尽管
氨基糖苷类抗生素对革兰氏阴性菌感染有效,但这些药物往往会造成不可逆的听力损伤。与真核
核糖体的解码位点结合似乎会导致耳毒性,但有证据表明还涉及其他影响。在这里,我们展示了
安普霉素和
遗传霉素(分别被认为是毒性最小和毒性最大的
氨基糖苷类)如何减少听觉细胞损伤。使用分子动力学模拟,我们研究了修饰的
氨基糖苷类如何影响
核糖体解码位点(
氨基糖苷类靶向的区域)的基本运动自由度。通过确定在线粒体中翻译的蛋白质与在细胞质中翻译的蛋白质的比率,我们发现
氨基糖苷类可以矛盾地提高而不是降低蛋白质
水平。我们发现某些
氨基糖苷类可以诱导快速的质膜透化,并且这种非
核糖体效应也可以通过
化学修饰来减少。所呈现的结果为开发更安全的
氨基糖苷类抗生素提供了一种新的范例。