(3-tert-butoxycarbonylaminopropyl)-(5-hydroxypentyl)-carbamic acid tert-butyl ester | 221249-93-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: (3-tert-butoxycarbonylaminopropyl)-(5-hydroxypentyl)-carbamic acid tert-butyl ester
• 英文别名: N,N'-bis(tert-butoxycarbonyl)-5-[(3-aminopropyl)amino]pentan-1-ol
• CAS: 221249-93-0
• 化学式: C₁₈H₃₆N₂O₅
• 分子量: 360.494
• InChiKey: ZLNFOABKPTVGLC-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.3
• 重原子数：
  25.0
• 可旋转键数：
  9.0
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.89
• 拓扑面积：
  88.1
• 氢给体数：
  2.0
• 氢受体数：
  5.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (3-tert-butoxycarbonylaminopropyl)-(5-hydroxypentyl)-carbamic acid tert-butyl ester 在 四溴化碳 、 三苯基膦 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 以96%的产率得到N1,N3-bis(tert-butoxycarbonyl)-N1-(5-bromopentyl)propane-1,3-diamine
  参考文献：
  名称：

  N8-乙酰亚精胺类似物作为细菌乙酰多胺酰胺水解酶抑制剂的合成与评价

  摘要：

  聚胺是许多生物过程中涉及的小的必需聚阳离子。多胺代谢酶已被广泛研究并且是有吸引力的药物靶点。然而，多胺的可逆乙酰化仍然知之甚少。尽管已经检测和研究了真核N 8 -乙酰亚精胺脱乙酰酶活性，但尚未确定负责该活性的特定酶。然而，来自支原体的锌脱乙酰酶据报道，乙酰多胺酰胺水解酶 (APAH) 使用各种乙酰多胺作为底物。最近解决的这种聚胺脱乙酰酶的晶体结构揭示了在二聚体界面形成了一个“L”形活性位点隧道，具有理想的尺寸和静电特性，可容纳狭窄、灵活的阳离子聚胺底物。在这里，我们报告了带有不同锌结合基团的N 8 -乙酰亚精胺类似物作为 APAH 潜在抑制剂的设计、合成和评估。大多数合成的化合物表现出适度的效力，IC 50值在中微摩尔范围内，但带有异羟肟酸酯或三氟甲基酮锌结合基团的化合物在中纳摩尔范围内表现出增强的抑制效力。这些抑制剂将使未来对原核生物和真核生物中乙酰多胺功能的探索成为可能。

  DOI：

  10.1016/j.bmc.2013.05.045
• 作为产物：
  描述：

  (2-cyanoethyl)-(5-hydroxypentyl)-carbamic acid tert-butyl ester 在 锂硼氢 、 三甲基氯硅烷 、 三乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 13.0h， 生成 (3-tert-butoxycarbonylaminopropyl)-(5-hydroxypentyl)-carbamic acid tert-butyl ester
  参考文献：
  名称：

  通过合成的三吡咯-肽共轭物具有高亲和力，序列特异性的DNA结合。

  摘要：

  通过含氮系链将bZIP转录因子的基本区域连接至双霉素样三吡咯肽，可产生能够高亲和力识别特定的指定DNA序列的杂合体。氮在系链中的重要性由其被醚键取代引起的亲和力显着降低（超过10倍）表明。氨基丙基链在邻近带有含氮系链的吡咯的吡咯上的连接将亲和力增加约一个数量级。这些结果证实，质子化的胺基在设计的DNA结合肽上的合适位置提供了更高的亲和力，这很可能是由于与磷酸二酯主链形成了盐桥联的接触。

  DOI：

  10.1002/chem.200500010

文献信息

• Sequence-Selective DNA Recognition with Peptide-Bisbenzamidine Conjugates
  作者：Mateo I. Sánchez、Olalla Vázquez、M. Eugenio Vázquez、José L. Mascareñas

  DOI：10.1002/chem.201300519

  日期：2013.7.22

  binding sites (TCAT⋅AAATT). Fluorescence reverse titrations show an interesting multiphasic profile consistent with the formation of competitive nonspecific complexes at low DNA/peptide ratios. On the other hand, the conjugate with the DNA binding domain of the zinc finger protein GAGA binds with high affinity (KD≈12 nM) and specificity to a composite AATTT⋅GAGA sequence containing both the bisbenzamidine

  转录因子（TFs）是专门的蛋白质，在调节基因表达中起关键作用。它们的作用机制涉及与特定DNA序列的相互作用，该相互作用通常通过蛋白质的特定结构域发生。然而，实现有效结合通常需要完整蛋白质的存在。bZIP和锌指TF家族就是这种情况，当DNA结合片段以分离的单体形式存在时，它们不能与它们的靶位点相互作用。本文证明了这些单体肽与氮杂双苯甲m共轭时可以恢复其DNA结合，氮杂双苯甲m是易于获得的分子，可通过插入其小沟与富含A / T的位点相互作用。重要的，氮杂苯甲m单元的荧光特性提供了电泳迁移率变动分析（EMSA）中所不存在的DNA相互作用的详细信息。基于GCN4 bZIP蛋白的杂种优先结合含有双双苯甲m-GCN4结合位点（TCAT）的复合序列⋅ AAATT）。荧光反向滴定显示出有趣的多相分布，与低DNA /肽比例下竞争性非特异性复合物的形成一致。在另一方面，随着以高亲和力（锌指蛋白结合GAGA的DNA结合结构域结合物ķ
• Structure−Immunosuppressive Activity Relationships of New Analogues of 15-Deoxyspergualin. 1. Structural Modifications of the Hydroxyglycine Moiety
  作者：Luc Lebreton、Jocelyne Annat、Philippe Derrepas、Patrick Dutartre、Patrice Renaut

  DOI：10.1021/jm980431g

  日期：1999.1.1

  A series of new analogues of 15-deoxyspergualin (DSG), an immunosuppressive agent currently commercialized in Japan, was synthesized and tested in a graft-versus-host disease (GVHD) model in mice. Using the general concept of bioisosteric replacement, variations of the hydroxyglycine central "C" region were made in order to determine its optimum structure in terms of in vivo immunosuppressive activity. By this way, the malonic derivative 13a was discovered as the first example of a new series of potent immunosuppressive agents encompassing a retro-amide bond linked to the hexyl-guanidino moiety. Structure-activity relationships of this series were studied by synthesizing compounds 13g-i and 13k-s. Variation of the "right-amide" of 13a led to the urea 19a and the carbamates 23 and 27a which proved to be equally active as DSG in our GVHD model. Finally 27a was found to be the most potent derivative, being slightly more active than DSG in a heart allotransplantation model in rats. Due to the absence of chiral center in its structure and to its improved chemical stability compared to DSG, 27a was selected as a candidate for clinical evaluation.