Boc-(S)-β-Caa-OH | 1093295-41-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: Boc-(S)-β-Caa-OH
• 英文别名: (3S)-3-[(3aS,4S,6R,6aS)-4-methoxy-2,2-dimethyl-3a,4,6,6a-tetrahydrofuro[3,4-d][1,3]dioxol-6-yl]-3-[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonylamino]propanoic acid
• CAS: 1093295-41-0
• 化学式: C₁₆H₂₇NO₈
• 分子量: 361.392
• InChiKey: DZSQDLRZIKHFOG-YIQGNQSOSA-N

物化性质

• 沸点：
  489.4±45.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.25±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.5
• 重原子数：
  25
• 可旋转键数：
  7
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.88
• 拓扑面积：
  113
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  Boc-(S)-β-Caa-OH 在 1-羟基苯并三唑 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 18.25h， 生成 methyl 3-[[(3S)-3-[(3aS,4S,6R,6aS)-4-methoxy-2,2-dimethyl-3a,4,6,6a-tetrahydrofuro[3,4-d][1,3]dioxol-6-yl]-3-[3-[[(3S)-3-[(3aS,4S,6R,6aS)-4-methoxy-2,2-dimethyl-3a,4,6,6a-tetrahydrofuro[3,4-d][1,3]dioxol-6-yl]-3-[3-[[(3S)-3-[(3aS,4S,6R,6aS)-4-methoxy-2,2-dimethyl-3a,4,6,6a-tetrahydrofuro[3,4-d][1,3]dioxol-6-yl]-3-[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonylamino]propanoyl]amino]propanoylamino]propanoyl]amino]propanoylamino]propanoyl]amino]propanoate
  参考文献：
  名称：

  左旋10/12螺旋在混合β肽中的溶剂定向转换为右旋12/10螺旋

  摘要：

  本研究描述了具有d - lyxo呋喃糖苷侧链和β-hGly的1：1交替的C-连接的碳-β-氨基酸[β-Caa （l） ]的β肽的合成和构象分析。对在N端带有（S）-β-Caa （1）单体的肽进行的NMR和CD研究显示，右旋10/12混合螺旋。当序列以β-hGly残基而不是（S）-β-Caa （l）开头时，观察到了前所未有的溶剂导向的“切换”，无论是螺旋形式还是惯用性组分。在氯仿中对这些肽的NMR研究表明左旋10/12螺旋，而甲醇中的CD光谱则推断出右旋二级结构。这些肽在CD 3 OH中的NMR数据表明存在右手12/10螺旋。乙腈中的NMR研究表明两种螺旋类型共存。量子化学研究预测两种螺旋类型之间的能量差为0.3 kcal / mol，这可能解释了溶剂影响的可能性。迄今为止，H键键合模式和折叠螺旋的旋性都由溶剂控制的开关的例子很少。在具有（R）-β-Caa （l）的相应肽中未发现可比的溶剂作用

  DOI：

  10.1021/acs.joc.6b02856
• 作为产物：
  描述：

  Boc-(S)-β-Caa-OMe 在 水 、 lithium hydroxide 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 为溶剂， 反应 1.0h， 以95%的产率得到Boc-(S)-β-Caa-OH
  参考文献：
  名称：

  左旋10/12螺旋在混合β肽中的溶剂定向转换为右旋12/10螺旋

  摘要：

  本研究描述了具有d - lyxo呋喃糖苷侧链和β-hGly的1：1交替的C-连接的碳-β-氨基酸[β-Caa （l） ]的β肽的合成和构象分析。对在N端带有（S）-β-Caa （1）单体的肽进行的NMR和CD研究显示，右旋10/12混合螺旋。当序列以β-hGly残基而不是（S）-β-Caa （l）开头时，观察到了前所未有的溶剂导向的“切换”，无论是螺旋形式还是惯用性组分。在氯仿中对这些肽的NMR研究表明左旋10/12螺旋，而甲醇中的CD光谱则推断出右旋二级结构。这些肽在CD 3 OH中的NMR数据表明存在右手12/10螺旋。乙腈中的NMR研究表明两种螺旋类型共存。量子化学研究预测两种螺旋类型之间的能量差为0.3 kcal / mol，这可能解释了溶剂影响的可能性。迄今为止，H键键合模式和折叠螺旋的旋性都由溶剂控制的开关的例子很少。在具有（R）-β-Caa （l）的相应肽中未发现可比的溶剂作用

  DOI：

  10.1021/acs.joc.6b02856

文献信息

• Synthesis and conformational studies of peptides from new C-linked carbo-β-amino acids (β-Caas) with anomeric methylamino- and difluorophenyl moieties
  作者：Gangavaram V. M. Sharma、Velaparthi Subash、Nelli Yella Reddy、Kongari Narsimulu、Rapolu Ravi、Vivekanand B. Jadhav、Upadhyayula S. N. Murthy、Kankipati Hara Kishore、Ajit C. Kunwar

  DOI：10.1039/b810817j

  日期：——

  New C-linked carbo-β-amino acids (β-Caas), Cbz-(S)-β-Caa-(NHBoc)-OMe (1) and Cbz-(R)-β-Caa-(NHBoc)-OMe (2), with an additional amine group (methylamino group of NHBoc) at the C-1 position of the lyxofuranoside side chain and Boc-(S)-β-Caa-(diFP)-OMe (3) and Boc-(R)-β-Caa-(diFP)-OMe (4), with a C-difluorophenyl (diFP) moiety at the anomeric position of the lyxofuranoside side chain were prepared from D-mannose. β-Peptides [tetra- and hexapeptides] were synthesized from these β-Caas, ‘epimeric’ [at the amine stereocentre (Cβ)], using the concept of ‘alternating chirality’ to carry out their conformational studies [NMR (CDCl3), CD and MD]. In the monomer design, it was envisaged that the presence of an additional amine group in 1 or 2 would help in solubilizing the peptides in water, while, the C-difluorophenyl (diFP) moiety of 3 and 4 is expected to enhance the biological activity. The peptides having 1 and 2, though could not retain their 12–10-mixed helices in water, have shown moderate activity against Gram positive and Gram negative bacterial strains. The peptides prepared from 3 and 4, much against our expectations, did not display any biological activity.

  新的 C 连接碳-β-氨基酸 (β-Caas)、Cbz-(S)-β-Caa-(NHBoc)-OMe (1) 和 Cbz-(R)-β-Caa-(NHBoc)-OMe (2)，在 lyxofuranoside 侧链的 C-1 位置上有一个额外的胺基团（NHBoc 的甲基氨基）和 Boc-(S)-β-Caa-(diFP)-OMe (3) 和 Boc-(R )-β-Caa-(diFP)-OMe (4)，在lyxofuranoside 侧链的异头位置具有C-二氟苯基(diFP) 部分，由D-甘露糖制备。 β-肽[四肽和六肽]是从这些β-Caas、“差向异构体”[在胺立构中心(Cβ)]合成的，使用“交替手性”的概念来进行构象研究[NMR (CDCl3)、CD 和 MD]。在单体设计中，预计1或2中额外胺基的存在将有助于将肽溶解在水中，而3和4中的C-二氟苯基（diFP）部分预计将增强生物活性。具有1和2的肽虽然不能在水中保留其12-10混合螺旋，但已显示出针对革兰氏阳性和革兰氏阴性细菌菌株的中等活性。由3和4制备的肽，与我们的预期非常不同，没有表现出任何生物活性。
• Design and Synthesis of Peptides with Hybrid Helix-Turn-Helix (HTH) Motif and Their Conformational Study
  作者：Gangavaram V. M. Sharma、Prashanth Thodupunuri、Katukuri Sirisha、Shaik Jeelani Basha、Pottireddygari Gurava Reddy、Akella V. S. Sarma

  DOI：10.1021/jo501267k

  日期：2014.9.19

  study is aimed at the design and synthesis of peptides with hybrid helix-turn-helix (HTH) motif and their conformational analysis (NMR, MD, and CD studies). The requisite peptides with heterogeneous backbones were prepared from β-, γ-, and δ-amino acids with carbohydrate side chains and α-amino acid, l-Ala. The α/β-peptides were prepared from (S)-β-Caa(l) (C-linked carbo-β-amino acid with D-lyxo furanoside

  本研究旨在设计和合成具有杂螺旋-转-螺旋（HTH）基序的肽及其构象分析（NMR，MD和CD研究）。具有异质主链的必需肽是由具有碳水化合物侧链的β-，γ-和δ-氨基酸和α-氨基酸1 - Ala制备的。由（S）-β-Caa （l）（带有D- lyxo呋喃糖苷侧链的C联碳-β-氨基酸）和l制备α/β肽-丙氨酸与1：1交替。具有“螺旋转角”基序的α/β肽显示出11/9螺旋成核的13原子H键转角。α/β-八肽显示出具有分叉的11 / 15-H键合转弯的HTH结构。此外，具有HT基序的α/β-六肽，独立于在C端与γ/α/γ/α-和δ/α/δ/α-四肽偶联时，可访问具有“杂交HTH”基序的十肽。十肽（“ α–β–α–β–α–β–γ–α–γ–α”）显示杂合HTH与“ 11/9/11/9/11/16/9/12/10” H键，而十肽（“ α–β–α–β–α–β–δ–α–δ-α”）显示存在“ 11/9/11/9/11/17/9/13
• Solvent-Directed Switch of a Left-Handed 10/12-Helix into a Right-Handed 12/10-Helix in Mixed β-Peptides
  作者：Prashanth Thodupunuri、Sirisha Katukuri、Kallaganti V. S. Ramakrishna、Gangavaram V. M. Sharma、Ajit C. Kunwar、Akella V. S. Sarma、Hans-Jörg Hofmann

  DOI：10.1021/acs.joc.6b02856

  日期：2017.2.17

  Present study describes the synthesis and conformational analysis of β-peptides from C-linked carbo-β-amino acids [β-Caa(l)] with a d-lyxo furanoside side chain and β-hGly in 1:1 alternation. NMR and CD investigations on peptides with an (S)-β-Caa(l) monomer at the N-terminus revealed a right-handed 10/12-mixed helix. An unprecedented solvent-directed “switch” both in helical pattern and handedness

  本研究描述了具有d - lyxo呋喃糖苷侧链和β-hGly的1：1交替的C-连接的碳-β-氨基酸[β-Caa （l） ]的β肽的合成和构象分析。对在N端带有（S）-β-Caa （1）单体的肽进行的NMR和CD研究显示，右旋10/12混合螺旋。当序列以β-hGly残基而不是（S）-β-Caa （l）开头时，观察到了前所未有的溶剂导向的“切换”，无论是螺旋形式还是惯用性组分。在氯仿中对这些肽的NMR研究表明左旋10/12螺旋，而甲醇中的CD光谱则推断出右旋二级结构。这些肽在CD 3 OH中的NMR数据表明存在右手12/10螺旋。乙腈中的NMR研究表明两种螺旋类型共存。量子化学研究预测两种螺旋类型之间的能量差为0.3 kcal / mol，这可能解释了溶剂影响的可能性。迄今为止，H键键合模式和折叠螺旋的旋性都由溶剂控制的开关的例子很少。在具有（R）-β-Caa （l）的相应肽中未发现可比的溶剂作用