(2R,3R,4R,5R)-2-((6-amino-5-nitropyrimidin-4-yl)amino)-5-((benzoyloxy)methyl)tetrahydrofuran-3,4-diyl dibenzoate | 112220-31-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: (2R,3R,4R,5R)-2-((6-amino-5-nitropyrimidin-4-yl)amino)-5-((benzoyloxy)methyl)tetrahydrofuran-3,4-diyl dibenzoate
• 英文别名: 6-amino-5-nitro-4-<(2,3,5-tri-O-benzoyl-β-D-ribofuranosyl)amino>pyrimidine；6-amino-5-nitro-4-[(2,3,5-tri-O-benzoyl-β-D-ribofuranosyl)amino]pyrimidine；[(2R,3R,4R,5R)-5-[(6-amino-5-nitropyrimidin-4-yl)amino]-3,4-dibenzoyloxyoxolan-2-yl]methyl benzoate
• CAS: 112220-31-2
• 化学式: C₃₀H₂₅N₅O₉
• 分子量: 599.557
• InChiKey: YCLADKIOWVZUDS-VBHAUSMQSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.7
• 重原子数：
  44
• 可旋转键数：
  12
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.17
• 拓扑面积：
  198
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  13

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (2R,3R,4R,5R)-2-((6-amino-5-nitropyrimidin-4-yl)amino)-5-((benzoyloxy)methyl)tetrahydrofuran-3,4-diyl dibenzoate 在 sodium methylate 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 甲醇 为溶剂， 生成 克力托辛
  参考文献：
  名称：

  Efficient Synthesis of Clitocine via 1,3-N (endo) to N (exo) Migration: A Revision to Kini’s Work

  摘要：

  通过前所未有的 1,3-N（内向）到 N（外向）迁移这一关键转化，完成了氯妥昔碱的高效合成。加入对氯苯甲酰（PCB）基团作为保护基团后，7 的中间体很容易固化，从而使分离变得非常容易，并在最后的脱保护阶段最大程度地减少了异构体中心的外嵌合。

  DOI：

  10.1055/s-2005-871564
• 作为产物：
  描述：

  β-D-ribofuranose 5-t-butyldiphenylsilyloxy-2,3,5-tribenzoate 在 吡啶 、 硫酸氢铵 、 硫酸 、 三氟甲磺酸三甲基硅酯 作用下， 以 hexamethyldisilazan 、 乙腈 为溶剂， 反应 6.0h， 生成 (2R,3R,4R,5R)-2-((6-amino-5-nitropyrimidin-4-yl)amino)-5-((benzoyloxy)methyl)tetrahydrofuran-3,4-diyl dibenzoate
  参考文献：
  名称：

  Use of nucleoside compounds for nonsense suppression and the treatment of genetic diseases

  摘要：

  这项发明涵盖了核苷类化合物、包含这些化合物的组合物以及通过给予这些化合物或组合物来治疗或预防与mRNA无义突变相关的疾病的方法。

  公开号：

  US20060166926A1

文献信息

• Synthesis and intramolecular hydrogen bonding and biochemical studies of clitocine, a naturally occurring exocyclic amino nucleoside
  作者：Randall J. Moss、Charles R. Petrie、Rich B. Meyer、L. Dee Nord、Randall C. Willis、Roberts A. Smith、Steven B. Larson、Ganesh D. Kini、Roland K. Robins

  DOI：10.1021/jm00399a017

  日期：1988.4

  The total synthesis of clitocine [6-amino-5-nitro-4-(beta-D-ribofuranosylamino)pyrimidine] (1), a nucleoside recently isolated from the mushroom Clitocybe inversa, has been accomplished. Glycosylation of 4,6-diamino-5-nitropyrimidine (4) with 1-O-acetyl-2,3,5-tri-O-benzoyl-D-ribofuranose afforded the protected nucleoside 6-amino-5-nitro-4-[(2,3,5-tri-O-benzoyl-beta-D-ribofuranosyl) amino]pyrimidine

  已经完成了从最近从蘑菇克霉菌中分离出来的核苷－克利斯汀[6-氨基-5-硝基-4-（β-D-核呋喃糖基氨基）嘧啶]的总合成。用1-O-乙酰基-2,3,5-三-O-苯甲酰基-D-呋喃呋喃糖将4,6-二氨基-5-硝基嘧啶（4）糖基化，得到受保护的核苷6-氨基5-硝基-4- [（2,3,5-三-O-苯甲酰基-β-D-呋喃呋喃糖基）氨基]嘧啶（5）仅作为β-端基异构体具有良好的收率。用NaOMe / MeOH对5脱保护，得到1，分别为β-端基和α-端基异构体的11.5：1混合物。从MeOH中重结晶，然后进行色谱，得到1，其含有少于1％的其α-端基异构体。X-射线晶体数据揭示了在锁精氨酸中的平面糖苷配基部分，其中硝基的每个氧原子分子内氢键合到两个相邻氨基官能团的氢原子上。Clitocine体外抑制ID50为3 X 10（-8）M的L1210细胞。Clitocine还被发现是Ki值为3 X 10（-6）M的腺苷激酶的底物和抑制剂。
• Unexpected Observation of the Dimroth Rearrangement in the Ribosylation of 4-Aminopyrimidines
  作者：Ramil Y. Baiazitov、Nadiya Sydorenko、Hongyu Ren、Young-Choon Moon

  DOI：10.1021/acs.joc.7b00780

  日期：2017.6.2

  with 1 provide products 3. When intermediates 3 contain a strongly electron-withdrawing group, such as C(4)-Cl or C(5)-NO2, they rearrange to products 4 in the presence of aqueous ammonia. A mechanism is proposed that involves a ring-opening/ring-closing (Dimroth) rearrangement.

  通过4-氨基嘧啶2或5的糖基化制备1-（N-呋喃呋喃糖基）-6-亚氨基-1,6-二氢嘧啶-4-胺3或4-（N-呋喃呋喃糖基）-6-氨基嘧啶4的方法描述。甲硅烷基化的4-氨基嘧啶2或5在被1核糖基化后可提供产物3。当中间体3含有强吸电子基团（例如C（4）-Cl或C（5）-NO 2）时，它们会重排为产物4在氨水存在下。提出了一种涉及开环/闭环（Dimroth）重排的机制。
• Nucleoside compounds and their use for treating cancer and diseases associated with somatic mutations
  申请人：——

  公开号：US20040067900A1

  公开（公告）日：2004-04-08

  The invention encompasses nucleoside compounds, compositions comprising the compounds and methods for treating or preventing diseases associated with nonsense mutations of mRNA by administering these compounds or compositions.

  本发明涉及核苷酸化合物、包含这些化合物的组合物以及通过给予这些化合物或组合物来治疗或预防与mRNA无意义突变相关疾病的方法。
• METHODS FOR THE PRODUCTION OF FUNCTIONAL PROTEIN FROM DNA HAVING A NONSENSE MUTATION AND THE TREATMENT OF DISORDERS ASSOCIATED THEREWITH
  申请人：PTC THERAPEUTICS, INC

  公开号：US20160199357A1

  公开（公告）日：2016-07-14

  The present invention relates to functional proteins encoded by nucleic acid sequences comprising a nonsense mutation. The present invention also relates to methods for the production of functional proteins encoded by nucleic acid sequences comprising a nonsense mutation and the use of such proteins for prevention, management and/or treatment of diseases associated with a nonsense mutation(s) in a gene.

  本发明涉及由包含无意义突变的核酸序列编码的功能蛋白质。本发明还涉及用于生产由包含无意义突变的核酸序列编码的功能蛋白质的方法，并使用这些蛋白质预防、管理和/或治疗与基因中的无意义突变相关的疾病。
• [EN] NUCLEOSIDE COMPOUNDS AND THEIR USE FOR TREATING CANCER AND DISEASES ASSOCIATED WITH SOMATIC MUTATIONS<br/>[FR] COMPOSES NUCLEOSIDIQUES ET LEUR UTILISATION POUR LE TRAITEMENT DU CANCER ET DE MALADIES ASSOCIEES A DES MUTATIONS SOMATIQUES
  申请人：PTC THERAPEUTICS INC

  公开号：WO2004009609A3

  公开（公告）日：2004-10-21