(2S,3S,3AS,9AR)-3-(Benzyloxy)-2-((benzyloxy)methyl)-2-(((tert-butyldiphenylsilyl)oxy)methyl)-7-methyl-2,3,3A,9A-tetrahydro-6H-furo[2',3':4,5]oxazolo[3,2-A]pyrimidin-6-one | 1300589-67-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯和取代衍生物
• 英文名称: (2S,3S,3AS,9AR)-3-(Benzyloxy)-2-((benzyloxy)methyl)-2-(((tert-butyldiphenylsilyl)oxy)methyl)-7-methyl-2,3,3A,9A-tetrahydro-6H-furo[2',3':4,5]oxazolo[3,2-A]pyrimidin-6-one
• 英文别名: (2R,4S,5S,6S)-4-[[tert-butyl(diphenyl)silyl]oxymethyl]-11-methyl-5-phenylmethoxy-4-(phenylmethoxymethyl)-3,7-dioxa-1,9-diazatricyclo[6.4.0.02,6]dodeca-8,11-dien-10-one
• CAS: 1300589-67-6
• 化学式: C₄₁H₄₄N₂O₆Si
• 分子量: 688.896
• InChiKey: DCWZCAAJUKZOST-JXWQITIZSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.96
• 重原子数：
  50
• 可旋转键数：
  13
• 环数：
  7.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.32
• 拓扑面积：
  78.8
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (2S,3S,3AS,9AR)-3-(Benzyloxy)-2-((benzyloxy)methyl)-2-(((tert-butyldiphenylsilyl)oxy)methyl)-7-methyl-2,3,3A,9A-tetrahydro-6H-furo[2',3':4,5]oxazolo[3,2-A]pyrimidin-6-one 在 吡啶 、 重铬酸吡啶 、 水 、 一水合肼 、 1,8-二氮杂双环[5.4.0]十一碳-7-烯 、 triethylamine tris(hydrogen fluoride) 、 sodium hydroxide 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 乙醇 、 二氯甲烷 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 乙腈 为溶剂， 反应 62.34h， 生成 3',5'-di-O-benzyl-4'-carboxy-2'-O-(N-methyleneamino)-5-methyluridine
  参考文献：
  名称：

  BRIDGED ARTIFICIAL NUCLEOSIDE AND NUCLEOTIDE

  摘要：

  本发明的目的是提供一种新型分子用于反义疗法，该分子在体内不易受核酸酶降解，并且对目标mRNA具有高结合亲和力和特异性，能够有效调节特定基因的表达。本发明的新型人工核苷酸在2′,4′-BNA/LNA的桥接结构中引入了酰胺键。含有2′,4′-桥接人工核苷酸的寡核苷酸与已知的2′,4′-BNA/LNA具有相当的单链RNA结合亲和力，并且比LNA具有更高的核酸酶抗性。特别地，由于其比S-oligo对单链RNA的结合亲和力更强，预计将被应用于核酸药物。

  公开号：

  US20120208991A1
• 作为产物：
  描述：

  1,2-O-(异丙亚基)-4-C-[(苯基甲氧基)甲基]-3-O-(苯基甲基)-beta-L-来苏呋喃糖 在 4-二甲氨基吡啶 、 N,O-双三甲硅基乙酰胺 、 三氟甲烷磺酰氯 、 三氟甲磺酸三甲基硅酯 、 硫酸 、 溶剂黄146 、 三乙胺 、 甲胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 、 水 、 乙腈 为溶剂， 反应 26.0h， 生成 (2S,3S,3AS,9AR)-3-(Benzyloxy)-2-((benzyloxy)methyl)-2-(((tert-butyldiphenylsilyl)oxy)methyl)-7-methyl-2,3,3A,9A-tetrahydro-6H-furo[2',3':4,5]oxazolo[3,2-A]pyrimidin-6-one
  参考文献：
  名称：

  BRIDGED ARTIFICIAL NUCLEOSIDE AND NUCLEOTIDE

  摘要：

  本发明的目的是提供一种新型分子用于反义疗法，该分子在体内不易受核酸酶降解，并且对目标mRNA具有高结合亲和力和特异性，能够有效调节特定基因的表达。本发明的新型人工核苷酸在2′,4′-BNA/LNA的桥接结构中引入了酰胺键。含有2′,4′-桥接人工核苷酸的寡核苷酸与已知的2′,4′-BNA/LNA具有相当的单链RNA结合亲和力，并且比LNA具有更高的核酸酶抗性。特别地，由于其比S-oligo对单链RNA的结合亲和力更强，预计将被应用于核酸药物。

  公开号：

  US20120208991A1

文献信息

• 修饰核苷、核苷酸和核酸聚合物及其制备方法 与应用
  申请人：中国人民解放军军事科学院军事医学研究院

  公开号：CN110590886B

  公开（公告）日：2021-03-23

  本发明涉及修饰核苷、核苷酸和核酸聚合物及其制备方法与应用。所述修饰核苷选自具有如式(I)所示结构的化合物、其盐或其异构体；其中，R1选自取代或未取代的碱基或其盐；X代表O或S；R2选自氢或者取代或未取代的：C1～C6烷基、C1～C6杂烷基、C2～C6烯基、C2～C6炔基、芳基或杂芳基；R3和R4独立地选自氢或者取代或未取代的：C1～C6烷基、C1～C6杂烷基；W1和W2独立地选自H或保护基团。所述修饰核苷在6’位引入了腈基，并在此基础上进一步获得修饰核苷酸和核酸聚合物，极大地改善了它们的核酶耐受性，对靶RNA具有高度选择性和较强结合亲和力。
• Synthetic Method for 2′-Amino-LNA Bearing Any of the Four Nucleobases via a Transglycosylation Reaction
  作者：Hiroaki Sawamoto、Yuuki Arai、Shuhei Yamakoshi、Satoshi Obika、Eiji Kawanishi

  DOI：10.1021/acs.orglett.8b00476

  日期：2018.4.6

  A transglycosylation reaction of 2′-amino-locked nucleic acid (LNA) from thymine (T) to other nucleobases adenine (A), guanine (G), and 5-methylcytosine (mC) has been developed. This reaction proceeds in high yield and with high β-selectivity. The mild reaction conditions enable the coexistence of acid-labile protecting groups, including a 4,4′-dimethoxytrytyl (DMTr) group. 2′-Amino-LNAs bearing any

  已经开发了2'-氨基锁定核酸（LNA）从胸腺嘧啶（T）到其他核碱基腺嘌呤（A），鸟嘌呤（G）和5-甲基胞嘧啶（m C）的转糖基化反应。该反应以高产率和高β-选择性进行。温和的反应条件使酸不稳定的保护基（包括4,4'-二甲氧基胰基（DMTr）基）能够共存。现在可以容易地合成带有任何核碱基的2'-氨基-LNA。