1-(2-deoxy-4-C-hydroxymethyl-α-L-erythro-pentofuranosyl)thymine | 151767-33-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 二嗪类
• 英文名称: 1-(2-deoxy-4-C-hydroxymethyl-α-L-erythro-pentofuranosyl)thymine
• 英文别名: 1-[(2R,4R)-4-hydroxy-5,5-bis(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]-5-methylpyrimidine-2,4-dione
• CAS: 151767-33-8
• 化学式: C₁₁H₁₆N₂O₆
• 分子量: 272.258
• InChiKey: ADFROXGIZKNJBH-HTQZYQBOSA-N

物化性质

• 密度：
  1.481±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -2
• 重原子数：
  19
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.64
• 拓扑面积：
  119
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1-(2-deoxy-4-C-hydroxymethyl-α-L-erythro-pentofuranosyl)thymine 在 吡啶 作用下， 反应 5.0h， 生成 1-(2-deoxy-5-O-pivaloyl-4-C-pivaloyoxylmethyl-3-O-methanesulfonyl-α-L-erythro-pentofuranosyl)thymine
  参考文献：
  名称：

  Synthesis of 1-(3-Azido-2,3-dideoxy-4-C-hydroxymethyl-α-L-threo-pentofuranosyl)thymine, 1-(2,3-Dideoxy-4-C-hydroxymethyl-α-L-glycero-pentofuranosyl)thymine and 1-(2,3-Dideoxy-4-C-hydroxymethyl-α-L-glycero-pent-2-enofuranosyl)thymine

  摘要：

  1-(2-O-乙酰基-3,5-二-O-苯甲酰基-4-C-苯氧甲基-α-L-阿拉伯呋喃糖基)嘧啶(II)经选择性去乙酰化、甲磺酰化和与1,8-二氮杂双环[5.4.0]十一烯处理转化为2,2'-脱水衍生物V。用氯化氢或溴化氢裂解化合物V中的2,2'-脱水环得到相应的2'-氯和2'-溴衍生物VI和VII。化合物VII与Cu/Zn偶对反应，随后脱苯甲酰化导致1-(2,3-二脱氧-4-C-羟甲基-α-L-戊-2-烯呋喃糖基)嘧啶(IX)。对IX进行催化氢化得到1-(2,3-二脱氧-4-C-羟甲基-α-L-甘油-戊呋喃糖基)嘧啶(X)。用三丁基锡氢化合物VI并脱苯甲酰化得到1-(2-脱氧-4-C-羟甲基-α-L-赤霉-戊呋喃糖基)嘧啶(XII)。化合物XII的三苯甲基化，随后甲磺酰化、去三苯甲基化和亲核取代与叠氮化合物反应得到1-(3-叠氮基-2,3-二脱氧-4-C-羟甲基-α-L-顺-戊呋喃糖基)嘧啶(XXII)。

  DOI：

  10.1135/cccc19930409
• 作为产物：
  描述：

  1-(3,5-di-O-benzoyl-4-C-benzoyloxymethyl-α-L-arabinofuranosyl)thymine 在 吡啶 、 盐酸 、 偶氮二异丁腈 、 三正丁基氢锡 、 sodium methylate 、 1,8-二氮杂双环[5.4.0]十一碳-7-烯 作用下， 以 甲醇 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 甲苯 、 乙腈 为溶剂， 反应 5.34h， 生成 1-(2-deoxy-4-C-hydroxymethyl-α-L-erythro-pentofuranosyl)thymine
  参考文献：
  名称：

  Synthesis of 1-(3-Azido-2,3-dideoxy-4-C-hydroxymethyl-α-L-threo-pentofuranosyl)thymine, 1-(2,3-Dideoxy-4-C-hydroxymethyl-α-L-glycero-pentofuranosyl)thymine and 1-(2,3-Dideoxy-4-C-hydroxymethyl-α-L-glycero-pent-2-enofuranosyl)thymine

  摘要：

  1-(2-O-乙酰基-3,5-二-O-苯甲酰基-4-C-苯氧甲基-α-L-阿拉伯呋喃糖基)嘧啶(II)经选择性去乙酰化、甲磺酰化和与1,8-二氮杂双环[5.4.0]十一烯处理转化为2,2'-脱水衍生物V。用氯化氢或溴化氢裂解化合物V中的2,2'-脱水环得到相应的2'-氯和2'-溴衍生物VI和VII。化合物VII与Cu/Zn偶对反应，随后脱苯甲酰化导致1-(2,3-二脱氧-4-C-羟甲基-α-L-戊-2-烯呋喃糖基)嘧啶(IX)。对IX进行催化氢化得到1-(2,3-二脱氧-4-C-羟甲基-α-L-甘油-戊呋喃糖基)嘧啶(X)。用三丁基锡氢化合物VI并脱苯甲酰化得到1-(2-脱氧-4-C-羟甲基-α-L-赤霉-戊呋喃糖基)嘧啶(XII)。化合物XII的三苯甲基化，随后甲磺酰化、去三苯甲基化和亲核取代与叠氮化合物反应得到1-(3-叠氮基-2,3-二脱氧-4-C-羟甲基-α-L-顺-戊呋喃糖基)嘧啶(XXII)。

  DOI：

  10.1135/cccc19930409

文献信息

• Synthesis of 1-(2,3-Dideoxy-4-C-methyl-β-D-glycero-pent-2-enofuranosyl)thymine, 1-(2,3-Dideoxy-4-C-methyl-β-D-glycero-pentofuranosyl)thymine and 1-(4-C-Azidomethyl-2-deoxy-β-D-threo-pentofuranosyl)thymine
  作者：Hubert Hřebabecký、Antonín Holý

  DOI：10.1135/cccc19931668

  日期：——

  Reaction of isopropylidene derivative I with thionyl chloride in hexamethylphosphoric triamide afforded chloro derivative II. Removal of the isopropylidene group in II by treatment with a cation-exchanging resin (H⁺ form) gave the free chloro nucleoside III. reduction of the chloro derivative II with tributylstannane and subsequent removal of the isopropylidene group yielded deoxy derivative V. This was protected with tert-butyldiphenylsilyl group and converted into the mesylate VII. Elimination of the mesyl group followed by desilylation gave 1-(2,3-dideoxy-4-C-methyl-β-D-glycero-pent-2-enofuranosyl)thymine (IX) which was hydrogenated to afford 1-(2,3-dideoxy-4-C-methyl-β-D-glycero-pentofuranosyl)thymine (X). 1-(1-C-Azidomethyl-2-deoxy-β-D-threo-pentofuranosyl)thymine (XIII) was prepared by mesylation of the isopropylidene derivative I, nucleophilic substitution of the mesyl group with azide and removal of the isopropylidene group.

  异丙基亚甲基衍生物I与氯化硫酰在六甲基膦酰胺中反应，生成氯代衍生物II。用阳离子交换树脂（H+形式）处理II中的异丙基亚甲基基团，得到游离氯代核苷III。用三丁基锡还原氯代衍生物II，并随后去除异丙基亚甲基基团，得到脱氧衍生物V。这个化合物被叔丁基二苯基硅基保护，并转化为甲磺酸盐VII。去除甲磺基，随后去除硅基，得到1-(2,3-二去氧-4-C-甲基-β-D-glycero-pent-2-enofuranosyl)胸腺嘧啶（IX），通过氢化反应得到1-(2,3-二去氧-4-C-甲基-β-D-glycero-pentofuranosyl)胸腺嘧啶（X）。通过异丙基亚甲基衍生物I的甲磺化，甲磺基的亲核取代反应以及去除异丙基亚甲基基团，制备出1-(1-C-Azidomethyl-2-deoxy-β-D-threo-pentofuranosyl)胸腺嘧啶（XIII）。