(+)-carbocyclic thymidine | 114884-15-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 核苷和核苷酸类似物
• 英文名称: (+)-carbocyclic thymidine
• 英文别名: 1-[(1R,3S,4R)-3-hydroxy-4-(hydroxymethyl)cyclopentyl]-5-methylpyrimidine-2,4-dione
• CAS: 114884-15-0
• 化学式: C₁₁H₁₆N₂O₄
• 分子量: 240.259
• InChiKey: ZOZRLTAJWLEGLG-HLTSFMKQSA-N

物化性质

• 熔点：
  168-169 °C
• 密度：
  1.367±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.4
• 重原子数：
  17
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.64
• 拓扑面积：
  89.9
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (+)-carbocyclic thymidine 在 吡啶 作用下， 以 吡啶 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 15.0h， 生成 6'-carba-2'-deoxy-3'-O-phenoxythiocarbonyl-5'-O-tritylthymidine
  参考文献：
  名称：

  碳环 3'-叠氮胸苷 (AZT) 类似物及其环磷酸三酯的合成和抗病毒评估

  摘要：

  合成了抗 HIV 双脱氧核苷 3'-叠氮基-3'-脱氧胸苷 AZT (1) 的碳环类似物。从对映体纯碳环 2'-脱氧胸苷 2 开始，制备了四种不同的碳环 AZT 类似物 2,4-6。此外，核苷类似物被转化为它们的膜渗透性环磷酸三酯。所有化合物都在体外测试了它们在人 T 淋巴细胞中的抗 HIV 活性 (CEM/0)。(© Wiley-VCH Verlag GmbH & Co. KGaA, 69451 Weinheim, Germany, 2006)

  DOI：

  10.1002/ejoc.200500719
• 作为产物：
  描述：

  (1R,3S,4R)-3-苄氧基-4-苄氧基甲基环戊烷-1-醇 在 sodium hydroxide 、 偶氮二甲酸二异丙酯 、 三氯化硼 、 三苯基膦 作用下， 以 甲醇 、 乙醚 、 二氯甲烷 、 乙腈 为溶剂， 反应 21.0h， 生成 (+)-carbocyclic thymidine
  参考文献：
  名称：

  New Convergent Synthesis of Carbocyclic Nucleoside Analogues

  摘要：

  将描述两种趋同的方法用于合成碳环核苷类似物。这两种方法均以从烷基化环戊二烯中选择性制备的立体化学纯环戊醇8为起点。通过这些方法，已合成出dT、FdU和BVdU的碳环类似物。此外，还将展示一种例子中转化为环Sal-前核苷酸及相应核苷酸的过程。

  DOI：

  10.1055/s-2003-41455

文献信息

• Influence of theN3-Protection Group onN1- vs.O2-Alkylation in the Mitsunobu Reaction
  作者：Olaf R. Ludek、Chris Meier

  DOI：10.1002/ejoc.200500801

  日期：2006.2

  The influence of the N3-protection group of thymine on the regioselectivity of the N1- vs. O2-alkylation under Mitsunobu conditions is described. A series of N3-protected thymine derivatives 8a–f was prepared and coupled to cyclopentanol as model compound for carbocyclic nucleoside precursors. Finally, the N3-BOM group was selected to improve our previously reported synthetic strategy to carbocyclic

  描述了在 Mitsunobu 条件下胸腺嘧啶的 N3-保护基团对 N1-与 O2-烷基化的区域选择性的影响。制备了一系列 N3 保护的胸腺嘧啶衍生物 8a-f，并与环戊醇偶联作为碳环核苷前体的模型化合物。最后，选择 N3-BOM 组来改进我们之前报道的碳环胸苷 (carba-dT) 合成策略。此外，2,6-二甲基-Bz 基团专门导致了carba-dT 的O2-类似物。(© Wiley-VCH Verlag GmbH & Co. KGaA, 69451 Weinheim, Germany, 2006)
• Membrane-permeable Triphosphate Prodrugs of Nucleoside Analogues
  作者：Tristan Gollnest、Thiago Dinis de Oliveira、Anna Rath、Ilona Hauber、Dominique Schols、Jan Balzarini、Chris Meier

  DOI：10.1002/anie.201511808

  日期：2016.4.18

  approved, as well as potentially antivirally active, nucleoside analogues was synthesized. The enzyme‐triggered delivery of NTPs was demonstrated by pig liver esterase, in human T‐lymphocyte cell extracts and by a polymerase chain reaction using a prodrug of thymidine triphosphate. The TriPPPro‐compounds of some HIV‐inactive nucleoside analogues showed marked anti‐HIV activity. For cellular uptake

  核苷类似物代谢转化为三磷酸酯的过程常常进行得不充分。速率限制可以在单磷酸化步骤中进行，也可以在二磷酸化和三磷酸化步骤中进行。我们开发了核苷三磷酸（NTP）递送系统（Tri PPP方法）。通过这种方法，NTP被γ-磷酸盐处的两个生物可逆单元掩盖。使用涉及H-膦酸酯化学的方法，合成了一系列带有批准的以及可能具有抗病毒活性的核苷类似物的衍生物。猪肝酯酶，人T淋巴细胞提取物中的酶触发的NTPs传递以及使用三磷酸胸苷的前药的聚合酶链式反应证明了这一点。三重PPP一些对HIV无活性的核苷类似物的ro-化合物显示出显着的抗HIV活性。为了进行细胞摄取研究，制备了荧光Tri PPP ro-化合物，该化合物将三磷酸化的代谢物递送至完整的CEM细胞。
• Stereoselective Synthesis of<scp>D</scp>- and<scp>L</scp>-Carbocyclic Nucleosides by Enzymatically Catalyzed Kinetic Resolution
  作者：Miriam Mahler、Bastian Reichardt、Philip Hartjen、Jan van Lunzen、Chris Meier

  DOI：10.1002/chem.201200733

  日期：2012.8.27

  the starting materials for the syntheses of carbocyclic D‐ and L‐nucleoside analogues were readily accessible. 3′,4′‐Unsaturated D‐ or L‐carbocyclic nucleosides were obtained from the condensation of various nucleobases with (S)‐ or (R)‐cyclopentenol. Functionalization of the double bond in 3′‐deoxy‐3′,4′‐didehydro‐carba‐D‐thymidine led to a variety of new nucleoside analogues. By using the cycloSal

  通过应用酶催化动力学拆分方法开发了（S）-或（R）-3-（苄氧基甲基）环戊-3-烯醇的有效合成方法。该方法允许合成具有高光学纯度（> 98％ee）的对映体结构单元（S）-和（R）-环戊烯醇。与以前的方法相比，此方法的主要优势在于，可在仅包含一个立体生成中心的对映异构体水平上进行拆分。由于该特征，可以将对映异构体彼此化学转化。通过这种途径，合成碳环D-和L的原料核苷类似物很容易获得。3'，4'-不饱和D-或L-碳环核苷是通过各种核碱基与（S）-或（R）-环戊烯醇的缩合获得的。3'-脱氧-3'，4'-二氢-卡巴-D-胸苷中双键的功能化导致了许多新的核苷类似物。通过使用环Sal方法，可以轻松获得其相应的磷酸化代谢产物。此外，碳环2'-脱氧核苷组成的新的合成路线被开发，从而导致d -和大号-卡巴-dT。d -卡巴-dT是为测试抗病毒活性对多药耐药的HIV-1菌株和E2-2相对于已知的抗病毒剂的d4T，以及大号-卡巴-dT。虽然发现L
• An Efficient Total Synthesis of Carbocyclic 2?-Deoxyribonucleosides
  作者：Hanspeter Lang、Heinz E. Moser

  DOI：10.1002/hlca.19940770608

  日期：1994.9.21

  purine and pyrimidine bases with the cyclopentane moiety via the cyclic sulfate (+)-19. This total synthesis of enantiomerically pure and racemic carbocyclic 2′-deoxyribonucleosides 1 represents one of the most efficient approaches reported to date. Starting from cyclopentadiene, the four carbocycles corresponding to the naturally occurring 2′-deoxyribonucleosides could be prepared in 12 steps and

  本工作描述了一种新的高效方法，用于制备外消旋或对映体纯的碳环2'-脱氧核糖核苷1。关键步骤是外消旋碳环2'-脱氧核糖核心（±）-12的有效组装，酶促拆分以及通过环硫酸盐（+）- 19将嘌呤和嘧啶碱基与环戊烷部分共价连接的新方法。对映体纯的和外消旋的碳环2'-脱氧核糖核苷1的总合成代表了迄今为止报道的最有效的方法之一。从环戊二烯开始，对应于天然存在的2'-脱氧核糖核苷的四个碳环可以十二个步骤制备，总产率为9-12％。对于相应的外消旋化合物，使用了10个步骤，总收率在22％至30％之间。
• 2-Azabicyclo[2.2.1]hept-5-en-3-one epoxide: A versatile intermediate for the synthesis of cyclopentyl carbocyclic 2-deoxy-, 3-deoxy- &amp; ara- ribonucleoside analogues
  作者：Belén M Domínguez、Paul M Cullis

  DOI：10.1016/s0040-4039(99)01113-2

  日期：1999.7

  5,6-Epoxy-exo-2-azabicyclo[2.2.1]heptan-3-one has been used as a versatile intermediate in the synthesis of 2-deoxy-, 3-deoxy- and ara- cyclopentyl carbocyclic nucleosides. An efficient, short synthesis of the (+) carbocyclic thymidine 13 is reported.

  5，6-环氧-外-2--2-氮杂双环[2.2.1]庚-3-已被用作合成2-脱氧，3-脱氧和芳基-环戊基碳环核苷的通用中间体。报道了（+）碳环胸苷13的有效的，短的合成。