(E)-3-(4-carboxybutyl)-1-ethyl-2-((2E,4E)-5-(1-ethyl-3,3-dimethyl-3H-indol-1-ium-2-yl)penta-2,4-dien-1-ylidene)-3-methylindoline-5-sulfonate | 1072070-10-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吲哚及其衍生物
• 英文名称: (E)-3-(4-carboxybutyl)-1-ethyl-2-((2E,4E)-5-(1-ethyl-3,3-dimethyl-3H-indol-1-ium-2-yl)penta-2,4-dien-1-ylidene)-3-methylindoline-5-sulfonate
• 英文别名: N,N'-diethyl-3-(4-carboxybutyl)-5-sulfo-3,3',3'-trimethylindodicarbocyanine
• CAS: 1072070-10-0
• 化学式: C₃₃H₄₀N₂O₅S
• 分子量: 576.757
• InChiKey: ZJGUWWANPRHGCU-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  6.43
• 重原子数：
  41.0
• 可旋转键数：
  11.0
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.39
• 拓扑面积：
  100.75
• 氢给体数：
  1.0
• 氢受体数：
  5.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  二(对硝基苯)碳酸酯 、 (E)-3-(4-carboxybutyl)-1-ethyl-2-((2E,4E)-5-(1-ethyl-3,3-dimethyl-3H-indol-1-ium-2-yl)penta-2,4-dien-1-ylidene)-3-methylindoline-5-sulfonate 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 以90%的产率得到
  参考文献：
  名称：

  新型荧光标记核苷酸：合成，光谱性质及其在聚合酶链反应中的应用

  摘要：

  已经合成了新的C5修饰的核苷酸，其包含在吲哚烯3-位带有羧基的茚二碳菁花青染料，并通过市售的热稳定Taq DNA聚合酶掺入到DNA中。在TB-biochip和THROMBO-Biochip测试系统中研究了聚合酶链反应过程中标记核苷酸掺入的效率。

  DOI：

  10.1016/j.mencom.2016.03.002
• 作为产物：
  描述：

  2,3-dimethyl-3-(4-carboxybutyl)-5-sulfo-N-ethylindolenyne 、 1-乙基-2,3,3-三甲基吲哚鎓碘化物 、 盐酸-N-(3-苯氨基-2-丙烯亚基)苯胺 在 乙酸酐 、 potassium acetate 作用下， 以 溶剂黄146 、 乙酸酐 为溶剂， 反应 4.0h， 以17.5%的产率得到(E)-3-(4-carboxybutyl)-1-ethyl-2-((2E,4E)-5-(1-ethyl-3,3-dimethyl-3H-indol-1-ium-2-yl)penta-2,4-dien-1-ylidene)-3-methylindoline-5-sulfonate
  参考文献：
  名称：

  EP2157088

  摘要：

  公开号：

文献信息

• Synthesis, properties and bioconjugation of water-soluble asymmetric indodicarbocyanine dyes
  作者：Viktoriya E. Kuznetsova、Vadim A. Vasiliskov、Aleksandr S. Zasedatelev、Aleksandr V. Chudinov

  DOI：10.1016/j.mencom.2008.05.009

  日期：2008.5

  New indodicarbocyanine dyes have been synthesised and converted into succinimidyl active esters for the fluorescent labeling of proteins and oligonucleotides.