1-[(3aR,4R,6R,6aR)-6-[[(1S,2R,6R,8R,9R,11S)-9-(4-methoxyphenyl)-4,4-dimethyl-11-oxo-3,5,7,10,12-pentaoxa-11lambda5-phosphatricyclo[6.4.0.02,6]dodecan-11-yl]oxymethyl]-2,2-dimethyl-3a,4,6,6a-tetrahydrofuro[3,4-d][1,3]dioxol-4-yl]-5-methylpyrimidine-2,4-dione | 1241404-72-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: 1-[(3aR,4R,6R,6aR)-6-[[(1S,2R,6R,8R,9R,11S)-9-(4-methoxyphenyl)-4,4-dimethyl-11-oxo-3,5,7,10,12-pentaoxa-11lambda5-phosphatricyclo[6.4.0.02,6]dodecan-11-yl]oxymethyl]-2,2-dimethyl-3a,4,6,6a-tetrahydrofuro[3,4-d][1,3]dioxol-4-yl]-5-methylpyrimidine-2,4-dione
• 英文别名: 1-[(3aR,4R,6R,6aR)-6-[[(1S,2R,6R,8R,9R,11S)-9-(4-methoxyphenyl)-4,4-dimethyl-11-oxo-3,5,7,10,12-pentaoxa-11λ5-phosphatricyclo[6.4.0.02,6]dodecan-11-yl]oxymethyl]-2,2-dimethyl-3a,4,6,6a-tetrahydrofuro[3,4-d][1,3]dioxol-4-yl]-5-methylpyrimidine-2,4-dione
• CAS: 1241404-72-7
• 化学式: C₂₈H₃₅N₂O₁₃P
• 分子量: 638.565
• InChiKey: FTRCWRUDBOODSI-TYWXSKTASA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.5
• 重原子数：
  44
• 可旋转键数：
  6
• 环数：
  7.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.64
• 拓扑面积：
  159
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  13

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  (5R)-1,2-O-isopropylidene-5-C-(4-methoxyphenyl)-α-D-xylofuranose 、 2',3'-O,O-isopropylidene-5-methyluridine 在 三乙胺 、 三氯氧磷 、 potassium tert-butylate 作用下， 以 二氯甲烷 、 乙醚 为溶剂， 以22%的产率得到1-[(3aR,4R,6R,6aR)-6-[[(1S,2R,6R,8R,9R,11S)-9-(4-methoxyphenyl)-4,4-dimethyl-11-oxo-3,5,7,10,12-pentaoxa-11lambda5-phosphatricyclo[6.4.0.02,6]dodecan-11-yl]oxymethyl]-2,2-dimethyl-3a,4,6,6a-tetrahydrofuro[3,4-d][1,3]dioxol-4-yl]-5-methylpyrimidine-2,4-dione
  参考文献：
  名称：

  在轴向上C4位置带有芳基的六元环磷酸酯中存在主席构象：环状核苷酸作为环状磷酸酯和磷酰胺前药的模型化合物

  摘要：

  通过受保护的胸腺嘧啶，磷酰氯和5-芳基-α - d-木呋喃糖酶衍生物的三组分反应，制备了HepDirect前药的一系列环状核苷酸类似物。环状核苷酸之一显示NMR数据，表明主要为扭曲构象。然而，尽管在晶格内的C4位上具有芳基，但环状核苷酸仍具有椅子构型，且芳基是轴向取向的。通过分析史无前例的X射线结构，可以发现，来自磷酰基（P═O）的氧原子非常靠近邻位-芳基的氢原子（2.51Å），因此表明具有吸引力的非键合静电相互作用，这可能是克服芳基施加的空间双轴相互作用的驱动力。对两种模型化合物的理论研究（NBO）表明，在填充的（供体）路易斯型NBO与空的（受体）非刘易斯NBO之间确实存在相互作用，对应于n O→σ* C-H相互作用。另外，观察到环状核苷酸的非对映异构体混合物转化为更稳定的非对映体环状核苷酸，并通过膦环中的自发异构化来解释。这一发现支持了最近建立的关于前药裂解作用方式的假说，异头作用对此起着重要的作用。

  DOI：

  10.1021/jo100863n

文献信息

• On the Existence of the Chair Conformation in Six-Membered Ring Phosphates Bearing an Aryl Group Axially Oriented at the C4 Position: Cyclic Nucleotides As Model Compounds for Cyclic Phosph(on)ate and Phosphoramide Prodrugs
  作者：Leticia Quintero、Mario Sánchez-Vazquez、Silvano Cruz-Gregorio、Fernando Sartillo-Piscil

  DOI：10.1021/jo100863n

  日期：2010.9.3

  conformation; however, in spite of having an aryl group at the C4 position within the crystal lattice, the cyclic nucleotide had a chair conformation with the aryl group axially oriented. By analyzing the unprecedented X-ray structure, it was observed that the oxygen atom from the phoshoryl group (P═O) is found in close proximity to the o-hydrogen atom of the aryl group (2.51 Å), suggesting thus an attractive

  通过受保护的胸腺嘧啶，磷酰氯和5-芳基-α - d-木呋喃糖酶衍生物的三组分反应，制备了HepDirect前药的一系列环状核苷酸类似物。环状核苷酸之一显示NMR数据，表明主要为扭曲构象。然而，尽管在晶格内的C4位上具有芳基，但环状核苷酸仍具有椅子构型，且芳基是轴向取向的。通过分析史无前例的X射线结构，可以发现，来自磷酰基（P═O）的氧原子非常靠近邻位-芳基的氢原子（2.51Å），因此表明具有吸引力的非键合静电相互作用，这可能是克服芳基施加的空间双轴相互作用的驱动力。对两种模型化合物的理论研究（NBO）表明，在填充的（供体）路易斯型NBO与空的（受体）非刘易斯NBO之间确实存在相互作用，对应于n O→σ* C-H相互作用。另外，观察到环状核苷酸的非对映异构体混合物转化为更稳定的非对映体环状核苷酸，并通过膦环中的自发异构化来解释。这一发现支持了最近建立的关于前药裂解作用方式的假说，异头作用对此起着重要的作用。