自由基
氨基变位酶是 5'-
磷酸吡哆醛 (PLP, a B 6
维生素)依赖性酶,需要产生 5'-脱氧
腺苷自由基来启动催化循环,以进行 1,2
氨基转移反应。PLP 的氮原子在自由基
氨基变位酶中的作用尚未得到广泛研究。我们报告了一种替代合成程序,可轻松访问 1-deazaPLP (dAPLP),这是一种 PLP 的等排类似物,可作为研究氮原子作用的探针。我们的研究结果表明,用 dAPLP
重组的自由基
氨基变位酶赖
氨酸 5,6-
氨基变位酶 (5,6-
LAM) 不能翻转底物,这表明氮原子对于自由基
氨基变位酶至关重要。相比之下,对用 PLP
重组的 S238A 变体的生化和光谱研究显示活性损失很小。这种明显的异常可以通过
水介导的 S238A 活性挽救来解释,就好像模仿赖
氨酸 2,3-
氨基变位酶的活性位点一样。这项研究有助于更好地理解酶如何利用 PLP 的最佳能力来实现催化。