5’-O-[dimethyl(1,1,2-trimethylpropyl)silyl]-8-formyl-N2-isobutyryl-2’,3’-O-isopropylideneguanosine | 1449294-95-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物
• 英文名称: 5’-O-[dimethyl(1,1,2-trimethylpropyl)silyl]-8-formyl-N2-isobutyryl-2’,3’-O-isopropylideneguanosine
• 英文别名: 5’-O-[dimethyl(1,1,2-trimethylpropyl)silyl]-8-formyl-N²-isobutyryl-2’,3’-O-isopropylideneguanosine
• CAS: 1449294-95-4
• 化学式: C₂₆H₄₁N₅O₇Si
• 分子量: 563.726
• InChiKey: HCNIRBILFYUGMR-VZKMNXCRSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.6
• 重原子数：
  39.0
• 可旋转键数：
  9.0
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.73
• 拓扑面积：
  146.66
• 氢给体数：
  2.0
• 氢受体数：
  10.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5’-O-[dimethyl(1,1,2-trimethylpropyl)silyl]-8-formyl-N2-isobutyryl-2’,3’-O-isopropylideneguanosine 在 sodium tetrahydroborate 、 偶氮二甲酸二异丙酯 、 溶剂黄146 、 三苯基膦 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 乙醇 、 水 为溶剂， 反应 5.0h， 生成 5’-O-[dimethyl(1,1,2-trimethylpropyl)silyl]-8-(hydroxymethyl)-N2-isobutyryl-2’,3’-O-isopropylidene-O6-[2-(4-nitrophenyl)ethyl]guanosine
  参考文献：
  名称：

  具有整合的碱基和骨干的寡核苷酸类似物。第30章

  摘要：

  受保护的G * [ s ] C * [ s ] U * [ s ] A * [ s ] U * [ s ] A * [ s ] G * [ s ] C *八核苷24是通过硫醇盐的S烷基化制备的衍生自四核苷23与甲磺酸盐22，并转化为甲硅烷基化和异丙基亚甲基25，进一步转化为完全脱保护的八核苷26。化合物22衍生自甲氧基三苯甲基保护的四核苷21，通过S获得21通过去三苯甲基化和甲磺酰化作用，将由二核苷19衍生的硫醇盐与由16衍生的甲磺酸盐17进行烷基化。同样，四核苷23是由18衍生的硫醇盐与19衍生的甲磺酸盐20的S烷基化产生的。二核苷16和18是由已知的胞苷衍生的硫代乙酸盐15与C（8）取代的鸟苷衍生的甲磺酸盐12和14衍生的硫醇盐的S烷基化产生的。它们分别通过甲酰化，还原，保护和甲磺酰化作用从受保护的前体4和7合成。

  DOI：

  10.1002/hlca.201300043
• 作为产物：
  描述：

  2',3'-O-异丙亚基鸟苷 在 咪唑 、 4-二甲氨基吡啶 、 lithium hexamethyldisilazane 作用下， 以 四氢呋喃 、 吡啶 、 正己烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 16.0h， 生成 5’-O-[dimethyl(1,1,2-trimethylpropyl)silyl]-8-formyl-N2-isobutyryl-2’,3’-O-isopropylideneguanosine
  参考文献：
  名称：

  具有整合的碱基和骨干的寡核苷酸类似物。第30章

  摘要：

  受保护的G * [ s ] C * [ s ] U * [ s ] A * [ s ] U * [ s ] A * [ s ] G * [ s ] C *八核苷24是通过硫醇盐的S烷基化制备的衍生自四核苷23与甲磺酸盐22，并转化为甲硅烷基化和异丙基亚甲基25，进一步转化为完全脱保护的八核苷26。化合物22衍生自甲氧基三苯甲基保护的四核苷21，通过S获得21通过去三苯甲基化和甲磺酰化作用，将由二核苷19衍生的硫醇盐与由16衍生的甲磺酸盐17进行烷基化。同样，四核苷23是由18衍生的硫醇盐与19衍生的甲磺酸盐20的S烷基化产生的。二核苷16和18是由已知的胞苷衍生的硫代乙酸盐15与C（8）取代的鸟苷衍生的甲磺酸盐12和14衍生的硫醇盐的S烷基化产生的。它们分别通过甲酰化，还原，保护和甲磺酰化作用从受保护的前体4和7合成。

  DOI：

  10.1002/hlca.201300043

文献信息

• Oligonucleotide Analogues with Integrated Bases and Backbone. Part 32
  作者：Martina Schulze-Adams、Bruno Bernet、David Touboul、Daniel Egli、Lorenz Herdeis、Andrea Vasella

  DOI：10.1002/hlca.201400175

  日期：2014.9

  G‐quadruplexes. The quadruplex formation of 7 and 16 was established by 1H‐NMR spectroscopy (only of 16), vapour pressure osmometry, mass spectrometry, and CD spectroscopy. The C(6(I))‐hydroxymethylated analogue 9 in CDCl3 and the fully deprotected dinucleosides 10 and 11 in H2O form only weakly ππ stacked associates, but no G‐quadruplexes, as evidenced by CD spectroscopy.

  G [ s ] G二核苷6和G [ s ] G *二核苷8是通过分别从2和5衍生的鸟苷硫醇的烷基化（由从醇3获得的C（8）-氯甲基化的鸟苷4 ）制备的。。将二核苷6和8分别去酰基化为7和9，并完全脱保护为10和11。G [ n ] G二核苷16通过醛的还原胺化获得13带有膦亚胺从叠氮化物衍生的14和所得到的二聚体脱保护15。在的固态6，并在溶液6和8在CDCl 3，H  N（1 / I）和H  N（1 / II）从事分子内氢键来的所述CO异丁保护基团，和异丁酰基单元的HN我形成interresidue，分子内氢键，以N（7 / II），从而导致顺式核碱基的取向在单元I，到TG硫烷基部分的方向，以及与核碱基的正交方向，以防止任何碱基配对。甲硅烷基化和异亚丙基化的二核苷7和9以溶剂化的单重形式存在于DMSO溶液中。CHCl 3溶液中核苷7和16的1 H-NMR宽信号证明平衡了G-四链体。通过1
• Oligonucleotide Analogues with Integrated Bases and Backbone (ONIB). Part 31
  作者：Martina Schulze-Adams、David Touboul、Bruno Bernet、Andrea Vasella

  DOI：10.1002/hlca.201400156

  日期：2014.8

  The self‐complementary guanosine‐ and cytidine‐derived aminomethylene‐linked C*[n]G dinucleoside 9 was synthesized by reductive amination of aldehyde 3 with an iminophosphorane derived from azide 7. Deacylation of 9 gave the isopropylidene‐protected dinucleoside 10. The sequence‐isomeric G*[n]C dinucleoside 11 was similarly prepared from aldehyde 8 and azide 5, and deacylated to 12. The association

  自互补鸟嘌呤和胞苷衍生的氨基亚甲基连接的C * [ n ] G二核苷9是通过用叠氮化物7衍生的亚氨基磷烷对醛3进行还原胺化而合成的。9的脱酰得到异丙基保护的二核苷10。类似地，由醛8和叠氮化物5制备了序列异构的G * [ n ] C二核苷11，并脱酰为12。CHCl 3或CHCl 3中10和12的缔合/ DMSO混合物和缔合物的结构通过1 H-NMR，ESI-MS，CD和蒸气压渗透压（VPO）进行了研究。宽1二核苷的H-NMR的信号10和12证据双链体和四链之间的平衡（Hoogsteen碱基基地之间配对沃森克里克碱基配对的双链体）。在-50°和室温之间，G * [ n ] C二核苷12的四链体占主导地位。序列异构体C * [ n ] G 10在CDCl 3和CDCl 3 /（D 6中，大部分仅形成环状双链体。DMSO 9：1。