6-(3,4-dihydro-4-oxopyrimidin-2-ylthio)hexanoic acid | 912956-72-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 脂质和类脂质分子 - 脂肪酰基
• 英文名称: 6-(3,4-dihydro-4-oxopyrimidin-2-ylthio)hexanoic acid
• 英文别名: 6-[(6-oxo-1H-pyrimidin-2-yl)sulfanyl]hexanoic acid
• CAS: 912956-72-0
• 化学式: C₁₀H₁₄N₂O₃S
• 分子量: 242.299
• InChiKey: AIRZQNHMNRPSGN-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.8
• 重原子数：
  16
• 可旋转键数：
  7
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.5
• 拓扑面积：
  104
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  6-(3,4-dihydro-4-oxopyrimidin-2-ylthio)hexanoic acid 在 氯甲酸乙酯 、 三乙胺 、 O-(2-甲氧基异丙基)羟胺 、 amberlyst-15 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 为溶剂， 反应 2.17h， 以52%的产率得到N-hydroxy-6-(3,4-dihydro-4-oxopyrimidin-2-ylthio)hexanamide
  参考文献：
  名称：

  新型，含尿嘧啶的组蛋白脱乙酰基酶抑制剂的合成和生物学性质。

  摘要：

  测试了一系列新的化合物，其中包含尿嘧啶部分作为苯基/苯基烷基部分与N-羟基-聚亚甲基铝酰胺或-亚甲基肉桂酰胺基之间的连接单元（基于尿嘧啶的异羟肟酸，UBHA）对玉米组蛋白脱乙酰基酶（HDACs）和小鼠的抑制作用HDAC1。最有效的抑制剂是在尿嘧啶-C6位置具有苯基/苄基环且带有4-5个碳单元以及间-或对-亚甲基肉桂基部分作为间隔基的化合物。在基于细胞的人类HDAC1和HDAC4分析中，测试的两个UBHA抑制了HDAC1，但没有抑制HDAC4的免疫沉淀活性。在人白血病U937细胞中进行测试时，一些UBHA会导致细胞周期的G1期停滞。此外，1j显示出高抗增殖和剂量依赖性的粒细胞分化特性。

  DOI：

  10.1021/jm0605536
• 作为产物：
  描述：

  6-溴己酸乙酯 在 氢氧化钾 、 potassium carbonate 作用下， 以 乙醇 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 19.0h， 生成 6-(3,4-dihydro-4-oxopyrimidin-2-ylthio)hexanoic acid
  参考文献：
  名称：

  新型，含尿嘧啶的组蛋白脱乙酰基酶抑制剂的合成和生物学性质。

  摘要：

  测试了一系列新的化合物，其中包含尿嘧啶部分作为苯基/苯基烷基部分与N-羟基-聚亚甲基铝酰胺或-亚甲基肉桂酰胺基之间的连接单元（基于尿嘧啶的异羟肟酸，UBHA）对玉米组蛋白脱乙酰基酶（HDACs）和小鼠的抑制作用HDAC1。最有效的抑制剂是在尿嘧啶-C6位置具有苯基/苄基环且带有4-5个碳单元以及间-或对-亚甲基肉桂基部分作为间隔基的化合物。在基于细胞的人类HDAC1和HDAC4分析中，测试的两个UBHA抑制了HDAC1，但没有抑制HDAC4的免疫沉淀活性。在人白血病U937细胞中进行测试时，一些UBHA会导致细胞周期的G1期停滞。此外，1j显示出高抗增殖和剂量依赖性的粒细胞分化特性。

  DOI：

  10.1021/jm0605536

文献信息

• TREATMENT OF RETROVIRAL RESERVOIRS EXPLOITING OXIDATIVE STRESS
  申请人：Savarino Andrea

  公开号：US20110305774A1

  公开（公告）日：2011-12-15

  Activation of HIV-1 replication causes oxidative stress, which in turn potentiates HIV-1 replication. The common basis for the compounds of the present invention is: A) the capacity of reactivating HIV-1 from latency, and B) the ability to counteract the cellular machinery which activates in order to limit the effects of oxidative stress. In this way, oxidative stress can be potentiated and a “chain reaction” is sparked. This “chain reaction” induces a more efficient reactivation of HIV-1 from latency and, in some cases, induces selective killing of the infected cells. Actions A) and B) can either be carried out by one drug exerting both effects, or obtained by the combined use of distinct drugs. There are two main cellular machineries counteracting oxidative stress, i.e. the thioredoxin (Trx) thioredoxin reductase (TrxR) system and glutathione. Herein, we present drug strategies capable of exerting action B) by blocking either of the two machineries.

  HIV-1复制的激活会引起氧化应激，从而加强HIV-1的复制。本发明化合物的共同基础是：A）重新激活HIV-1潜伏感染的能力，和B）对抗细胞机制，以限制氧化应激的影响。通过这种方式，氧化应激可以被增强并引发“连锁反应”。这种“连锁反应”诱导更有效的HIV-1潜伏感染的重新激活，并在某些情况下诱导感染细胞的选择性杀死。行动A）和B）可以由一种药物实现两种效果，也可以通过联合使用不同药物获得。对抗氧化应激的两种主要细胞机制是硫氧还蛋白（Trx）硫氧还蛋白还原酶（TrxR）系统和谷胱甘肽。在此，我们提出了能够通过阻断这两种机制之一来实现B）行动的药物策略。
• TREATMENT OF LATENT HIV-1 INFECTIONS USING AURANOFIN OR ARSENIC TRIOXIDE
  申请人：Istituto Superiore di Sanità

  公开号：EP2349245B1

  公开（公告）日：2016-08-03
• Exploring the connection unit in the HDAC inhibitor pharmacophore model: Novel uracil-based hydroxamates
  作者：Antonello Mai、Silvio Massa、Dante Rotili、Riccardo Pezzi、Patrizia Bottoni、Roberto Scatena、Joachim Meraner、Gerald Brosch

  DOI：10.1016/j.bmcl.2005.07.081

  日期：2005.11

  Starting from the pharmacophore model for HDAC inhibitor design, a novel series of hydroxamates bearing a uracil moiety as connecting unit (CU) has been prepared and tested. Almost all compounds exhibited HDAC inhibiting activity at low nanomolar concentrations, the N-hydroxy-6-(3,4-dihydro-4-oxo-6-benzyl- and -6-phenyl-2-pyrimidinylthio)hexanamides 1d and 11 being more potent than SAHA in enzymatic assays. Such compounds also caused hyperacetylation in NIH3T3 cell core histones and were endowed with interesting antiproliferative and cytodifferentiating effects in human leukemia (HL-60) cells. (c) 2005 Elsevier Ltd. All rights reserved.
• US8785493B2
  申请人：——

  公开号：US8785493B2

  公开（公告）日：2014-07-22
• [EN] TREATMENT OF RETROVIRAL RESERVOIRS EXPLOITING OXIDATIVE STRESS<br/>[FR] TRAITEMENT DE RÉSERVOIRS RÉTROVIRAUX EXPLOITANT LE STRESS OXYDATIF
  申请人：IST SUPERIORE SANITA

  公开号：WO2010049182A2

  公开（公告）日：2010-05-06

  Activation of HIV-1 replication causes oxidative stress, which in turn potentiates HIV-1 replication. The common basis for the compounds of the present invention is: A) the capacity of reactivating HIV-1 from latency, and B) the ability to counteract the cellular machinery which activates in order to limit the effects of oxidative stress. In this way, oxidative stress can be potentiated and a "chain reaction" is sparked. This "chain reaction" induces a more efficient reactivation of HIV-1 from latency and, in some cases, induces selective killing of the infected cells. Actions A) and B) can either be carried out by one drug exerting both effects, or obtained by the combined use of distinct drugs. There are two main cellular machineries counteracting oxidative stress, i.e. the thioredoxin (Trx) thioredoxin reductase (TrxR) system and glutathione. Herein, we present drug strategies capable of exerting action B) by blocking either of the two machineries.