(2R,5R)-3-[(3aR,4R,6S,6aR)-6-[(4R)-2,2-dimethyl-1,3-dioxolan-4-yl]-2,2-dimethyl-3a,4,6,6a-tetrahydrofuro[3,4-d][1,3]dioxol-4-yl]-2-cyclohexyl-4,6,13-trioxa-3-azadispiro[4.1.57.25]tetradecan-14-one | 1370639-67-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: (2R,5R)-3-[(3aR,4R,6S,6aR)-6-[(4R)-2,2-dimethyl-1,3-dioxolan-4-yl]-2,2-dimethyl-3a,4,6,6a-tetrahydrofuro[3,4-d][1,3]dioxol-4-yl]-2-cyclohexyl-4,6,13-trioxa-3-azadispiro[4.1.57.25]tetradecan-14-one
• CAS: 1370639-67-0
• 化学式: C₂₈H₄₃NO₉
• 分子量: 537.651
• InChiKey: IUVKJEZMEPIHAP-KBRSGJGGSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.5
• 重原子数：
  38
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  7.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.96
• 拓扑面积：
  94.2
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  10

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (2R,5R)-3-[(3aR,4R,6S,6aR)-6-[(4R)-2,2-dimethyl-1,3-dioxolan-4-yl]-2,2-dimethyl-3a,4,6,6a-tetrahydrofuro[3,4-d][1,3]dioxol-4-yl]-2-cyclohexyl-4,6,13-trioxa-3-azadispiro[4.1.57.25]tetradecan-14-one 在 高氯酸 作用下， 以 水 、 乙腈 、 叔丁醇 为溶剂， 反应 2.0h， 生成
  参考文献：
  名称：

  合成发酵的抗生素发现：文库装配，表型筛选和靶向青霉素结合蛋白的β肽的作用机理。

  摘要：

  与导致生物活性天然产物的生物合成途径类似，合成发酵在水性，生物相容性条件下从简单的结构单元生成分子混合物，从而可以直接筛选所得培养物中的生物活性。在这项工作中，使用合成发酵平台成功鉴定了新型β肽抗生素。表型筛选以最初随机的方式进行，可以轻松鉴定活性培养物。随后的解卷积，重点筛选和结构-活性关系研究导致了一种有效的抗菌肽的鉴定，显示了我们的模型系统枯草芽孢杆菌对人HEK293细胞具有很强的选择性。为了确定抗菌作用机理，通过使用适当的合成发酵构件，可以轻松合成带有光亲和标签的肽探针，并使用基于定量质谱的策略将其用于靶标鉴定。化学旋转方法导致鉴定出许多细菌膜蛋白作为预期靶标。这些发现通过使用微尺度热泳的与青霉素结合蛋白4的结合亲和力研究得到验证，其中生物活性肽显示出纳摩尔摩尔范围内的解离常数（Kd）。通过这些努力，我们为此处介绍的合成发酵方法提供了概念验证，这是新型生物活性化合物表型发现的新策略。

  DOI：

  10.1021/acschembio.9b00227
• 作为产物：
  描述：

  D-(-)-古洛糖酸-gamma-内酯 在 sodium tetrahydroborate 、 盐酸羟胺 、 sodium acetate 、 对甲苯磺酸 作用下， 以 甲醇 、 乙醇 、 乙酸丙酯 、 丙酮 为溶剂， 反应 52.0h， 生成 (2R,5R)-3-[(3aR,4R,6S,6aR)-6-[(4R)-2,2-dimethyl-1,3-dioxolan-4-yl]-2,2-dimethyl-3a,4,6,6a-tetrahydrofuro[3,4-d][1,3]dioxol-4-yl]-2-cyclohexyl-4,6,13-trioxa-3-azadispiro[4.1.57.25]tetradecan-14-one
  参考文献：
  名称：

  对映选择性，β的色谱-免费合成3与天然和非天然侧链-氨基酸

  摘要：

  β 3 -氨基酸是一些药物的关键组分，代谢不稳定的α氨基酸优良替代物，和用于手性杂环积木。不幸的是，它们不容易以对映体纯的形式获得，特别是当具有不自然的侧链时。用于合成的柔性，自由色谱过程对映体纯β 3 -氨基酸具有天然和非天然侧链进行说明。该方法使用廉价的起始原料和试剂，为对映纯α-氨基酸的危险且昂贵的Arndt-Eistert同源提供了很好的替代方法。它的效用已被证明与两种有价值β制备规模合成3 -氨基酸具有非天然侧链。

  DOI：

  10.1021/op300069n

文献信息

• Antibiotic Discovery with Synthetic Fermentation: Library Assembly, Phenotypic Screening, and Mechanism of Action of β-Peptides Targeting Penicillin-Binding Proteins
  作者：Iain A. Stepek、Trung Cao、Anika Koetemann、Satomi Shimura、Bernd Wollscheid、Jeffrey W. Bode

  DOI：10.1021/acschembio.9b00227

  日期：2019.5.17

  focused screening, and structure-activity relationship studies led to the identification of a potent antimicrobial peptide, showing strong selectivity for our model system Bacillus subtilis over human HEK293 cells. To determine the antibacterial mechanism of action, a peptide probe bearing a photoaffinity tag was readily synthesized through the use of appropriate synthetic fermentation building blocks

  与导致生物活性天然产物的生物合成途径类似，合成发酵在水性，生物相容性条件下从简单的结构单元生成分子混合物，从而可以直接筛选所得培养物中的生物活性。在这项工作中，使用合成发酵平台成功鉴定了新型β肽抗生素。表型筛选以最初随机的方式进行，可以轻松鉴定活性培养物。随后的解卷积，重点筛选和结构-活性关系研究导致了一种有效的抗菌肽的鉴定，显示了我们的模型系统枯草芽孢杆菌对人HEK293细胞具有很强的选择性。为了确定抗菌作用机理，通过使用适当的合成发酵构件，可以轻松合成带有光亲和标签的肽探针，并使用基于定量质谱的策略将其用于靶标鉴定。化学旋转方法导致鉴定出许多细菌膜蛋白作为预期靶标。这些发现通过使用微尺度热泳的与青霉素结合蛋白4的结合亲和力研究得到验证，其中生物活性肽显示出纳摩尔摩尔范围内的解离常数（Kd）。通过这些努力，我们为此处介绍的合成发酵方法提供了概念验证，这是新型生物活性化合物表型发现的新策略。
• Enantioselective, Chromatography-Free Synthesis of β³-Amino Acids with Natural and Unnatural Side Chains
  作者：Thibaud Gerfaud、Ying-Ling Chiang、Imants Kreituss、Justin A. Russak、Jeffrey W. Bode

  DOI：10.1021/op300069n

  日期：2012.4.20

  β3-Amino acids are key components of some pharmaceuticals, excellent surrogates for metabolically labile α-amino acids, and building blocks for chiral heterocycles. Unfortunately they are not easily accessible in enantiomerically pure form, especially when possessing unnatural side chains. A flexible, chromatography-free process for the synthesis of enantiopure β3-amino acids possessing natural and

  β 3 -氨基酸是一些药物的关键组分，代谢不稳定的α氨基酸优良替代物，和用于手性杂环积木。不幸的是，它们不容易以对映体纯的形式获得，特别是当具有不自然的侧链时。用于合成的柔性，自由色谱过程对映体纯β 3 -氨基酸具有天然和非天然侧链进行说明。该方法使用廉价的起始原料和试剂，为对映纯α-氨基酸的危险且昂贵的Arndt-Eistert同源提供了很好的替代方法。它的效用已被证明与两种有价值β制备规模合成3 -氨基酸具有非天然侧链。