(E)-3-(4-(((2-(2-methyl-1H-indol-3-yl)ethyl)amino)methyl)phenyl)acrylic acid | 960058-93-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吲哚及其衍生物
• 英文名称: (E)-3-(4-(((2-(2-methyl-1H-indol-3-yl)ethyl)amino)methyl)phenyl)acrylic acid
• 英文别名: (E)-3-[4-[[2-(2-methyl-1H-indol-3-yl)ethylamino]methyl]phenyl]prop-2-enoic acid
• CAS: 960058-93-9
• 化学式: C₂₁H₂₂N₂O₂
• 分子量: 334.418
• InChiKey: XVXVAVCOKYEXMZ-ZHACJKMWSA-N

物化性质

• 沸点：
  575.3±45.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.226±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.4
• 重原子数：
  25
• 可旋转键数：
  7
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.19
• 拓扑面积：
  65.1
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  3

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (E)-3-(4-(((2-(2-methyl-1H-indol-3-yl)ethyl)amino)methyl)phenyl)acrylic acid 在 羟胺 、 盐酸 作用下， 以 甲醇 、 水 为溶剂， 生成 帕比司他
  参考文献：
  名称：

  PROCESS FOR MAKING N-HYDROXY-3-[4-[[[2-(2-METHYL-1H-INDOL-3-YL)ETHYL]AMINO]METHYL]PHENYL]-2E-2-PROPENAMIDE AND STARTING MATERIALS THEREFOR

  摘要：

  N-羟基-3-[4-[[[2-(2-甲基-1H-吲哚-3-基)乙基]氨基]甲基]苯基]-2E-2-丙烯酰胺及其起始原料是通过新的合成方法制备的。

  公开号：

  US20090306405A1
• 作为产物：
  描述：

  1H-2-甲基-3-氨乙基吲哚 在 水 、 sodium cyanoborohydride 、 sodium hydroxide 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 二氯甲烷 为溶剂， 生成 (E)-3-(4-(((2-(2-methyl-1H-indol-3-yl)ethyl)amino)methyl)phenyl)acrylic acid
  参考文献：
  名称：

  A minimally-masked inactive prodrug of panobinostat that is bioorthogonally activated by gold chemistry

  摘要：

  DOI：

  10.1016/j.bmc.2021.116217

文献信息

• [EN] HISTONE DEACETYLASE INHIBITORS AND USES THEREOF<br/>[FR] INHIBITEURS D'HISTONE DÉSACÉTYLASE ET LEURS UTILISATIONS
  申请人：MUSC FOUND FOR RES DEV

  公开号：WO2018071740A1

  公开（公告）日：2018-04-19

  Provided herein are compounds of the formula (I) as well as pharmaceutically acceptable salts thereof, wherein the substituents are as those disclosed in the specification. These compounds, and the pharmaceutical compositions containing them, are useful for the treatment of cancer.

  本文提供了公式（I）的化合物以及其药学上可接受的盐，其中取代基如规范中所披露的那样。这些化合物及含有它们的药物组合物对于治疗癌症是有用的。
• Identifying drug targets in tissues and whole blood with thermal-shift profiling
  作者：Jessica Perrin、Thilo Werner、Nils Kurzawa、Anna Rutkowska、Dorothee D. Childs、Mathias Kalxdorf、Daniel Poeckel、Eugenia Stonehouse、Katrin Strohmer、Bianca Heller、Douglas W. Thomson、Jana Krause、Isabelle Becher、H. Christian Eberl、Johanna Vappiani、Daniel C. Sevin、Christina E. Rau、Holger Franken、Wolfgang Huber、Maria Faelth-Savitski、Mikhail M. Savitski、Marcus Bantscheff、Giovanna Bergamini

  DOI：10.1038/s41587-019-0388-4

  日期：2020.3

  Monitoring drug–target interactions with methods such as the cellular thermal-shift assay (CETSA) is well established for simple cell systems but remains challenging in vivo. Here we introduce tissue thermal proteome profiling (tissue-TPP), which measures binding of small-molecule drugs to proteins in tissue samples from drug-treated animals by detecting changes in protein thermal stability using quantitative mass spectrometry. We report organ-specific, proteome-wide thermal stability maps and derive target profiles of the non-covalent histone deacetylase inhibitor panobinostat in rat liver, lung, kidney and spleen and of the B-Raf inhibitor vemurafenib in mouse testis. In addition, we devised blood-CETSA and blood-TPP and applied it to measure target and off-target engagement of panobinostat and the BET family inhibitor JQ1 directly in whole blood. Blood-TPP analysis of panobinostat confirmed its binding to known targets and also revealed thermal stabilization of the zinc-finger transcription factor ZNF512. These methods will help to elucidate the mechanisms of drug action in vivo. The targets of small-molecule drugs are detected in tissue and blood using thermal proteome assays.

  监测药物与靶标的相互作用，采用如细胞热迁移测定（CETSA）等方法在简单细胞系统中已得到广泛应用，但在体内依然具有挑战性。在此我们介绍了一种组织热蛋白组分析（tissue-TPP），该方法通过定量质谱检测药物处理动物的组织样本中蛋白质热稳定性的变化，来测量小分子药物与组织中蛋白质的结合。我们报告了器官特异性、蛋白组范围的热稳定性图谱，并推导出非共价组蛋白去乙酰化酶抑制剂panobinostat在大鼠肝脏、肺、肾脏和脾脏中的靶标谱，以及B-Raf抑制剂vemurafenib在小鼠睾丸中的靶标谱。此外，我们设计了血液CETSA和血液TPP，并将其应用于直接在全血中测量panobinostat和BET家族抑制剂JQ1的靶标和非靶标结合。panobinostat的血液TPP分析确认了其与已知靶标的结合，还揭示了锌指转录因子ZNF512的热稳定性增强。这些方法将有助于阐明药物在体内的作用机制。小分子药物的靶标在组织和血液中通过热蛋白组测定被检测到。
• [EN] BIOORTHOGONAL COMPOUNDS COMPRISING A PROPARGYL GROUP FOR TREATING CANCER<br/>[FR] COMPOSÉS BIOORTHOGONAUX COMPRENANT UN GROUPE PROPARGYLE POUR LE TRAITEMENT DU CANCER
  申请人：UNIV COURT UNIV OF EDINBURGH

  公开号：WO2017199028A1

  公开（公告）日：2017-11-23

  A method of preparing an active agent or a salt thereof from a prodrug first compound (1) comprising a propargyl group connected to an oxygen that is directly or indirectly connected to the active agent is provided, wherein the bond between the propargyl group and the oxygen is cleaved by reacting the first compound with palladium or gold, thereby releasing the active agent. Prodrug compositions suitable for use in the method are also provided.

  提供一种从前体第一化合物（1）中制备活性剂或其盐的方法，该化合物包括与直接或间接连接到活性剂的氧原子相连接的丙炔基，其中通过将第一化合物与钯或金反应来断裂丙炔基和氧之间的键，从而释放活性剂。还提供了适用于该方法的前体药物组合物。
• [EN] NOVEL SALTS AND POLYMORPHIC FORMS OF PANOBINOSTAT<br/>[FR] NOUVEAUX SELS ET FORMES POLYMORPHES DE PANOBINOSTAT
  申请人：ALEMBIC PHARMACEUTICALS LTD

  公开号：WO2017221163A1

  公开（公告）日：2017-12-28

  The present invention provides novel crystalline polymorphic form of DL-lactate salt of Panobinostat of Formula-I. This invention also provides process for preparation of crystalline forms of Panobinostat DL-lactate. Further, the present invention relates to a novel pharmaceutically acceptable salts and solid forms of Panobinostat.

  本发明提供了一种DL-乳酸盐的新颖晶态多型形式，其化学式为I。本发明还提供了一种制备Panobinostat DL-乳酸晶体形式的方法。此外，本发明涉及一种新颖的药用可接受盐和固体形式的Panobinostat。
• [EN] PROCESS FOR THE PREPARATION OF 2-(E)-N-HYDROXY-3-[4-[[[2-(2-METHYL-1H-INDOL-3-YL) ETHYL]AMINO]METHYL]PHENYL]-2-PROPENAMIDE 2-HYDROXYPROPANOIC ACID (1:1) AND ITS POLYMORPHS THEREOF<br/>[FR] PROCÉDÉ DE PRÉPARATION DE L'ACIDE 2- (E)-N-HYDROXY-3-[4- [[ [2- (2-MÉTHYL -1 H-INDOL-3-YL) ÉTHYL] AMINO] MÉTHYL] PHÉNYL]-2-PROPÉNAMIDE 2-HYDROXYPROPANOÏQUE (1 : 1) ET SES POLYMORPHES
  申请人：MSN LABORATORIES PRIVATE LTD R&D CENTER

  公开号：WO2018092151A1

  公开（公告）日：2018-05-24

  The present invention relates to novel amorphous and crystalline forms of 2-(E)-N-hydroxy-3-[4-[[[2-(2-methyl-1H-indol-3-yl)ethyl]amino]methyl]phenyl]-2-propenamide and its lactate salt and also its process for the preparation thereof. (1a)

  本发明涉及2-(E)-N-羟基-3-[4-[[[2-(2-甲基-1H-吲哚-3-基)乙基]氨基]甲基]苯基]-2-丙烯酰胺的新型非晶态和结晶态形式，以及其乳酸盐，以及其制备方法。