6-[3-((bromoacetyl)aminopropyl)aminomethyl]dibenzo[b,j][4,7]phenanthroline | 371244-71-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 喹啉及其衍生物
• 英文名称: 6-[3-((bromoacetyl)aminopropyl)aminomethyl]dibenzo[b,j][4,7]phenanthroline
• CAS: 371244-71-2
• 化学式: C₂₆H₂₃BrN₄O
• 分子量: 487.399
• InChiKey: LLZNXTYHZZWAKV-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.08
• 重原子数：
  32.0
• 可旋转键数：
  7.0
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.19
• 拓扑面积：
  66.91
• 氢给体数：
  2.0
• 氢受体数：
  4.0

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  6-bromomethyldibenzo[b,j][4,7]phenanthroline 在 N,N'-二环己基碳二亚胺 作用下， 以 甲醇 、 氘代氯仿 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 5.0h， 生成 6-[3-((bromoacetyl)aminopropyl)aminomethyl]dibenzo[b,j][4,7]phenanthroline
  参考文献：
  名称：

  三链体形成引发的喹吖啶衍生物对 HIV-DNA 的直接光裂解

  摘要：

  氨基-对-喹吖啶化合物 (PQ) 已被证明可以强烈且特异性地稳定三螺旋 DNA。此外，这些衍生物显示出光活性，使其成为有效的 DNA 切割剂。我们利用这两个特性（三链体特异性结合和光活性）选择性地切割 HIV-1 基因组中存在的双链 (ds) DNA 序列。首先在含有 HIV 多嘌呤束 (PPT) 的线性化质粒 (3300 bp) 上进行切割，该质粒允许通过三链形成寡核苷酸 (TFO) 进行靶向。PQ(3)() 是该系列中活性最强的化合物，当该序列与 16 聚体 TFO 形成三链体时，可有效切割 PPT 附近的双链 DNA。在分子水平上对短 DNA 片段（56 bp）的切割进行了研究；PQ(3)() 的光致切割仅在三螺旋存在时发生。然而，观察到不寻常的切割模式：在距离三螺旋位点末端 6-9 bp 的鸟嘌呤处观察到损伤。这种切割非常有效（高达 60%），不需要碱处理，并且在两条链上都可以观察

  DOI：

  10.1021/ja0109040