4-amino-N-(2-((2-((3-(dimethylamino)propyl)carbamoyl)-1-methyl-1H-imidazol-4-yl)carbamoyl)-1-methyl-1H-imidazol-4-yl)-1-methyl-1H-imidazole-2-carboxamide | 329038-98-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 唑类
• 英文名称: 4-amino-N-(2-((2-((3-(dimethylamino)propyl)carbamoyl)-1-methyl-1H-imidazol-4-yl)carbamoyl)-1-methyl-1H-imidazol-4-yl)-1-methyl-1H-imidazole-2-carboxamide
• CAS: 329038-98-4
• 化学式: C₂₀H₂₉N₁₁O₃
• 分子量: 471.522
• InChiKey: KUWJRZSAEKTFID-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.34
• 重原子数：
  34.0
• 可旋转键数：
  9.0
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.4
• 拓扑面积：
  170.02
• 氢给体数：
  4.0
• 氢受体数：
  11.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  4-amino-N-(2-((2-((3-(dimethylamino)propyl)carbamoyl)-1-methyl-1H-imidazol-4-yl)carbamoyl)-1-methyl-1H-imidazol-4-yl)-1-methyl-1H-imidazole-2-carboxamide 在 palladium on activated charcoal 氢气 、 1-羟基苯并三唑 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 作用下， 以 甲醇 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 20.0 ℃ 、344.74 kPa 条件下， 反应 14.0h， 生成
  参考文献：
  名称：

  新型吡咯并[2,1-c][1,4]苯二氮卓-咪唑聚酰胺偶联物的设计与合成

  摘要：

  合成了一系列含有咪唑单元的新型吡咯并 [2,1c][1,4] 苯并二氮杂 (PBD) 聚酰胺缀合物 (1-5) 作为 DNA 小沟结合剂。引言 目前，人们对含有吡咯并[2,lc][l,^苯并二氮杂 (PBD) 基团的抗肿瘤抗生素的甲醇胺的合成方面和生物作用机制感兴趣，其成员包括蒽霉素、托美霉素、新霉素A 和 B，西伯霉素、马西霉素、奇卡霉素、原丝菌素 DC-81 和右旋霉素 (1)。它们的不同之处在于芳族 Aring 和吡咯烷 C 环中取代基的数量、类型和位置，以及 Cring 的饱和度，Cring 可以在 C2-C3（内环）上完全饱和或不饱和或 C2（外环）。这些分子在其作用机制方面的一个关键特征是 N10-C11 甲醇胺（或亚胺等效物）部分。这是一个负责 DNA 烷基化的亲电中心。插入小沟后，通过亲核攻击 PBD 亲电子 Cl 1 位置的鸟嘌呤碱基 N2 形成氨基键，从而在 DNA 的小沟中形成共价加合物

  DOI：

  10.1515/hc.2002.8.1.19
• 作为产物：
  描述：

  N-[3-(dimethylamino)propyl]-1-methyl-4-[(1-methyl-4-nitroimidazole-2-carboxamido)imidazole-2-carboxamido]imidazole-2-carboxamide 在 sodium tetrahydroborate 、 palladium on activated charcoal 作用下， 以 甲醇 、 水 、 乙酸乙酯 为溶剂， 生成 4-amino-N-(2-((2-((3-(dimethylamino)propyl)carbamoyl)-1-methyl-1H-imidazol-4-yl)carbamoyl)-1-methyl-1H-imidazol-4-yl)-1-methyl-1H-imidazole-2-carboxamide
  参考文献：
  名称：

  吡咯/咪唑 CPI 偶联物的高效序列特异性 DNA 链间交联

  摘要：

  我们通过合成吡咯 (Py)/咪唑 (Im)-二酰胺-CPI 偶联物 ImPyLDu86 (1) 的二聚体，使用七种不同的接头连接，开发了一种新型 DNA 链间交联剂。四亚甲基接头化合物 7b 仅在伴侣三酰胺 ImImPy 存在的情况下有效地在九个碱基对序列 5'-PyGGC(T/A)GCCPu-3' 处产生 DNA 链间交联。为了通过 7b 与 ImImPy 进行有效交联，需要两个识别位点之间的一个 AT 碱基对来容纳接头区域。消除 AT 碱基对和插入额外的 AT 碱基对并用 GC 碱基对替换显着降低了交联程度。在存在各种三酰胺的情况下，还检查了 7b 的链间交联的序列特异性。与 ImImPy 相比，ImImIm 的存在略微减少了交联产物的形成。错配伙伴 ImPyPy 和 PyImPy 不与 7b 产生链间交联产物，而 ImPyPy 和 PyImPy 在其与 7b 的匹配位点诱导有效烷基化。使用变性聚丙烯酰胺凝胶电泳和

  DOI：

  10.1021/ja028459b

文献信息

• Synthesis of Geometrically Constrained Unsymmetrical Bis(polyamides) Related to the Antiviral Distamycin
  作者：Sanjay K. Sharma、Manju Tandon、J. William Lown

  DOI：10.1002/1099-0690(200006)2000:11<2095::aid-ejoc2095>3.0.co;2-j

  日期：2000.6

  for the strict DNA base-sequence recognition of (AT)4 and (AT)5, respectively, for the oligopeptide minor-groove binding agents netropsin (I) and distamycin (II) leads to proposals for the rational structure modification for altered base recognition. In this paper we report the synthesis of unsymmetrical imidazo-pyrrolo-bis(polyamides), structurally related to the natural antiviral agents distamycin

  分析分别对（AT）4和（AT）5的寡肽小沟结合剂netropsin（I）和distamycin（II）的严格DNA碱基序列识别的结构和立体化学要求导致了对合理的结构修饰，以改变碱基识别。在本文中，我们报告了与天然抗病毒剂双歧霉素在结构上相关且带有非天然（25-27）或天然（31-33）的不对称咪唑并吡咯并双（聚酰胺）的合成）由柔性或刚性接头链接的末端。这是关于在连接的双（聚酰胺）中具有二甲基氨基丙基或am基末端的带有咪唑的结构的合成的首次报道。
• A General Solution- and Solid-Phase Synthetic Procedure for Incorporating Three Contiguous Imidazole Moieties into DNA Sequence Reading Polyamides
  作者：Sanjay K. Sharma、Manju Tandon、J. William Lown

  DOI：10.1021/jo001034s

  日期：2001.2.1