1-((4-((3-chlorobenzyl)oxy)phenyl)sulfonyl)-1H-indole-2-carboxylic acid

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吲哚及其衍生物
• 英文名称: 1-((4-((3-chlorobenzyl)oxy)phenyl)sulfonyl)-1H-indole-2-carboxylic acid
• 英文别名: 1-[4-[(3-Chlorophenyl)methoxy]phenyl]sulfonylindole-2-carboxylic acid；1-[4-[(3-chlorophenyl)methoxy]phenyl]sulfonylindole-2-carboxylic acid
• 化学式: C₂₂H₁₆ClNO₅S
• 分子量: 441.892
• InChiKey: QDHAZAAJSGGQDF-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.2
• 重原子数：
  30
• 可旋转键数：
  6
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.05
• 拓扑面积：
  94
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  sodium p-hydroxybenzenesulfonate 在 氯化亚砜 、 lithium hydroxide monohydrate 、 水 、 sodium hydride 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 sodium hydroxide 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 异丙醇 为溶剂， 反应 27.08h， 生成 1-((4-((3-chlorobenzyl)oxy)phenyl)sulfonyl)-1H-indole-2-carboxylic acid
  参考文献：
  名称：

  1-取代-吲哚-2-羧酸作为选择性 Mcl-1 抑制剂的基于片段的设计、合成和生物学评价

  摘要：

  基于已知的选择性 Mcl-1 抑制剂 6-氯-3-(3-(4-氯-3,5-二甲基苯氧基)丙基)-1H-吲哚-2-羧酸，我们采用基于片段的方法获得延伸到 BH3 凹槽 p1 口袋的新分子，然后表现出对 Mcl-1 的结合选择性，而不是 Bcl-2 蛋白。在我们从母体分子中解构出 1H-吲哚-2-羧酸后，根据 X 射线鉴定的母体分子的结合模式，在 1 位取代了苯磺酰基以采用优选的几何形状来访问 p1 口袋晶体学。在分子生长以占据 p1 口袋的过程中，配体结合的自由能 (ΔG) 与非氢重原子数 (HAC) 之间保持线性关系。最后，我们不仅得到了化合物 12 的 7。对 Mcl-1 的选择性比 Bcl-2（Ki = 3.6 µM）高 5 倍（荧光偏振的 Ki = 0.48 µM），但也提供了证据表明 p1 口袋的额外占用对 Mcl-1 比对 Bcl-更有利2 结合，对 Mcl-1 抑制的贡献大于对

  DOI：

  10.1002/ardp.201600251

文献信息

• Fragment-Based Design, Synthesis, and Biological Evaluation of 1-Substituted-indole-2-carboxylic Acids as Selective Mcl-1 Inhibitors
  作者：Ziqian Wang、Wenjie Xu、Ting Song、Zongwei Guo、Lu Liu、Yudan Fan、Anhui Wang、Zhichao Zhang

  DOI：10.1002/ardp.201600251

  日期：2017.1

  Based on a known selective Mcl‐1 inhibitor, 6‐chloro‐3‐(3‐(4‐chloro‐3,5‐dimethylphenoxy)propyl)‐1H‐indole‐2‐carboxylic acid, we applied a fragment‐based approach to obtain new molecules that extended into the p1 pocket of the BH3 groove and then exhibited binding selectivity for the Mcl‐1 over the Bcl‐2 protein. After we deconstructed the 1H‐indole‐2‐carboxylic acid from the parental molecule, a benzenesulfonyl

  基于已知的选择性 Mcl-1 抑制剂 6-氯-3-(3-(4-氯-3,5-二甲基苯氧基)丙基)-1H-吲哚-2-羧酸，我们采用基于片段的方法获得延伸到 BH3 凹槽 p1 口袋的新分子，然后表现出对 Mcl-1 的结合选择性，而不是 Bcl-2 蛋白。在我们从母体分子中解构出 1H-吲哚-2-羧酸后，根据 X 射线鉴定的母体分子的结合模式，在 1 位取代了苯磺酰基以采用优选的几何形状来访问 p1 口袋晶体学。在分子生长以占据 p1 口袋的过程中，配体结合的自由能 (ΔG) 与非氢重原子数 (HAC) 之间保持线性关系。最后，我们不仅得到了化合物 12 的 7。对 Mcl-1 的选择性比 Bcl-2（Ki = 3.6 µM）高 5 倍（荧光偏振的 Ki = 0.48 µM），但也提供了证据表明 p1 口袋的额外占用对 Mcl-1 比对 Bcl-更有利2 结合，对 Mcl-1 抑制的贡献大于对