3-去氮腺嘌呤A | 120964-45-6

• 物质功能分类: 生物化工 - 抑制剂 - 表观遗传学(Epigenetics)
• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 咪唑并吡啶类
• 中文名称: 3-去氮腺嘌呤A
• 英文名称: 3-deazaneplanocin A hydrochloride
• 英文别名: (1S,2R,5R)-5-(4-aminoimidazo[4,5-c]pyridin-1-yl)-3-(hydroxymethyl)cyclopent-3-ene-1,2-diol;hydrochloride
• CAS: 120964-45-6
• 化学式: C₁₂H₁₄N₄O₃*ClH
• 分子量: 298.729
• InChiKey: UNSKMHKAFPRFTI-FDKLLANESA-N

物化性质

• 熔点：
  168-169℃
• 溶解度：
  H2O：≥5mg/mL

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.37
• 重原子数：
  20
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.33
• 拓扑面积：
  117
• 氢给体数：
  5
• 氢受体数：
  6

安全信息

• 危险品标志：
  Xn
• 危险类别码：
  R22
• WGK Germany：
  3
• 危险性防范说明：
  P280,P305+P351+P338
• 危险性描述：
  H302

制备方法与用途

生物活性

3-deazaneplanocin A HCl (DZNeP, NSC 617989) 是一种腺苷类似物，作为竞争性S-adenosylhomocysteine hydrolase抑制剂，在无细胞试验中的Ki值为50 pM。

靶点

Target	Value
S-adenosylhomocysteine hydrolase	50 pM (Ki)

体外研究

3-Deazaneplanocin A（1.0 μM）作用于人类急性髓细胞白血病OCI-AML3细胞，导致G0/G1期细胞显著增加至58.5%，S期和G2/M期细胞数量分别减少至35.2%和6.3%。在48小时内，该化合物处理OCI-AML3（约50%）和HL-60细胞（约50%），诱导细胞凋亡并降低细胞剂量生长90%以上。

此外，3-Deazaneplanocin A作用于HL-60和OCI-AML3细胞及原代AML细胞时，能够降低EZH2水平，并抑制组蛋白H3在赖氨酸27位点的三甲基化。它还诱导p16、p21、p27和FBXO32表达，同时降低cyclin E和HOXA9水平。

500 nM 3-Deazaneplanocin A处理48小时后，可诱导HL-60细胞分化为CD11b。此外，该化合物对多种病毒表现出极好的活性：对L929细胞的水疱性口炎病毒、H.Ep-2的副流感病毒、Vero细胞的牛痘和黄热病病毒的IC50分别为0.2 μg/mL、3.6 μg/mL、2.1 μg/mL 和 2.9 μg/mL。它对美国 Leishmania (L mexicana and L brasiliensis) 展示出强大的抗什曼原病疗效，平均ID50为96 ng/mL；即使在高达10 μg/mL的浓度下，也不抑制某些T. cruzi和T. rangeli菌株。

3-Deazaneplanocin A按200 ng/mL剂量处理4天后，能够通过前鞭毛体抑制S-腺苷-L-3H-甲基蛋氨酸和3-胸苷渗透。在100 ng/mL剂量下，它能消除约56%感染人巨噬细胞的L mexicana 和L brasiliensis。

体内研究

3-Deazaneplanocin A具有抗白血病活性。将其以1 mg/kg剂量处理移植AML细胞的小鼠，显著延长了小鼠的中位生存期（43天），与对照组（36天）相比；而与10 mg/kg pan-HDAC抑制剂Panobinostat联用，则可进一步提高治疗效果。

此外，在体内，3-Deazaneplanocin A按8 mg/kg剂量处理牛痘病毒显示出抗病毒活性。对于接种L. b. guyanensis的近交BALB/c小鼠，以0.5至1.5 mg/kg剂量每天处理，显著降低了皮肤利什曼病的感染率。3-Deazaneplanocin A处理感染Ebola病毒的小鼠后，显著诱导了干扰素-α的产生增加。

在感染1000 pfu (30 000 LD50) 小鼠适应性EBO-Z 的小鼠中，皮下注射2 mg/kg剂量后的3-Deazaneplanocin A处理可防止死亡。此外，在第1天降低平均血清病毒滴度；与安慰剂对照组相比，在第2天降低100倍，第3天降低100000倍。治疗产生的平均血清IFN-α水平在第2天为1420 pg/mL，第3天为1830 pg/mL。

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  3-去氮腺嘌呤A 、 丙酮 在 盐酸 、 三乙胺 作用下， 以 乙醚 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 18.0h， 以89%的产率得到2',3'-O-isopropyIidene-3-deazaneplanocin A
  参考文献：
  名称：

  [EN] 3-DEAZANEPLANOCIN DERIVATIVES
  [FR] DÉRIVÉS 3-DÉSAZANÉPLANOCINE

  摘要：

  这项发明描述了基于3-去氮烯普拉辛A（DZNep）核心结构的一系列化合物，旨在抑制Polycomb抑制性复合物2（PRC2）蛋白的功能。

  公开号：

  WO2010036213A1
• 作为产物：
  描述：

  1-[(3aR,6R,6aS)-2,3a-dimethyl-4-(phenylmethoxymethyl)-6,6a-dihydrocyclopenta[d][1,3]dioxol-6-yl]-4-chloroimidazo[4,5-c]pyridine 生成 3-去氮腺嘌呤A
  参考文献：
  名称：

  TSENG, CHRISTOPHER K. H.;MARQUEZ, VICTOR E.;FULLER, RICHARD W.;GOLDSTEIN,+, J. MED. CHEM., 32,(1989) N, C. 1442-1446

  摘要：

  DOI：

文献信息

• Cyclopentenol Nucleoside Compounds Intermediates for their Synthesis and Methods of Treating Viral Infections
  申请人：Chu David C.K.

  公开号：US20090270431A1

  公开（公告）日：2009-10-29

  The present invention relates to compounds according to the structure (I), Where B is formula (Ia), formula (Ib) or formula (Ic); A is H, OR 2 or halogen (F, Cl, Br, I, preferably F or Br, more preferably F); A′ is H, OR2 or halogen (F, Cl, Br, I, preferably F or Br, more preferably F); A″ is H or OR 1 , with the proviso that when A′ is OR, A is H; and when A is OR 2 , A′ is H; X is C—R 3 or N; Y is C—R 3 or N; preferably X or Y is N and X and Y are not both simultaneously N; R 3 is H or C 1 -C 3 alkyl; D is H or NHR 2 ; E is absent or H; G is O or NHR 2 ; J is N or C—R 4 ; K is N or C—H; R 4 is H, halogen (F, Cl, Br, I), CN, —C(═O)NH 2 , NH 2 , NO 2 , —C═C—H (cis or trans) or —C≡C—H; R a is H or CH 3 ; Each R 1 is independently H, an acyl group, a C 1 -C 20 alkyl or ether group, a phosphate, diphosphate, triphosphate, phosphodiester group; Each R 2 is independently H, an acyl group, a C 1 -C 20 alkyl or ether group; and Pharmaceutically acceptable salts, solvates or polymorphs thereof.

  本发明涉及结构式(I)的化合物，其中B为公式(Ia)，公式(Ib)或公式(Ic)；A为H，OR2或卤素（F，Cl，Br，I，优选F或Br，更优选F）；A′为H，OR2或卤素（F，Cl，Br，I，优选F或Br，更优选F）；A″为H或OR1，但当A′为OR时，A为H；当A为OR2时，A′为H；X为C—R3或N；Y为C—R3或N；优选X或Y为N，且X和Y不同时为N；R3为H或C1-C3烷基；D为H或NHR2；E不存在或为H；G为O或NHR2；J为N或C—R4；K为N或C—H；R4为H，卤素（F，Cl，Br，I），CN，—C（═O）NH2，NH2，NO2，—C═C—H（顺式或反式）或—C≡C—H；Ra为H或CH3；每个R1独立地为H，酰基，C1-C20烷基或醚基，磷酸盐，二磷酸盐，三磷酸盐，磷酸二酯基；每个R2独立地为H，酰基，C1-C20烷基或醚基；以及其药学上可接受的盐，溶剂或多晶形式。
• Synthesis of 3-deazaneplanocin A, a powerful inhibitor of S-adenosylhomocysteine hydrolase with potent and selective in vitro and in vivo antiviral activities
  作者：Christopher K. H. Tseng、Victor E. Marquez、Richard W. Fuller、Barry M. Goldstein、David R. Haines、Howard McPherson、Jack L. Parsons、William M. Shannon、Gussie Arnett

  DOI：10.1021/jm00127a007

  日期：1989.7

  S-adenosylhomocysteine hydrolase, 3-deazaneplanocin A displayed excellent antiviral activity in cell culture against vesicular stomatitis, parainfluenza type 3, yellow fever, and vaccinia viruses. Antiviral activity was also displayed in vivo against vaccinia virus by using a mouse tailpox assay. The significantly lower cytotoxicity of 3-deazaneplanocin A, relative to its parent compound neplanocin A, may be due to

  已经合成了奈普兰球蛋白A类似物3-脱氮烷扁平球蛋白A（2b）。通过6-氯-3-去氮杂嘌呤的钠盐在环戊烯基甲磺酸酯3上的SN2直接置换提供了所需的区域异构体4作为主要产物。脱保护后，将该材料分两步转化为3-脱氮烷普莱辛A。X射线晶体学分析证实了指定的结构。与其有效抑制S-腺苷同型半胱氨酸水解酶一致，3-deazaneplanocin A在细胞培养中针对水泡性口炎，3型副流感，黄热病和牛痘病毒显示出优异的抗病毒活性。还通过使用小鼠尾痘试验在体内显示了针对牛痘病毒的抗病毒活性。相对于其母体化合物neplanocin A，3-deazaneplanocin A的细胞毒性明显降低，
• METHODS FOR DETERMINING CELLS SUCH AS CIRCULATING CANCER OR FETAL CELLS
  申请人：Analiza, Inc.

  公开号：EP3702783A1

  公开（公告）日：2020-09-02

  Some embodiments of the present invention generally relate to devices and methods for determining and/or isolating cells. For example, one aspect is generally directed to methods and devices for detecting, identifying, counting, and/or potentially sorting cells of interest in blood or other biological sample. In some embodiments, blood samples (or other biological fluids) may be treated with signaling entities, such as pH-sensitive entities, that change color or otherwise produce a signal in suitable internal environments. For example, certain cells, such as cancer or fetal cells, may have differences in intracellular pH compared to other cells, which can be detected using pH-sensitive entities. In certain embodiments, the cells may be sorted based on such signaling entities; for example, illumination of cells in a suitable machine for sorting cells (e. g., using fluorescent light) may allow determination of the cells, which may also be recovered or isolated for further manipulation in some cases.

  本发明的一些实施方案一般涉及用于确定和/或分离细胞的装置和方法。例如，一个方面一般涉及用于检测、识别、计数和/或可能分选血液或其他生物样本中相关细胞的方法和装置。在某些实施方案中，血液样本（或其他生物液体）可以用信号实体（如 pH 敏感实体）处理，这些实体会变色或在合适的内部环境中产生信号。例如，某些细胞（如癌细胞或胎儿细胞）与其他细胞相比，细胞内 pH 值可能存在差异，可使用 pH 值敏感实体进行检测。在某些实施方案中，可根据此类信号实体对细胞进行分选；例如，在用于分选细胞的合适机器中对细胞进行照射（如使用荧光灯），可对细胞进行测定，在某些情况下，还可对细胞进行回收或分离，以便进一步操作。
• Devices and methods for determining and/or isolating cells such as circulating cancer or fetal cells
  申请人：Analiza, Inc.

  公开号：US10928405B2

  公开（公告）日：2021-02-23

  Some embodiments of the present invention generally relate to devices and methods for determining and/or isolating cells. For example, one aspect is generally directed to methods and devices for detecting, identifying, counting, and/or potentially sorting cells of interest in blood or other biological sample. In some embodiments, blood samples (or other biological fluids) may be treated with signaling entities, such as pH-sensitive entities, that change color or otherwise produce a signal in suitable internal environments. For example, certain cells, such as cancer or fetal cells, may have differences in intracellular pH compared to other cells, which can be detected using pH-sensitive entities. In certain embodiments, the cells may be sorted based on such signaling entities; for example, illumination of cells in a suitable machine for sorting cells (e.g., using fluorescent light) may allow determination of the cells, which may also be recovered or isolated for further manipulation in some cases.

  本发明的一些实施方案一般涉及用于确定和/或分离细胞的装置和方法。例如，一个方面一般涉及用于检测、识别、计数和/或可能分选血液或其他生物样本中相关细胞的方法和装置。在某些实施方案中，血液样本（或其他生物液体）可以用信号实体（如 pH 敏感实体）处理，这些实体会变色或在合适的内部环境中产生信号。例如，某些细胞（如癌细胞或胎儿细胞）与其他细胞相比，细胞内 pH 值可能存在差异，可使用 pH 值敏感实体进行检测。在某些实施方案中，可根据此类信号实体对细胞进行分选；例如，在用于分选细胞的合适机器中对细胞进行照射（如使用荧光灯），可对细胞进行测定，在某些情况下，还可对细胞进行回收或分离，以便进一步操作。
• EP2908843A1
  申请人：——

  公开号：EP2908843A1

  公开（公告）日：2015-08-26