N,N-bis(({[3-(4-valeryl)benzoxazol-2-ylidene]methyl}quinoline)-2-amidoethyl)ethylamine | 1415986-71-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 喹啉及其衍生物
• 英文名称: N,N-bis(({[3-(4-valeryl)benzoxazol-2-ylidene]methyl}quinoline)-2-amidoethyl)ethylamine
• 英文别名: N,N-bis(({[3-(4-valeryl)benzothiazol-2-ylidene]methyl}quioline)-2-amidoethyl)ethylamine；N-[2-[2-aminoethyl-[2-[5-[2-(quinolin-4-ylmethylidene)-1,3-benzothiazol-3-yl]pentanoylamino]ethyl]amino]ethyl]-5-[2-(quinolin-4-ylmethylidene)-1,3-benzothiazol-3-yl]pentanamide
• CAS: 1415986-71-8
• 化学式: C₅₀H₅₄N₈O₂S₂
• 分子量: 863.163
• InChiKey: NAOJTWKHYGVGPC-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  8.1
• 重原子数：
  62
• 可旋转键数：
  20
• 环数：
  8.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.28
• 拓扑面积：
  170
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  10

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (2,5-dioxopyrrolidin-1-yl) 3-[1-[(2R,4S,5R)-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]-2,4-dioxopyrimidin-5-yl]prop-2-enoate 、 N,N-bis(({[3-(4-valeryl)benzoxazol-2-ylidene]methyl}quinoline)-2-amidoethyl)ethylamine 在 4-二甲氨基吡啶 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 17.0h， 以594 mg的产率得到
  参考文献：
  名称：

  标记有去甲基噻唑橙的核酸探针：用于活细胞RNA成像的新型杂交敏感荧光寡核苷酸† ‡

  摘要：

  已经开发了具有去甲基噻唑橙染料的新的荧光核苷酸D' 505，以扩展用于活细胞RNA成像的荧光探针的功能。用于DNA自动合成的D' 505的核苷单元可溶于有机溶剂，这使得核苷单元的制备和DNA合成循环中的反应更加有效。含有D' 505的寡脱氧核苷酸的染料在低于pH 7的条件下被质子化，并且通过控制D' 505染料的激子相互作用，该寡脱氧核苷酸表现出杂交敏感的荧光发射。。简化的过程和有效的对杂交敏感的荧光发射产生了多色的对杂交敏感的荧光探针，可用于活细胞RNA成像。受体漂白法为我们提供了许多活细胞中特定细胞中RNA的信息。

  DOI：

  10.1039/c2ob26707a
• 作为产物：
  描述：

  4-{[3-(4-carboxybutyl)benzothiazol-2-ylidene]methyl}-1-(2-carboxyethyl)quinolinium bromide 在 N-甲基吡咯烷酮 、 benzotriazol-1-yloxyl-tris-(pyrrolidino)-phosphonium hexafluorophosphate 、 1-羟基苯并三唑 、 O-(1H-benzotriazol-1-yl)-N,N,N',N'-tetramethyluronium hexafluorophosphate 、 三乙胺 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 32.25h， 生成 N,N-bis(({[3-(4-valeryl)benzoxazol-2-ylidene]methyl}quinoline)-2-amidoethyl)ethylamine
  参考文献：
  名称：

  标记有去甲基噻唑橙的核酸探针：用于活细胞RNA成像的新型杂交敏感荧光寡核苷酸† ‡

  摘要：

  已经开发了具有去甲基噻唑橙染料的新的荧光核苷酸D' 505，以扩展用于活细胞RNA成像的荧光探针的功能。用于DNA自动合成的D' 505的核苷单元可溶于有机溶剂，这使得核苷单元的制备和DNA合成循环中的反应更加有效。含有D' 505的寡脱氧核苷酸的染料在低于pH 7的条件下被质子化，并且通过控制D' 505染料的激子相互作用，该寡脱氧核苷酸表现出杂交敏感的荧光发射。。简化的过程和有效的对杂交敏感的荧光发射产生了多色的对杂交敏感的荧光探针，可用于活细胞RNA成像。受体漂白法为我们提供了许多活细胞中特定细胞中RNA的信息。

  DOI：

  10.1039/c2ob26707a

文献信息

• COMPOUND, NUCLEIC ACID, METHOD FOR PRODUCING NUCLEIC ACID, AND KIT FOR PRODUCING NUCLEIC ACID
  申请人：Okamoto Akimitsu

  公开号：US20130289263A1

  公开（公告）日：2013-10-31

  A compound is represented by the following formula ( 1 ), ( 2 ), or ( 3 ) (where, in the above formulae ( 1 ), ( 2 ), and ( 3 ), Z 11 and Z 12 independently have a fluorescent property and are an uncharged atomic group exhibiting an exciton effect).

  一个化合物由以下公式（1）、（2）或（3）表示（其中，在上述公式（1）、（2）和（3）中，Z11和Z12独立具有荧光性质，并且是表现出激子效应的不带电原子团）。