2-(2-((R)-3-(3,4-dimethoxyphenyl)-1-(((S)-1-((S)-2-(3,4,5-trimethoxyphenyl)butanoyl)piperidine-2-carbonyl)oxy)propyl)phenoxy)acetic acid | 2230613-03-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯丙烷和聚酮 - 直链 1,3-二芳基丙烷
• 英文名称: 2-(2-((R)-3-(3,4-dimethoxyphenyl)-1-(((S)-1-((S)-2-(3,4,5-trimethoxyphenyl)butanoyl)piperidine-2-carbonyl)oxy)propyl)phenoxy)acetic acid
• 英文别名: AP1867-2-(carboxymethoxy)；2-[2-[(1R)-3-(3,4-dimethoxyphenyl)-1-[(2S)-1-[(2S)-2-(3,4,5-trimethoxyphenyl)butanoyl]piperidine-2-carbonyl]oxypropyl]phenoxy]acetic acid
• CAS: 2230613-03-1
• 化学式: C₃₈H₄₇NO₁₁
• 分子量: 693.791
• InChiKey: UYXSZUBFOQLRNQ-BTIIJPOSSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  6.3
• 重原子数：
  50
• 可旋转键数：
  18
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.45
• 拓扑面积：
  139
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  11

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  4-((8-aminooctyl)amino)-2-(2,6-dioxopiperidin-3-yl)isoindoline-1,3-dione trifluoroacetate 、 2-(2-((R)-3-(3,4-dimethoxyphenyl)-1-(((S)-1-((S)-2-(3,4,5-trimethoxyphenyl)butanoyl)piperidine-2-carbonyl)oxy)propyl)phenoxy)acetic acid 在 N,N-二异丙基乙胺 、 N-[(dimethylamino)-3-oxo-1H-1,2,3-triazolo[4,5-b]pyridin-1-yl-methylene]-N-methylmethanaminium hexafluorophosphate 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 30.0h， 以77%的产率得到(2S)-(1R)-3-(3,4-dimethoxyphenyl)-1-(2-(2-((8-((2-(2,6-dioxopiperidin-3-yl)-1,3-dioxoisoindolin-4-yl)amino)octyl)amino)-2-oxoethoxy)phenyl)propyl 1-((S)-2-(3,4,5-trimethoxyphenyl)butanoyl)piperidine-2-carboxylate
  参考文献：
  名称：

  MELK对于基底样乳腺癌细胞的增殖不是必需的

  摘要：

  彻底的临床前靶标验证对于药物发现工作的成功至关重要。在这项研究中，我们结合了化学和遗传干扰因素，包括开发一种新型选择性母体胚胎亮氨酸拉链激酶 (MELK) 抑制剂 HTH-01-091、CRISPR/Cas9 介导的 MELK 敲除、一种新型化学诱导蛋白质降解策略、 RNA 干扰和 CRISPR 干扰验证 MELK 作为基底样乳腺癌 (BBC) 的治疗靶点。在常见的培养条件下，我们发现 MELK 的小分子抑制、基因缺失或急性消耗不会显着影响细胞生长。这种与先前发现的差异说明了广泛使用的 MELK 抑制剂 OTSSP167 的选择性问题，以及靶向 MELK 的短发夹的潜在脱靶效应。这里开发的不同遗传和化学工具允许识别和验证 MELK 在癌症生物学中可能发挥的任何因果作用，这将需要指导未来的 MELK 药物发现工作。此外，我们的研究为临床前目标验证提供了一个通用框架。

  DOI：

  10.7554/elife.26693
• 作为产物：
  描述：

  3-(3,4-dimethoxyphenyl)-1-(2-hydroxyphenyl)propan-1-one 在 4-二甲氨基吡啶 、 水 、 potassium carbonate 、 (+)-二异松蒎基氯硼烷 、 lithium hydroxide 、 N,N'-二异丙基碳二亚胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 、 乙腈 为溶剂， 反应 59.17h， 生成 2-(2-((R)-3-(3,4-dimethoxyphenyl)-1-(((S)-1-((S)-2-(3,4,5-trimethoxyphenyl)butanoyl)piperidine-2-carbonyl)oxy)propyl)phenoxy)acetic acid
  参考文献：
  名称：

  CN114874132

  摘要：

  公开号：

文献信息

• [EN] SMALL MOLECULE DEGRADERS OF FKBP12 VIA RECRUITMENT OF VON HIPPEL-LINDAU E3 UBIQUITIN LIGASE (VHL) E3 UBIQUITIN LIGASE, AND USES IN dTAG SYSTEMS<br/>[FR] AGENTS DE DÉGRADATION DE PETITES MOLÉCULES DE FKBP12 PAR RECRUTEMENT DE L'UBIQUITINE LIGASE E3 DE VON HIPPEL-LINDAU (VHL), ET UTILISATIONS DANS DES SYSTÈMES DTAG
  申请人：DANA FARBER CANCER INST INC

  公开号：WO2020146250A1

  公开（公告）日：2020-07-16

  Disclosed is a dTAG system comprising a small molecule degraders of FKBP12-tagged proteins via recruitment of Von Hippel-Lindau E3 ubiquitin ligase (VHL) E3 ubiquitin ligase and uses thereof

  本文披露了一种dTAG系统，通过招募Von Hippel-Lindau E3泛素连接酶（VHL）E3泛素连接酶来降解FKBP12标记的蛋白质的小分子降解剂，以及其用途。
• [EN] METHODS OF ALTERING GENE EXPRESSION BY PERTURBING TRANSCRIPTION FACTOR MULTIMERS THAT STRUCTURE REGULATORY LOOPS<br/>[FR] PROCÉDÉS DE MODIFICATION DE L'EXPRESSION GÉNIQUE PAR PERTURBATION DE MULTIMÈRES DU FACTEUR DE TRANSCRIPTION QUI STRUCTURENT LES BOUCLES RÉGULATRICES
  申请人：WHITEHEAD INST BIOMEDICAL RES

  公开号：WO2018129544A1

  公开（公告）日：2018-07-12

  The invention relates to methods of modulating the expression of one or more genes in a cell by modulating the multimerization of a transcription factor and/or modulating the formation of enhancer-promoter DNA loops, and thereby modulating the expression of the one or more genes. The invention also relates to treating diseases and conditions involving aberrant gene expression by modulating the multimerization of a transcription factor and/or modulating the formation of enhancer-promoter DNA loops. The invention also relates to methods for screening for compounds that modulate expression of one or more genes in a cell.

  该发明涉及通过调节转录因子的多聚化和/或调节增强子-启动子DNA环的形成，从而调节细胞中一个或多个基因的表达的方法。该发明还涉及通过调节转录因子的多聚化和/或调节增强子-启动子DNA环的形成来治疗涉及异常基因表达的疾病和病况。该发明还涉及筛选调节细胞中一个或多个基因表达的化合物的方法。
• Regulating chimeric antigen receptors
  申请人：DANA-FARBER CANCER INSTITUTE, INC.

  公开号：US11311609B2

  公开（公告）日：2022-04-26

  This invention is in the area of compositions and methods for regulating chimeric antigen receptor immune effector cell, for example T-cell (CAR-T), therapy to modulate associated adverse inflammatory responses, for example, cytokine release syndrome and tumor lysis syndrome, using targeted protein degradation.

  本发明属于利用靶向蛋白降解调节嵌合抗原受体免疫效应细胞（例如 T 细胞（CAR-T））疗法以调节相关不良炎症反应（例如细胞因子释放综合征和肿瘤溶解综合征）的组合物和方法领域。
• SMALL MOLECULE DEGRADERS OF FKBP12 VIA RECRUITMENT OF VON HIPPEL-LINDAU E3 UBIQUITIN LIGASE (VHL) E3 UBIQUITIN LIGASE, AND USES IN DTAG SYSTEMS
  申请人：Dana Farber Cancer Institute, Inc.

  公开号：EP3908291A1

  公开（公告）日：2021-11-17
• METHODS OF ALTERING GENE EXPRESSION BY PERTURBING TRANSCRIPTION FACTOR MULTIMERS THAT STRUCTURE REGULATORY LOOPS
  申请人：Whitehead Institute for Biomedical Research

  公开号：US20190352648A1

  公开（公告）日：2019-11-21

  The invention relates to methods of modulating the expression of one or more genes in a cell by modulating the multimerization of a transcription factor and/or modulating the formation of enhancer-promoter DNA loops, and thereby modulating the expression of the one or more genes. The invention also relates to treating diseases and conditions involving aberrant gene expression by modulating the multimerization of a transcription factor and/or modulating the formation of enhancer-promoter DNA loops. The invention also relates to methods for screening for compounds that modulate expression of one or more genes in a cell.