RimO 是不断增长的自由基 S-
腺苷甲
硫氨酸 (S
AM) 酶超家族的成员,它使用还原的 [4Fe-4S] 簇来实现 S
AM 的 5' CS 键的还原裂解,形成 5'-脱氧
腺苷 5'-自由基 (5'-dA(•)) 中间体。RimO 使用这种强氧化剂来催化甲
硫基 (-SCH3) 与蛋白质 S12
天冬氨酸 89 的 C3 的连接,蛋白质 S12 是构成细菌
核糖体 30S 亚基的 21 种蛋白质之一。然而,这种转变发生的确切机制仍然难以捉摸。在这里,我们描述了 RimO 反应的立体
化学过程。使用在目标天冬
氨酰残基的 3 个 pro-R 或 3 个 pro-S 位置处带有
氘的 S12 蛋白的
肽模拟物,我们表明来自 Bacteroides thetaiotaomicron (Bt) 的 RimO 催化了 pro-S 氢原子的提取,
氘转移到 5'-脱氧
腺苷 (5'-dAH) 证明了这一点。观察到的对