(E)-3-(4-(((2-(2-甲基-1H-吲哚-3-基)乙基)氨基)甲基)苯基)丙烯酸甲酯 | 441741-65-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吲哚及其衍生物
• 中文名称: (E)-3-(4-(((2-(2-甲基-1H-吲哚-3-基)乙基)氨基)甲基)苯基)丙烯酸甲酯
• 中文别名: (2E)-3-[4-[[[2-(2-甲基-1H-吲哚-3-基)乙基]氨基]甲基]苯基]-2-丙烯酸甲酯
• 英文名称: methyl (E)-3-[4-[[2-(2-methyl-1H-indol-3-yl)ethylamino]methyl]phenyl]acrylate
• 英文别名: (E)-methyl 3-(4-{[2-(2-methyl-1H-indol-3-yl) ethylamino]methyl}phenyl)acrylate；(E)-Methyl 3-(4-(((2-(2-methyl-1H-indol-3-yl)ethyl)amino)methyl)phenyl)acrylate；methyl (E)-3-[4-[[2-(2-methyl-1H-indol-3-yl)ethylamino]methyl]phenyl]prop-2-enoate
• CAS: 441741-65-7
• 化学式: C₂₂H₂₄N₂O₂
• 分子量: 348.445
• InChiKey: RPLQUEPXYREGMA-VAWYXSNFSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.1
• 重原子数：
  26
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.23
• 拓扑面积：
  54.1
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  3

安全信息

• 海关编码：
  2933990090

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (E)-3-(4-(((2-(2-甲基-1H-吲哚-3-基)乙基)氨基)甲基)苯基)丙烯酸甲酯 在 盐酸羟胺 、 potassium hydroxide 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 反应 20.0h， 以63%的产率得到帕比司他
  参考文献：
  名称：

  一种新型缺氧激活 KDAC 抑制剂的开发和临床前测试

  摘要：

  肿瘤缺氧与治疗抵抗和患者预后不良有关。缺氧激活的前药，旨在选择性地靶向缺氧细胞同时保护正常组织，代表了一种有前途的治疗策略。我们报告了 1-甲基-2-硝基咪唑帕比司他（NI-Pano，CH-03）的临床前疗效，这是临床使用的赖氨酸脱乙酰酶抑制剂帕比司他的新型生物还原剂。NI-Pano 在常氧 (21% O 2 ) 条件下稳定，并经过 NADPH-CYP 介导的酶促生物还原以在缺氧 (<0.1% O 2）。用 NI-Pano 处理在 2D 和 3D 中生长的细胞会增加组蛋白 H3 在赖氨酸 9 处的乙酰化，诱导细胞凋亡，并降低克隆存活率。重要的是，NI-Pano 作为单一药剂在肿瘤异种移植物中表现出生长延迟效应。药代动力学分析证实在缺氧小鼠异种移植物中存在亚微摩尔浓度的帕比司他，但在循环血浆或肾脏中不存在。总之，我们的临床前结果为 NI-Pano 用于选择性靶向缺氧肿瘤的临床开发提供了强有力的机械原理。

  DOI：

  10.1016/j.chembiol.2021.04.004
• 作为产物：
  描述：

  1H-2-甲基-3-氨乙基吲哚 在 potassium carbonate 、 1,8-二氮杂双环[5.4.0]十一碳-7-烯 、 lithium chloride 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 、 乙腈 为溶剂， 反应 5.25h， 生成 (E)-3-(4-(((2-(2-甲基-1H-吲哚-3-基)乙基)氨基)甲基)苯基)丙烯酸甲酯
  参考文献：
  名称：

  一种帕比司他中间体及其合成与应用

  摘要：

  本发明属于药物合成领域，具体涉及一种帕比司他中间体及其合成与应用，所述中间体如式II所示，以2‑甲基色胺和4‑氯甲基苯甲醛反应得到，原料价廉易得，反应条件温和，操作简便；以上述中间体为原料制备帕比司他，成本低廉，反应步骤少，纯度高，且反应条件温和，操作简便，利于帕比司他原料药的质量控制和降低成本。

  公开号：

  CN108794375A

文献信息

• An Improved and Efficient Synthesis of Panobinostat
  作者：Shanwen Chen、Peiming Zhang、Huali Chen、Pu Zhang、Yu Yu、Zongjie Gan

  DOI：10.3184/174751918x15357309308931

  日期：2018.9

  An improved and efficient method for the synthesis of panobinostat was developed. The commercially available starting material 4-(chloromethyl)benzaldehyde was converted to (E)-methyl 3-[4-(chloromethyl)phenyl]acrylate via the Wittig–Horner reaction and was then directly condensed with 2-(2-methyl-1H-indol-3-yl)ethanamine to afford the key intermediate (E)-methyl 3-[4-([2-(2-methyl-1H-indol-3-yl)

  开发了一种改进的有效合成帕比司他的方法。市售原料 4-(氯甲基)苯甲醛通过 Wittig-Horner 反应转化为 (E)-甲基 3-[4-(氯甲基)苯基]丙烯酸酯，然后直接与 2-(2-甲基-1H) 缩合-indol-3-yl)乙胺得到关键中间体(E)-甲基3-[4-([2-(2-甲基-1H-吲哚-3-基)乙基]氨基}甲基)苯基]丙烯酸酯在一锅合成反应器中。随后顺利进行亲核取代反应以生成所需化合物。关键中间体和目标化合物通过HRMS、1H NMR和13C NMR表征。该程序操作简单，更适合工业化生产。
• Identifying drug targets in tissues and whole blood with thermal-shift profiling
  作者：Jessica Perrin、Thilo Werner、Nils Kurzawa、Anna Rutkowska、Dorothee D. Childs、Mathias Kalxdorf、Daniel Poeckel、Eugenia Stonehouse、Katrin Strohmer、Bianca Heller、Douglas W. Thomson、Jana Krause、Isabelle Becher、H. Christian Eberl、Johanna Vappiani、Daniel C. Sevin、Christina E. Rau、Holger Franken、Wolfgang Huber、Maria Faelth-Savitski、Mikhail M. Savitski、Marcus Bantscheff、Giovanna Bergamini

  DOI：10.1038/s41587-019-0388-4

  日期：2020.3

  Monitoring drug–target interactions with methods such as the cellular thermal-shift assay (CETSA) is well established for simple cell systems but remains challenging in vivo. Here we introduce tissue thermal proteome profiling (tissue-TPP), which measures binding of small-molecule drugs to proteins in tissue samples from drug-treated animals by detecting changes in protein thermal stability using quantitative mass spectrometry. We report organ-specific, proteome-wide thermal stability maps and derive target profiles of the non-covalent histone deacetylase inhibitor panobinostat in rat liver, lung, kidney and spleen and of the B-Raf inhibitor vemurafenib in mouse testis. In addition, we devised blood-CETSA and blood-TPP and applied it to measure target and off-target engagement of panobinostat and the BET family inhibitor JQ1 directly in whole blood. Blood-TPP analysis of panobinostat confirmed its binding to known targets and also revealed thermal stabilization of the zinc-finger transcription factor ZNF512. These methods will help to elucidate the mechanisms of drug action in vivo. The targets of small-molecule drugs are detected in tissue and blood using thermal proteome assays.

  监测药物与靶标的相互作用，采用如细胞热迁移测定（CETSA）等方法在简单细胞系统中已得到广泛应用，但在体内依然具有挑战性。在此我们介绍了一种组织热蛋白组分析（tissue-TPP），该方法通过定量质谱检测药物处理动物的组织样本中蛋白质热稳定性的变化，来测量小分子药物与组织中蛋白质的结合。我们报告了器官特异性、蛋白组范围的热稳定性图谱，并推导出非共价组蛋白去乙酰化酶抑制剂panobinostat在大鼠肝脏、肺、肾脏和脾脏中的靶标谱，以及B-Raf抑制剂vemurafenib在小鼠睾丸中的靶标谱。此外，我们设计了血液CETSA和血液TPP，并将其应用于直接在全血中测量panobinostat和BET家族抑制剂JQ1的靶标和非靶标结合。panobinostat的血液TPP分析确认了其与已知靶标的结合，还揭示了锌指转录因子ZNF512的热稳定性增强。这些方法将有助于阐明药物在体内的作用机制。小分子药物的靶标在组织和血液中通过热蛋白组测定被检测到。
• Deacetylase inhibitors
  申请人：——

  公开号：US20030018062A1

  公开（公告）日：2003-01-23

  The present invention provides hydroxamate compounds which are deacetylase inhibitors. The compounds are suitable for pharmaceutical compositions having anti-proliferative properties.

  本发明提供了羟肟酸酯化合物，这些化合物是脱乙酰酶抑制剂。这些化合物适用于具有抗增殖特性的药物组合物。
• 一种帕比司他关键中间体的合成方法
  申请人：南京众慧网络科技有限公司

  公开号：CN108101827A

  公开（公告）日：2018-06-01

  本发明属于药物合成领域，具体涉及一种帕比司他关键中间体的合成方法，所述关键中间体为(E)‑3‑[4‑[[[2‑(2‑甲基‑1H‑吲哚‑3‑基)乙基]氨基]甲基]苯基]丙烯酸甲酯盐酸盐，本发明方法收率可高达85％以上，且杂质极少，纯度99.5％以上，同时操作简便。
• PROCESS FOR MAKING N-HYDROXY-3-[4-[[[2-(2-METHYL-1H-INDOL-3-YL)ETHYL]AMINO]METHYL]PHENYL]-2E-2-PROPENAMIDE AND STARTING MATERIALS THEREFOR
  申请人：Acemoglu Murat

  公开号：US20090306405A1

  公开（公告）日：2009-12-10

  N-hydroxy-3-[4-[[[2-(2-methyl-1H-indol-3-yl)ethyl]amino]methyl]phenyl]-2E-2-propenamide and starting materials therefor are prepared by new synthetic methods.

  N-羟基-3-[4-[[[2-(2-甲基-1H-吲哚-3-基)乙基]氨基]甲基]苯基]-2E-2-丙烯酰胺及其起始原料是通过新的合成方法制备的。