(5R,6R,7S,8R)-7,8-Dihydroxy-5-[(hydroxy)methyl]-6-(β-D-mannopyranosyloxy)-5,6,7,8-tetrahydroimidazo[1,2-a]pyridine-7,8-diol | 1593576-22-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: (5R,6R,7S,8R)-7,8-Dihydroxy-5-[(hydroxy)methyl]-6-(β-D-mannopyranosyloxy)-5,6,7,8-tetrahydroimidazo[1,2-a]pyridine-7,8-diol
• 英文别名: (2R,3S,4S,5S,6R)-2-[[(5R,6R,7R,8R)-7,8-dihydroxy-5-(hydroxymethyl)-5,6,7,8-tetrahydroimidazo[1,2-a]pyridin-6-yl]oxy]-6-(hydroxymethyl)oxane-3,4,5-triol
• CAS: 1593576-22-7
• 化学式: C₁₄H₂₂N₂O₉
• 分子量: 362.337
• InChiKey: CSXOUJBOYXGFCL-KKDJTKEGSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -4.6
• 重原子数：
  25
• 可旋转键数：
  4
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.79
• 拓扑面积：
  178
• 氢给体数：
  7
• 氢受体数：
  10

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  (5R,6R,7S,8R)-6-(2,3-di-O-benzyl-4,6-O-benzylidene-β-D-mannopyranosyloxy)-7,8-bis(benzyloxy)-5-[(benzyloxy)methyl]-5,6,7,8-tetrahydroimidazo[1,2-a]pyridine 在 氢气 、 palladium(II) hydroxide 、 溶剂黄146 作用下， 以 甲醇 、 水 、 乙酸乙酯 为溶剂， 反应 120.0h， 以58%的产率得到(5R,6R,7S,8R)-7,8-Dihydroxy-5-[(hydroxy)methyl]-6-(β-D-mannopyranosyloxy)-5,6,7,8-tetrahydroimidazo[1,2-a]pyridine-7,8-diol
  参考文献：
  名称：

  甘露糖苷酶构象坐标的抑制剂自由能景观和结构分析报告相结合

  摘要：

  甘露糖苷酶催化多种多糖和糖缀合物的水解，并且各种基于序列的甘露糖苷酶家族已经发展出巧妙的策略来克服甘露糖苷化学的立体电子挑战。通过结合计算化学、抑制剂设计和合成以及抑制剂/酶复合物的 X 射线晶体学，证明甘露咪唑型抑制剂能够忠实地报告甘露糖苷酶过渡态构象，并为该研究提供直接证据。多种甘露糖苷酶使用的构象行程，包括 GH26 和 GH113 家族的 β-甘露聚糖酶。异法戈明型抑制剂很难模拟过渡态构象，因为必须跨越高能垒才能获得机械相关的构象，然而，这些糖形杂环允许获得跨越活性位点的三元复合物，从而提供对参与底物识别的活性位点残基的有价值的见解。

  DOI：

  10.1002/anie.201308334

文献信息

• Combined Inhibitor Free-Energy Landscape and Structural Analysis Reports on the Mannosidase Conformational Coordinate
  作者：Rohan J. Williams、Javier Iglesias-Fernández、Judith Stepper、Adam Jackson、Andrew J. Thompson、Elisabeth C. Lowe、Jonathan M. White、Harry J. Gilbert、Carme Rovira、Gideon J. Davies、Spencer J. Williams

  DOI：10.1002/anie.201308334

  日期：2014.1.20

  demonstrated that mannoimidazole‐type inhibitors are energetically poised to report faithfully on mannosidase transition‐state conformation, and provide direct evidence for the conformational itinerary used by diverse mannosidases, including β‐mannanases from families GH26 and GH113. Isofagomine‐type inhibitors are poor mimics of transition‐state conformation, owing to the high energy barriers that must be

  甘露糖苷酶催化多种多糖和糖缀合物的水解，并且各种基于序列的甘露糖苷酶家族已经发展出巧妙的策略来克服甘露糖苷化学的立体电子挑战。通过结合计算化学、抑制剂设计和合成以及抑制剂/酶复合物的 X 射线晶体学，证明甘露咪唑型抑制剂能够忠实地报告甘露糖苷酶过渡态构象，并为该研究提供直接证据。多种甘露糖苷酶使用的构象行程，包括 GH26 和 GH113 家族的 β-甘露聚糖酶。异法戈明型抑制剂很难模拟过渡态构象，因为必须跨越高能垒才能获得机械相关的构象，然而，这些糖形杂环允许获得跨越活性位点的三元复合物，从而提供对参与底物识别的活性位点残基的有价值的见解。