β²-epi-azumamide E | 1449273-00-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 肽模拟物
• 英文名称: β²-epi-azumamide E
• 英文别名: (Z)-6-[(2R,5R,8R,11R,12R)-8-benzyl-5,12-dimethyl-3,6,9,13-tetraoxo-2-propan-2-yl-1,4,7,10-tetrazacyclotridec-11-yl]hex-4-enoic acid
• CAS: 1449273-00-0
• 化学式: C₂₇H₃₈N₄O₆
• 分子量: 514.622
• InChiKey: DMXROUYLQHFRCS-XJXJVNRDSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.4
• 重原子数：
  37
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.52
• 拓扑面积：
  154
• 氢给体数：
  5
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  (2R,3R)-tert-butyl 3-((S)-1,1-dimethylethylsulfinamido)-5-hydroxy-2-methylpentanoate 在 哌啶 、 盐酸 、 水 、 双(三甲基硅烷基)氨基钾 、 碳酸氢钠 、 戴斯-马丁氧化剂 、 1,8-二氮杂双环[5.4.0]十一碳-7-烯 、 N,N-二异丙基乙胺 、 N-[(dimethylamino)-3-oxo-1H-1,2,3-triazolo[4,5-b]pyridin-1-yl-methylene]-N-methylmethanaminium hexafluorophosphate 、 lithium hydroxide 作用下， 以 四氢呋喃 、 1,4-二氧六环 、 二氯甲烷 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 104.42h， 生成 β²-epi-azumamide E
  参考文献：
  名称：

  全合成和Azumamides A-E的全组蛋白脱乙酰酶抑制描述以及β 2 -外延-Azumamide E和β 3 -外延-AzumamideË

  摘要：

  环状四肽和十肽天然产物由于其作为组蛋白脱乙酰基酶（HDAC）抑制剂的有效活性，已被证明可用作生物探针和候选药物。在这里，我们通过一种简明的方法介绍了一类环状四肽HDAC抑制剂，azumamides的合成，其中制备非规范的双取代β-氨基酸构件的关键步骤是Ellman型曼尼希反应。通过调整转化过程中的反应条件，我们获得了天然产物以及两个差向异构体的同源物。因此，氮酰胺类化合物B–D的第一个总合成证实了最初分配的结构，并且合成工作使得对氮酰胺类化合物A–E的整个选择的HDAC抑制特性进行了首次完整的分析。

  DOI：

  10.1021/jm4008449

文献信息

• Total Synthesis and Full Histone Deacetylase Inhibitory Profiling of Azumamides A–E as Well as β²- <i>epi</i>-Azumamide E and β³-<i>epi</i>-Azumamide E
  作者：Jesper S. Villadsen、Helle M. Stephansen、Alex R. Maolanon、Pernille Harris、Christian A. Olsen

  DOI：10.1021/jm4008449

  日期：2013.8.22

  tetrapeptide HDAC inhibitors, the azumamides, by a concise route in which the key step in preparation of the noncanonical disubstituted β-amino acid building block was an Ellman-type Mannich reaction. By tweaking the reaction conditions during this transformation, we gained access to the natural products as well as two epimeric homologues. Thus, the first total syntheses of azumamides B–D corroborated the originally

  环状四肽和十肽天然产物由于其作为组蛋白脱乙酰基酶（HDAC）抑制剂的有效活性，已被证明可用作生物探针和候选药物。在这里，我们通过一种简明的方法介绍了一类环状四肽HDAC抑制剂，azumamides的合成，其中制备非规范的双取代β-氨基酸构件的关键步骤是Ellman型曼尼希反应。通过调整转化过程中的反应条件，我们获得了天然产物以及两个差向异构体的同源物。因此，氮酰胺类化合物B–D的第一个总合成证实了最初分配的结构，并且合成工作使得对氮酰胺类化合物A–E的整个选择的HDAC抑制特性进行了首次完整的分析。