(S)-2-((((9H-芴-9-基)甲氧基)羰基)氨基)-2-环丙基乙酸 | 1212257-18-5

• 物质功能分类: 生物 - 细胞培养 - 添加剂
• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 芴
• 中文名称: (S)-2-((((9H-芴-9-基)甲氧基)羰基)氨基)-2-环丙基乙酸
• 中文别名: 芴甲氧羰基-环丙基-L-甘氨酸；FMOC-L-环丙基甘氨酸
• 英文名称: (S)-2-((((9H-fluoren-9-yl)methoxy)carbonyl)amino)-2-cyclopropylacetic acid
• 英文别名: Fmoc-L-Cyclopropylglycine；(2S)-2-cyclopropyl-2-(9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonylamino)acetic acid
• CAS: 1212257-18-5
• 化学式: C₂₀H₁₉NO₄
• 分子量: 337.375
• InChiKey: YMLZBPTXRMNAFP-SFHVURJKSA-N

物化性质

• 沸点：
  577.1±33.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.332±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.4
• 重原子数：
  25
• 可旋转键数：
  6
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.3
• 拓扑面积：
  75.6
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  4

安全信息

• 海关编码：
  2924299090
• 危险性防范说明：
  P261,P305+P351+P338
• 危险性描述：
  H302,H315,H319,H335
• 储存条件：
  储存温度应控制在2-8℃，并需保持干燥、密封。

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (S)-2-((((9H-芴-9-基)甲氧基)羰基)氨基)-2-环丙基乙酸 在 N-甲基吗啉 、 吡啶 、 N-羟基-7-氮杂苯并三氮唑 、 三(2-氨基乙基)胺 、 二乙胺基三氟化硫 、 N-[(dimethylamino)-3-oxo-1H-1,2,3-triazolo[4,5-b]pyridin-1-yl-methylene]-N-methylmethanaminium hexafluorophosphate 作用下， 以 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 46.17h， 生成 methyl (2S,4R)-4-(2-((1R,3R)-1-acetoxy-3-((S)-2-cyclopropyl-N-methyl-2-((R)-1-methylpiperidine-2-carboxamido)acetamido)-4-methylpentyl)thiazole-4-carboxamido)-2-methyl-5-phenylpentanoate
  参考文献：
  名称：

  天然和设计的微管溶素的全合成和生物学评价

  摘要：

  描述了基于 CH 激活策略的 N(14)-去乙酰氧基微管溶素 H (Tb1) 的简化全合成和 pretubulysin D (PTb-D43) 的短全合成。还报告了所开发的合成策略和技术在合成一系列微管溶素类似物（Tb2-Tb41 和 PTb-D42）中的应用。针对一系列癌细胞的合成化合物的生物学评估揭示了许多新的类似物（例如，Tb14），其中一些对某些细胞系具有特殊的效力[例如，Tb32 对 MES SA（子宫肉瘤）细胞系的 IC50 = 12 pM和 2 pM 针对 HEK 293T（人胚胎肾）细胞系]，以及一组有价值的构效关系。

  DOI：

  10.1021/jacs.5b12557
• 作为产物：
  描述：

  氯甲酸-9-芴基甲酯 、 (S)-2-amino-2-cyclopropylacetic acid 在 sodium carbonate 作用下， 以 水 、 1,4-二氧六环 为溶剂， 反应 8.0h， 以84%的产率得到(S)-2-((((9H-芴-9-基)甲氧基)羰基)氨基)-2-环丙基乙酸
  参考文献：
  名称：

  天然和设计的微管溶素的全合成和生物学评价

  摘要：

  描述了基于 CH 激活策略的 N(14)-去乙酰氧基微管溶素 H (Tb1) 的简化全合成和 pretubulysin D (PTb-D43) 的短全合成。还报告了所开发的合成策略和技术在合成一系列微管溶素类似物（Tb2-Tb41 和 PTb-D42）中的应用。针对一系列癌细胞的合成化合物的生物学评估揭示了许多新的类似物（例如，Tb14），其中一些对某些细胞系具有特殊的效力[例如，Tb32 对 MES SA（子宫肉瘤）细胞系的 IC50 = 12 pM和 2 pM 针对 HEK 293T（人胚胎肾）细胞系]，以及一组有价值的构效关系。

  DOI：

  10.1021/jacs.5b12557

文献信息

• [EN] BENZIMIDAZOLE DERIVATIVES AS BROMODOMAIN INHIBITORS<br/>[FR] DÉRIVÉS DE BENZIMIDAZOLE COMME INHIBITEURS DES BROMODOMAINES
  申请人：GLAXOSMITHKLINE IP DEV LTD

  公开号：WO2016146738A1

  公开（公告）日：2016-09-22

  Compounds of formula (I) and salts thereof: wherein R1, R2, R3, R4 are defined herein. Compounds of formula (I) and salts thereof have been found to inhibit the binding of the BET family of bromodomain proteins to, for example, acetylated lysine residues and thus may have use in therapy, for example in the treatment of autoimmune and inflammatory diseases, such as rheumatoid arthritis; and cancers.

  式（I）的化合物及其盐：其中R1、R2、R3、R4在此处定义。已发现式（I）的化合物及其盐能够抑制BET家族的溴结构域蛋白与例如乙酰化赖氨酸残基的结合，因此可能在治疗中发挥作用，例如在治疗自身免疫和炎症性疾病（如类风湿性关节炎）和癌症方面。
• [EN] DESACETOXYTUBULYSIN H AND ANALOGS THEREOF<br/>[FR] DÉSACÉTOXYTUBULYSINE H ET SES ANALOGUES
  申请人：UNIV RICE WILLIAM M

  公开号：WO2016138288A1

  公开（公告）日：2016-09-01

  In one aspect, the present disclosure provides tubulysin analogs of the formula (I) wherein R1, R2, R3, R4, X1, X2, X3, and A1 are as defined herein. In another aspect, the present disclosure also provides methods of preparing the compounds disclosed herein. In another aspect, the present disclosure also provides pharmaceutical compositions and methods of use of the compounds disclosed herein.

  在一个方面，本公开提供了公式（I）的tubulysin类似物，其中R1、R2、R3、R4、X1、X2、X3和A1如本文所定义。在另一个方面，本公开还提供了制备本公开化合物的方法。在另一个方面，本公开还提供了药物组合物和使用本公开化合物的方法。
• Optimization of Ligands Using Focused DNA-Encoded Libraries To Develop a Selective, Cell-Permeable CBX8 Chromodomain Inhibitor
  作者：Sijie Wang、Kyle E. Denton、Kathryn F. Hobbs、Tyler Weaver、James M. B. McFarlane、Katelyn E. Connelly、Michael C. Gignac、Natalia Milosevich、Fraser Hof、Irina Paci、Catherine A. Musselman、Emily C. Dykhuizen、Casey J. Krusemark

  DOI：10.1021/acschembio.9b00654

  日期：2020.1.17

  obstacle in developing selective CBX ChD inhibitors. Here we report the selection of small, focused, DNA-encoded libraries (DELs) against multiple homologous ChDs to identify modifications to a parental ligand that confer both selectivity and potency for the ChD of CBX8. This on-DNA, medicinal chemistry approach enabled the development of SW2_110A, a selective, cell-permeable inhibitor of the CBX8 ChD. SW2_110A

  聚梳抑制复合物1（PRC1）对于在发育过程中介导基因表达至关重要。五个色盒（CBX）同源蛋白CBX2，CBX4，CBX6，CBX7和CBX8被整合到PRC1复合物中，它们通过N端染色体结构域（ChD）介导对组蛋白H3（H3K27me3）的三甲基赖氨酸27的靶向作用。个别的CBX旁系同源物已被认为是癌症的药物靶标。然而，CBX ChD之间序列和结构的高度相似性为开发选择性CBX ChD抑制剂提供了主要障碍。在这里，我们报告针对多个同源ChD的小型，集中，DNA编码文库（DEL）的选择，以鉴定对亲本配体的修饰，从而赋予CBX8 ChD选择性和效力。这种基于DNA的药物化学方法使SW2_110A（一种选择性的，CBX8 ChD的细胞可渗透抑制剂。SW2_110A以800 nM的Kd结合CBX8 ChD，在体外对CBX8 ChD的选择性是其他所有CBX同源物的5倍。SW2_110A特异性抑制细胞中
• Construction of Natural-Product-Like Cyclophane-Braced Peptide Macrocycles via sp³ C–H Arylation
  作者：Bo Li、Xinghua Li、Boyang Han、Zhijie Chen、Xuekai Zhang、Gang He、Gong Chen

  DOI：10.1021/jacs.9b04221

  日期：2019.6.12

  structures. Herein, we report a generally applicable method for synthesis of natural-product-like cyclophane-braced peptide macrocycles via Pd-catalyzed intramolecular C(sp3)-H arylation with aryl iodides at the remote γ position of various N-terminal aliphatic amino acid units using a simple picolinamide directing group. Products of high structural and stereochemical complexity were quickly assembled

  环肽为探索小分子和生物制剂之间的生物相关化学空间提供了最重要的平台之一。然而，与小分子的设计和合成相比，化学家对环肽三维结构和性质的微调能力远远落后。对环烷肽天然产物很感兴趣，我们想知道刚性、平面和疏水性环烷基序是否可以为合成具有良好 3D 结构的环肽提供新的设计元素。在此处，我们报告了一种普遍适用的合成天然产物样环芳支撑的肽大环化合物的方法，通过 Pd 催化的分子内 C(sp3)-H 芳基化，在各种 N 端脂肪族氨基酸单元的远程 γ 位置使用芳基碘进行芳基化，使用简单的吡啶酰胺导向基团。通过标准固相肽合成制备的易于获得的肽前体快速组装具有高度结构和立体化学复杂性的产品。许多这些肽大环化合物显示出高度有序的结构，正如 X 射线晶体学所揭示的那样。值得注意的是，带有各种游离极性侧链的未受保护肽底物的 PA 导向 C(sp3)-H 环化反应在水性介质中以高效率和选择性进行。
• Fungal Dioxygenase AsqJ Is Promiscuous and Bimodal: Substrate‐Directed Formation of Quinolones versus Quinazolinones
  作者：Manuel Einsiedler、Cooper S. Jamieson、Mark A. Maskeri、Kendall N. Houk、Tobias A. M. Gulder

  DOI：10.1002/anie.202017086

  日期：2021.4.6

  induces a skeletal rearrangement in viridicatin biosynthesis in Aspergillus nidulans, generating a quinolone scaffold from benzo[1,4]diazepine‐2,5‐dione substrates. We report that AsqJ catalyzes an additional, entirely different reaction, simply by a change in substituent in the benzodiazepinedione substrate. This new mechanism is established by substrate screening, application of functional probes, and

  先前的研究表明，Fe II /α-酮戊二酸依赖性双加氧酶AsqJ诱导构巢曲霉在viridicatin生物合成中的骨架重排，从苯并[1,4]二氮杂-2,5-二酮底物生成喹诺酮骨架。我们报告说，仅通过改变苯并二氮杂二酮底物中的取代基，AsqJ即可催化另外的，完全不同的反应。通过底物筛选，功能探针的应用和计算分析来建立这种新机制。AsqJ消费税H 2由合适的苯并[1,4]二氮杂-2-5,5-二酮底物的杂环结构生成CO，生成喹唑啉酮。这种新颖的AsqJ催化途径由复杂底物中的单个取代基控制。AsqJ的这种独特的底物定向反应性可实现喹诺酮或喹唑啉酮的靶向生物催化生成，喹诺酮或喹唑啉酮是两种具有特殊生物医学相关性的生物碱框架。