1,5-脱水-2-脱氧-2-(3,4-二氢-2,4-二氧代-1(2H)-嘧啶)-4,6-O-[(R)-苯基亚甲基]-D-阿卓糖醇 | 937031-51-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吡喃二恶英
• 中文名称: 1,5-脱水-2-脱氧-2-(3,4-二氢-2,4-二氧代-1(2H)-嘧啶)-4,6-O-[(R)-苯基亚甲基]-D-阿卓糖醇
• 英文名称: 1,5-anhydro-4,6-O-benzylidene-2-deoxy-2-(cytosin-1-yl)-D-altro-hexitol
• 英文别名: 1,5-anhydro-4,6-O-benzylidene-2-(cytosin-1-yl)-2-deoxy-D-altro-hexitol；4-Amino-1-((2R,4aR,7R,8S,8aS)-8-hydroxy-2-phenylhexahydropyrano[3,2-d][1,3]dioxin-7-yl)pyrimidin-2(1H)-one；1-[(2R,4aR,7R,8S,8aS)-8-hydroxy-2-phenyl-4,4a,6,7,8,8a-hexahydropyrano[3,2-d][1,3]dioxin-7-yl]-4-aminopyrimidin-2-one
• CAS: 937031-51-1
• 化学式: C₁₇H₁₉N₃O₅
• 分子量: 345.355
• InChiKey: WRNPUDZQHDYTNX-HUHANWACSA-N

物化性质

• 沸点：
  591.8±60.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.58±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.8
• 重原子数：
  25
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.41
• 拓扑面积：
  107
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1,5-脱水-2-脱氧-2-(3,4-二氢-2,4-二氧代-1(2H)-嘧啶)-4,6-O-[(R)-苯基亚甲基]-D-阿卓糖醇 在 2,4,6-三甲基吡啶 、 4-二甲氨基吡啶 、 silver nitrate 、 三氟乙酸 作用下， 以 吡啶 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 6.5h， 生成 1,5-anhydro-3-O-benzoyl-6-O-monomethoxytrityl-2-deoxy-2-(N⁴-benzoylcytosin-1-yl)-D-altro-hexitol
  参考文献：
  名称：

  受保护的D-麦芽糖醇核苷的合成作为寡核苷酸合成的基础

  摘要：

  与腺嘌呤和尿嘧啶碱基部分d-阿卓糖醇核苷由1,5-环氧化物环的亲核开得到：2,3-二脱水-4,6- ø -亚苄基- d-蒜糖醇使用上述提到的钠盐基地。将2-三甲基甲硅烷基乙基保护基用于鸟嘌呤碱基的O 6-官能团在鸟嘌呤碱基的稳定性和N 9-位置可接受的烷基化产率之间提供了有用的折衷方案。从尿嘧啶同源物开始合成胞嘧啶核苷。3'-羟基官能团被苯甲酰基保护。

  DOI：

  10.1016/s0040-4020(99)00287-2
• 作为产物：
  描述：

  1,5-脱水-2-脱氧-2-(3,4-二氢-2,4-二氧代-1(2H)-嘧啶基)-4,6-O-[(R)-苯基亚甲基]-D-阿卓糖醇 在 1H-1,2,4-三唑 、 4-二甲氨基吡啶 、 ammonium hydroxide 、 三乙胺 、 三氯氧磷 作用下， 以 吡啶 为溶剂， 反应 5.0h， 生成 1,5-脱水-2-脱氧-2-(3,4-二氢-2,4-二氧代-1(2H)-嘧啶)-4,6-O-[(R)-苯基亚甲基]-D-阿卓糖醇
  参考文献：
  名称：

  受保护的D-麦芽糖醇核苷的合成作为寡核苷酸合成的基础

  摘要：

  与腺嘌呤和尿嘧啶碱基部分d-阿卓糖醇核苷由1,5-环氧化物环的亲核开得到：2,3-二脱水-4,6- ø -亚苄基- d-蒜糖醇使用上述提到的钠盐基地。将2-三甲基甲硅烷基乙基保护基用于鸟嘌呤碱基的O 6-官能团在鸟嘌呤碱基的稳定性和N 9-位置可接受的烷基化产率之间提供了有用的折衷方案。从尿嘧啶同源物开始合成胞嘧啶核苷。3'-羟基官能团被苯甲酰基保护。

  DOI：

  10.1016/s0040-4020(99)00287-2

文献信息

• Synthesis of protected D-altritol nucleosides as building blocks for oligonucleotide synthesis
  作者：Brigitte Allart、Roger Busson、Jef Rozenski、Arthur Van Aerschot、Piet Herdewijn

  DOI：10.1016/s0040-4020(99)00287-2

  日期：1999.5

  D-Altritol nucleosides with an adenine and uracil base moiety were obtained by nucleophilic opening of the epoxide ring of 1,5:2,3-dianhydro-4,6-O-benzylidene-D-allitol using the sodium salt of the above mentioned bases. The use of a 2-trimethylsilylethyl protecting group for the O6-function of the guanine base offers a useful compromise between stability and acceptable alkylation yields of the N9-position

  与腺嘌呤和尿嘧啶碱基部分d-阿卓糖醇核苷由1,5-环氧化物环的亲核开得到：2,3-二脱水-4,6- ø -亚苄基- d-蒜糖醇使用上述提到的钠盐基地。将2-三甲基甲硅烷基乙基保护基用于鸟嘌呤碱基的O 6-官能团在鸟嘌呤碱基的稳定性和N 9-位置可接受的烷基化产率之间提供了有用的折衷方案。从尿嘧啶同源物开始合成胞嘧啶核苷。3'-羟基官能团被苯甲酰基保护。
• Fmoc-Protected Altritol Phosphoramidite Building Blocks and Their Application in the Synthesis of Altritol Nucleic Acids (ANAs)
  作者：Mikhail Abramov、Guy Schepers、Arthur Van Aerschot、Piet Herdewijn

  DOI：10.1002/ejoc.200600868

  日期：2007.3

  Fmoc-protected altritol nucleoside phosphoramidite building blocks with adenine, guanine, thymine, uracil, cytosine and 5-methylcytosine as bases have been synthesized. These building blocks were used for the synthesis of altritol nucleic acid (ANA) and chimeric ANA-RNA oligonucleotides. Whilst the yields of oligonucleotides were lower than those obtained with 3′-O-benzoyl-protected altritol building

  已经合成了以腺嘌呤、鸟嘌呤、胸腺嘧啶、尿嘧啶、胞嘧啶和 5-甲基胞嘧啶为碱基的 Fmoc 保护的阿曲糖醇核苷亚磷酰胺结构单元。这些构件用于合成阿曲糖醇核酸 (ANA) 和嵌合 ANA-RNA 寡核苷酸。虽然寡核苷酸的产率低于使用 3'-O-苯甲酰基保护的 atriitol 构建块获得的产率，但与 Pac-RNA 化学在嵌合寡核苷酸合成方面的出色兼容性使 Fmoc 成为了用于仲醇功能的有价值的保护基团用于寡核苷酸合成的核苷糖部分。（© Wiley-VCH Verlag GmbH & Co. KGaA, 69451 Weinheim, Germany, 2007）