6-Oxo-heptanoic acid {4-[9-((3aR,4R,6R,6aR)-6-hydroxymethyl-2,2-dimethyl-tetrahydro-furo[3,4-d][1,3]dioxol-4-yl)-9H-purin-6-ylamino]-butyl}-amide | 280577-96-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 英文名称: 6-Oxo-heptanoic acid {4-[9-((3aR,4R,6R,6aR)-6-hydroxymethyl-2,2-dimethyl-tetrahydro-furo[3,4-d][1,3]dioxol-4-yl)-9H-purin-6-ylamino]-butyl}-amide
• CAS: 280577-96-0
• 化学式: C₂₄H₃₆N₆O₆
• 分子量: 504.586
• InChiKey: VMHAVGRNRCWHJR-UGTJMOTHSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.69
• 重原子数：
  36.0
• 可旋转键数：
  13.0
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.71
• 拓扑面积：
  149.72
• 氢给体数：
  3.0
• 氢受体数：
  11.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  6-Oxo-heptanoic acid {4-[9-((3aR,4R,6R,6aR)-6-hydroxymethyl-2,2-dimethyl-tetrahydro-furo[3,4-d][1,3]dioxol-4-yl)-9H-purin-6-ylamino]-butyl}-amide 在 三氟乙酸 作用下， 反应 0.5h， 以65%的产率得到6-Oxo-heptanoic acid {4-[9-((2R,3R,4S,5R)-3,4-dihydroxy-5-hydroxymethyl-tetrahydro-furan-2-yl)-9H-purin-6-ylamino]-butyl}-amide
  参考文献：
  名称：

  Synthesis of Methylketone Containing Nucleoside Triphosphates for RNA Labelling

  摘要：

  The three nucleoside triphosphates 1, 2 and 3 bearing a linker with a terminal methylketone group were prepared for incorporation into RNA fragments and post-labelling by the fluorescein derivative 4 containing an aminooxy group. (C) 2000 Elsevier Science Ltd. All rights reserved.

  DOI：

  10.1016/s0040-4020(00)00577-9
• 作为产物：
  描述：

  在 四丁基氟化铵 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 1.0h， 以0.860 g的产率得到6-Oxo-heptanoic acid {4-[9-((3aR,4R,6R,6aR)-6-hydroxymethyl-2,2-dimethyl-tetrahydro-furo[3,4-d][1,3]dioxol-4-yl)-9H-purin-6-ylamino]-butyl}-amide
  参考文献：
  名称：

  Functionalized polynucleotide compound, optionally marked and method for detecting a target nucleic acid

  摘要：

  该发明涉及一种通式（I）的官能化化合物：其中W代表核苷酸类似物，L代表至少四个原子的连接臂，R1代表线性或支链烷基链，包括至少一种所述化合物的官能化多核苷酸以及包括至少一种与通式（I'）相对应的官能化化合物的标记官能化多核苷酸。描述了使用所述化合物检测目标核酸的方法。

  公开号：

  US06875858B1