N4-(phenoxyacetyl)-2'-O-(tetrahydro-4-methoxy-2H-pyran-4-yl)citidine 3'-(2-cyanoethyl N,N-diisopropylphoshoramidite) 5'-[2-(2-nitrophenyl)propyl carbonate] | 1293390-72-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 核苷和核苷酸类似物
• 英文名称: N4-(phenoxyacetyl)-2'-O-(tetrahydro-4-methoxy-2H-pyran-4-yl)citidine 3'-(2-cyanoethyl N,N-diisopropylphoshoramidite) 5'-[2-(2-nitrophenyl)propyl carbonate]
• CAS: 1293390-72-3
• 化学式: C₄₂H₅₅N₆O₁₄P
• 分子量: 898.904
• InChiKey: QISMAWVERQOQTP-FWOQVGKZSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  6.22
• 重原子数：
  63.0
• 可旋转键数：
  22.0
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.55
• 拓扑面积：
  234.3
• 氢给体数：
  1.0
• 氢受体数：
  18.0

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  胞苷 在 吡啶 、 四氮唑 、 D(+)-10-樟脑磺酸 、 四丁基氟化铵 、 六甲基二硅氮烷 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 、 水 为溶剂， 反应 90.67h， 生成 N4-(phenoxyacetyl)-2'-O-(tetrahydro-4-methoxy-2H-pyran-4-yl)citidine 3'-(2-cyanoethyl N,N-diisopropylphoshoramidite) 5'-[2-(2-nitrophenyl)propyl carbonate]
  参考文献：
  名称：

  核苷酸。第LXXIX部分

  摘要：

  两个系列的新的核糖核苷3'-亚磷酰胺（参见36 - 42）承载光不稳定[2-（2-硝基苯基）丙氧基]羰基处的5'- Ò位上被合成和表征作为用于光刻合成单体结构单元RNA芯片。通过2-（4-硝基苯基）乙基（npe）和[2-（4-硝基苯基）乙氧基]羰基（npeoc）基团以众所周知的方式实现了碱保护。碳水化合物部分还带有2' - O-（四氢-4-甲氧基-2 H-吡喃-4-基）基团以阻断2'-OH功能。

  DOI：

  10.1002/hlca.201000403