为止，只有少数出版物评估了腈弹头作为病毒 3CL 蛋白酶抑制剂的作用，并且只报道了适度的活性。本文介绍了我们对 P3 4-甲氧基吲哚拟肽类似物的研究，其中包含带有腈弹头的选定 P1 和 P2 基团，它们是 SARS-CoV-2 3CL 蛋白酶的有效抑制剂，并证明了体外SARS -CoV-2 抗病毒活性。还观察到腈弹头对 SARS-CoV-2 3CL 蛋白酶相对于人组织蛋白酶 B、S 和 L 的选择性，优于醛弹头。与 SARS-CoV-2 3CL 蛋白酶的共晶结构和可逆性研究表明，当催化硫与腈的碳形

  DOI：

  10.1039/d1md00247c

文献信息

• [EN] PEPTIDOMIMETICS FOR THE TREATMENT OF CORONAVIRUS AND PICORNAVIRUS INFECTIONS<br/>[FR] PEPTIDOMIMÉTIQUES POUR LE TRAITEMENT D'INFECTIONS PAR CORONAVIRUS ET PICORNAVIRUS
  申请人：UNIV EMORY

  公开号：WO2020247665A1

  公开（公告）日：2020-12-10

  Compounds, compositions and methods for preventing, treating or curing a coronavirus, picornavirus, and/or Hepeviridae virus infection in human subjects or other animal hosts. Specific viruses that can be treated include enteroviruses. In one embodiment, the compounds can be used to treat an infection with a severe acute respiratory syndrome virus, such as human coronavirus 229E, SARS, MERS, SARS-CoV-1 (OC43), and SARS-CoV- 2. In another embodiment, the methods are used to treat a patient co-infected with two or more of these viruses, or a combination of one or more of these viruses and norovirus.

  用于预防、治疗或治愈人类主体或其他动物宿主中的冠状病毒、小RNA病毒和/或肝炎病毒感染的化合物、组合物和方法。可治疗的特定病毒包括肠病毒。在一个实施例中，这些化合物可用于治疗严重急性呼吸综合征病毒感染，如人类冠状病毒229E、SARS、MERS、SARS-CoV-1（OC43）和SARS-CoV-2。在另一个实施例中，这些方法用于治疗患有两种或更多这些病毒的患者，或一种或多种这些病毒与诺如病毒的组合。
• [EN] PEPTIDOMIMETICS FOR THE TREATMENT OF NOROVIRUS INFECTION<br/>[FR] PEPTIDOMIMÉTIQUES POUR LE TRAITEMENT D'UNE INFECTION À NOROVIRUS
  申请人：UNIV EMORY

  公开号：WO2017197377A1

  公开（公告）日：2017-11-16

  The present invention is directed to compounds, compositions and methods for preventing, treating or curing Norovirus infection in human subjects or other animal hosts.

  本发明涉及用于预防、治疗或治愈人类主体或其他动物宿主中的诺如病毒感染的化合物、组合物和方法。
• [EN] NITRILE-CONTAINING ANTIVIRAL COMPOUNDS<br/>[FR] COMPOSÉS ANTIVIRAUX CONTENANT DU NITRILE
  申请人：PFIZER

  公开号：WO2021250648A1

  公开（公告）日：2021-12-16

  The invention relates to compounds of Formula (I'') wherein R, R1, R2, R3, p, q and q' are as defined herein, pharmaceutical compositions comprising the compounds, methods of treating coronavirus infection such as COVID-19 in a patient by administering therapeutically effective amounts of the compounds, and methods of inhibiting or preventing replication of coronaviruses such as SARS- CoV-2 with the compounds.

  该发明涉及公式(I'')中的化合物，其中R、R1、R2、R3、p、q和q'的定义如本文所述，包括该化合物的药物组合物，通过向患者施用治疗有效量的化合物来治疗冠状病毒感染，如COVID-19的方法，以及使用该化合物抑制或预防冠状病毒如SARS-CoV-2的复制的方法。
• Peptidomimetic nitrile warheads as SARS-CoV-2 3CL protease inhibitors
  作者：Bing Bai、Elena Arutyunova、Muhammad Bashir Khan、Jimmy Lu、Michael A. Joyce、Holly A. Saffran、Justin A. Shields、Appan Srinivas Kandadai、Alexandr Belovodskiy、Mostofa Hena、Wayne Vuong、Tess Lamer、Howard S. Young、John C. Vederas、D. Lorne Tyrrell、M. Joanne Lemieux、James A. Nieman

  DOI：10.1039/d1md00247c

  日期：——

  peptidomimetics and warheads is an active area of research for development of potential drugs. To date, however, only a few publications have evaluated the nitrile warhead as a viral 3CL protease inhibitor, with only modest activity reported. This article describes our investigation of P3 4-methoxyindole peptidomimetic analogs with select P1 and P2 groups with a nitrile warhead that are potent inhibitors of SARS-CoV-2

  悲惨的是，新冠肺炎 (COVID-19) 大流行造成的死亡人数持续上升，而且随着全球范围内观察到病毒变异，迫切需要新的治疗方法，特别是易于施用的直接作用抗病毒药物。针对 SARS-CoV-2 3CL 蛋白酶（对病毒复制至关重要）的研究以及不同的肽模拟物和弹头是潜在药物开发研究的活跃领域。然而，迄今为止，只有少数出版物评估了腈弹头作为病毒 3CL 蛋白酶抑制剂的作用，并且只报道了适度的活性。本文介绍了我们对 P3 4-甲氧基吲哚拟肽类似物的研究，其中包含带有腈弹头的选定 P1 和 P2 基团，它们是 SARS-CoV-2 3CL 蛋白酶的有效抑制剂，并证明了体外SARS -CoV-2 抗病毒活性。还观察到腈弹头对 SARS-CoV-2 3CL 蛋白酶相对于人组织蛋白酶 B、S 和 L 的选择性，优于醛弹头。与 SARS-CoV-2 3CL 蛋白酶的共晶结构和可逆性研究表明，当催化硫与腈的碳形
• The structure-based design of peptidomimetic inhibitors against SARS-CoV-2 3C like protease as Potent anti-viral drug candidate
  作者：Hao Wang、Rongjuan Pei、Xin Li、Weilong Deng、Shuai Xing、Yanan Zhang、Chen Zhang、Shuai He、Hao Sun、Shuqi Xiao、Jin Xiong、Yecheng Zhang、Xinwen Chen、Yaxin Wang、Yu Guo、Bo Zhang、Luqing Shang

  DOI：10.1016/j.ejmech.2022.114458

  日期：2022.8

  Targeting on the 3CLPro, we screened our protease inhibitor library and obtained compound 10a as hit to weakly inhibit the SARS-CoV-2 3CLPro, and determined the co-crystal structure of 10a and the protease. Based on the deep understanding on the protein-ligand complexes between the hit and SARS-CoV-2 3CLPro, we designed a series of peptidomimetic inhibitors, with outstanding inhibitory activity against

  严重急性呼吸系统综合症冠状病毒 2 (SARS-CoV-2) 作为 2019 年冠状病毒病 (COVID-19) 的病原体，已感染数百万人并夺去数十万人的生命。不幸的是，缺乏预防或治疗 COVID-19 的有效药物。SARS-CoV-2 的3C 样蛋白酶 (3CL Pro ) 对病毒复制和转录至关重要，是开发抗 SARS-CoV-2 药物的有吸引力的靶标。针对3CL Pro，我们筛选了我们的蛋白酶抑制剂库，得到了化合物10a作为弱抑制SARS-CoV-2 3CL Pro的靶标，并确定了10a的共晶结构和蛋白酶。基于对 hit 与 SARS-CoV-2 3CL Pro之间的蛋白配体复合物的深入理解，我们设计了一系列拟肽抑制剂，对 SARS-CoV-2 3CL Pro 具有突出的抑制活性，对 SARS-CoV-2 3CL Pro具有出色的抗病毒效力SARS-CoV-2。X 射线共晶研究明确描述了其他关键抑制剂与