4-[(2,6-二氯苯甲酰基)氨基]-N-4-哌啶基-1H-吡唑-3-甲酰胺三氟乙酸盐 | 1431697-85-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯和取代衍生物
• 中文名称: 4-[(2,6-二氯苯甲酰基)氨基]-N-4-哌啶基-1H-吡唑-3-甲酰胺三氟乙酸盐
• 英文名称: 4-(4-(2,6-dichlorobenzamido)-1H-pyrazole-3-carboxamido)piperidin-1-ium 2,2,2-trifluoroacetate
• 英文别名: AT7519 trifluoroacetate；4-[(2,6-dichlorobenzoyl)amino]-N-piperidin-4-yl-1H-pyrazole-5-carboxamide;2,2,2-trifluoroacetic acid
• CAS: 1431697-85-6
• 化学式: (x)C₂HF₃O₂*C₁₆H₁₇Cl₂N₅O₂
• 分子量: 496.3
• InChiKey: XTOQTRBZWZONHQ-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.08
• 重原子数：
  32
• 可旋转键数：
  4
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.33
• 拓扑面积：
  136
• 氢给体数：
  5
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  4-[(2,6-二氯苯甲酰基)氨基]-N-4-哌啶基-1H-吡唑-3-甲酰胺三氟乙酸盐 、 在 benzotriazol-1-yloxyl-tris-(pyrrolidino)-phosphonium hexafluorophosphate 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 以41 %的产率得到4-(2,6-dichlorobenzamido)-N-(1-(12-(12-(2-((2-(2,6-dioxopiperidin-3-yl)-1,3-dioxoisoindolin-4-yl)amino)acetamido)dodecanamido)dodecanoyl)piperidin-4-yl)-1H-pyrazole-3-carboxamide
  参考文献：
  名称：

  细胞周期蛋白依赖性激酶 9 (CDK9) 的双功能降解剂：探索接头长度、特性和选择性蛋白质降解之间的关系

  摘要：

  细胞周期蛋白依赖性激酶 9 (CDK9) 是多种癌症类型（包括急性髓性白血病 (AML)）中有前途的治疗靶点。蛋白质降解剂，也称为蛋白水解靶向嵌合体 (PROTAC)，已成为选择性降解癌症靶标（包括 CDK9）的工具，补充了传统小分子抑制剂的活性。这些化合物通常包含先前报道的抑制剂和已知的 E3 连接酶配体，以诱导泛素化和随后的靶蛋白降解。尽管文献中报道了许多蛋白质降解剂，但有效降解所必需的接头的特性仍然需要特别注意。在这项研究中，开发了一系列蛋白质降解剂，采用经过临床测试的CDK抑制剂 AT7519。本研究的目的是检查连接子组成，特别是链长对效力的影响。除了为各种接头组合物建立活性基线外，还制备了两个不同的同源系列，一个全烷基系列和一个含酰胺系列，证明了这些系列中降解剂效力对接头长度的依赖性以及与预测物理化学的相关性特性。

  DOI：

  10.1016/j.ejmech.2023.115342

文献信息

• Bifunctional degraders of cyclin dependent kinase 9 (CDK9): Probing the relationship between linker length, properties, and selective protein degradation
  作者：Robert J. Tokarski、Chia M. Sharpe、Andrew C. Huntsman、Brittney K. Mize、Oluwatosin R. Ayinde、Emily H. Stahl、James R. Lerma、Andrew Reed、Bridget Carmichael、Natarajan Muthusamy、John C. Byrd、James R. Fuchs

  DOI：10.1016/j.ejmech.2023.115342

  日期：2023.6

  inhibitors and a known E3 ligase ligand to induce ubiquitination and subsequent degradation of the target protein. Although many protein degraders have been reported in the literature, the properties of the linker necessary for efficient degradation still require special attention. In this study, a series of protein degraders was developed, employing the clinically tested CDK inhibitor AT7519. The purpose

  细胞周期蛋白依赖性激酶 9 (CDK9) 是多种癌症类型（包括急性髓性白血病 (AML)）中有前途的治疗靶点。蛋白质降解剂，也称为蛋白水解靶向嵌合体 (PROTAC)，已成为选择性降解癌症靶标（包括 CDK9）的工具，补充了传统小分子抑制剂的活性。这些化合物通常包含先前报道的抑制剂和已知的 E3 连接酶配体，以诱导泛素化和随后的靶蛋白降解。尽管文献中报道了许多蛋白质降解剂，但有效降解所必需的接头的特性仍然需要特别注意。在这项研究中，开发了一系列蛋白质降解剂，采用经过临床测试的CDK抑制剂 AT7519。本研究的目的是检查连接子组成，特别是链长对效力的影响。除了为各种接头组合物建立活性基线外，还制备了两个不同的同源系列，一个全烷基系列和一个含酰胺系列，证明了这些系列中降解剂效力对接头长度的依赖性以及与预测物理化学的相关性特性。