tert-butyl (S)-(1-(cyclopentylamino)-3-(1H-indol-3-yl)-1-oxopropan-2-yl)carbamate | 200864-56-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吲哚及其衍生物
• 英文名称: tert-butyl (S)-(1-(cyclopentylamino)-3-(1H-indol-3-yl)-1-oxopropan-2-yl)carbamate
• 英文别名: tert-butyl N-[(2S)-1-(cyclopentylamino)-3-(1H-indol-3-yl)-1-oxopropan-2-yl]carbamate
• CAS: 200864-56-8
• 化学式: C₂₁H₂₉N₃O₃
• 分子量: 371.48
• InChiKey: FETDXAJKGBSVNW-SFHVURJKSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.5
• 重原子数：
  27
• 可旋转键数：
  7
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.52
• 拓扑面积：
  83.2
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  3

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  tert-butyl (S)-(1-(cyclopentylamino)-3-(1H-indol-3-yl)-1-oxopropan-2-yl)carbamate 在 三异丙基硅烷 、 palladium 10% on activated carbon 、 氢气 、 1-羟基苯并三唑 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 甲醇 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 1.83h， 生成 tert-butyl 3-(3-((S)-6-(((S)-1-(cyclopentylamino)-3-(1H-indol-3-yl)-1-oxopropan-2-yl)amino)-5-((3-fluorophenyl)sulfonamido)-6-oxohexyl)thioureido)propanoate
  参考文献：
  名称：

  基于机制的人类Sirtuin 5脱酰基酶的抑制剂：结构与活性的关系，生物结构和动力学的见解。

  摘要：

  sirtuin酶在各种生化环境中是重要的调节性去酰基化酶，因此可能通过小分子的激活或抑制而成为潜在的治疗靶标。在这里，我们描述了迄今为止报道的最有效的sirtuin 5（SIRT5）抑制剂的发现。通过解决与人类和斑马鱼SIRT5复杂的选定抑制剂的共晶体结构，我们提供了结合模式的合理化方法，这为进一步优化具有更多“类药物”性质的抑制剂提供了见识。重要的是，酶动力学评估显示出缓慢，紧密的抑制机制，这对于SIRT5而言是前所未有的。当将抑制剂应用于生物学探测机制时，这是重要的信息。

  DOI：

  10.1002/anie.201709050
• 作为产物：
  描述：

  N-叔丁氧羰基-L-色氨酸 、 环戊胺 在 1-羟基苯并三唑 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 以99%的产率得到tert-butyl (S)-(1-(cyclopentylamino)-3-(1H-indol-3-yl)-1-oxopropan-2-yl)carbamate
  参考文献：
  名称：

  基于机制的人类Sirtuin 5脱酰基酶的抑制剂：结构与活性的关系，生物结构和动力学的见解。

  摘要：

  sirtuin酶在各种生化环境中是重要的调节性去酰基化酶，因此可能通过小分子的激活或抑制而成为潜在的治疗靶标。在这里，我们描述了迄今为止报道的最有效的sirtuin 5（SIRT5）抑制剂的发现。通过解决与人类和斑马鱼SIRT5复杂的选定抑制剂的共晶体结构，我们提供了结合模式的合理化方法，这为进一步优化具有更多“类药物”性质的抑制剂提供了见识。重要的是，酶动力学评估显示出缓慢，紧密的抑制机制，这对于SIRT5而言是前所未有的。当将抑制剂应用于生物学探测机制时，这是重要的信息。

  DOI：

  10.1002/anie.201709050

文献信息

• Matrix Metalloproteinase Inhibitors:  A Structure−Activity Study
  作者：Daniel E. Levy、France Lapierre、Weisheng Liang、Wenqing Ye、Christopher W. Lange、Xiaoyuan Li、Damian Grobelny、Marie Casabonne、David Tyrrell、Kevin Holme、Alex Nadzan、Richard E. Galardy

  DOI：10.1021/jm970494j

  日期：1998.1.1

  Modifications around the dipeptide-mimetic core of a hydroxamic acid based matrix metalloproteinase inhibitor were studied. These variations incorporated a variety of natural, unnatural, and synthetic amino acids in addition to modifications of the P1' and P3' substituents. The results of this study indicate the following structural requirements: (1) Two key hydrogen bonds must be present between the enzyme and potent substrates. (2) Potent inhibitors must possess strong zinc-binding functionalities. (3) The potential importance of the hydrophobic group at position R3 as illustrated by its ability to impart greater relative potency against stromelysin when larger hydrophobic groups are used. (4) Requirements surrounding the nature of the amino acid appear to be more restrictive for stromelysin than for neutrophil collagenase, 72 kDa gelatinase, and 92 kDa gelatinase. These requirements may involve planar fused-ring aryl systems and possibly hydrogen-bonding capabilities.
• Mechanism-Based Inhibitors of the Human Sirtuin 5 Deacylase: Structure-Activity Relationship, Biostructural, and Kinetic Insight
  作者：Nima Rajabi、Marina Auth、Kathrin R. Troelsen、Martin Pannek、Dhaval P. Bhatt、Martin Fontenas、Matthew D. Hirschey、Clemens Steegborn、Andreas S. Madsen、Christian A. Olsen

  DOI：10.1002/anie.201709050

  日期：2017.11.20

  The sirtuin enzymes are important regulatory deacylases in a variety of biochemical contexts and may therefore be potential therapeutic targets through either activation or inhibition by small molecules. Here, we describe the discovery of the most potent inhibitor of sirtuin 5 (SIRT5) reported to date. We provide rationalization of the mode of binding by solving co‐crystal structures of selected inhibitors

  sirtuin酶在各种生化环境中是重要的调节性去酰基化酶，因此可能通过小分子的激活或抑制而成为潜在的治疗靶标。在这里，我们描述了迄今为止报道的最有效的sirtuin 5（SIRT5）抑制剂的发现。通过解决与人类和斑马鱼SIRT5复杂的选定抑制剂的共晶体结构，我们提供了结合模式的合理化方法，这为进一步优化具有更多“类药物”性质的抑制剂提供了见识。重要的是，酶动力学评估显示出缓慢，紧密的抑制机制，这对于SIRT5而言是前所未有的。当将抑制剂应用于生物学探测机制时，这是重要的信息。