3-aminopropyl (2-acetamido-2-deoxy-α-D-galactopyranosyl)-(1->6)-(β-D-galactopyranosyl)-(1->4)-(2-acetamido-2-deoxy-β-D-glucopyranosyl)-(1->3)-(β-D-galactopyranosyl)-(1->4)-β-D-glucopyranoside | 1236040-06-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: 3-aminopropyl (2-acetamido-2-deoxy-α-D-galactopyranosyl)-(1->6)-(β-D-galactopyranosyl)-(1->4)-(2-acetamido-2-deoxy-β-D-glucopyranosyl)-(1->3)-(β-D-galactopyranosyl)-(1->4)-β-D-glucopyranoside
• CAS: 1236040-06-4
• 化学式: C₃₇H₆₅N₃O₂₆
• 分子量: 967.928
• InChiKey: IZYKLJNKRQKXDF-VAPBDJLNSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -11.26
• 重原子数：
  66.0
• 可旋转键数：
  19.0
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.95
• 拓扑面积：
  459.74
• 氢给体数：
  17.0
• 氢受体数：
  27.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  3-aminopropyl (2-acetamido-2-deoxy-α-D-galactopyranosyl)-(1->6)-(β-D-galactopyranosyl)-(1->4)-(2-acetamido-2-deoxy-β-D-glucopyranosyl)-(1->3)-(β-D-galactopyranosyl)-(1->4)-β-D-glucopyranoside 、 3,4-二甲氧基-3-环丁烯-1,2-二酮 在 三乙胺 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 反应 8.0h， 生成
  参考文献：
  名称：

  Synthesis of 6-PEtN-α-D-GalpNAc-(1–>6)-β-D-Galp-(1–>4)-β-D-GlcpNAc-(1–>3)-β-D-Galp-(1–>4)-β-D-Glcp, a Haemophilus influenzae lipopolysacharide structure, and biotin and protein conjugates thereof

  摘要：

  背景：在缺少O抗原多糖部分的细菌中，核心结构暴露在感染时免疫系统中，因此可以考虑和研究它们作为糖基共轭疫苗中的碳水化合物表面抗原。一种来自流感嗜血杆菌LPS的建议结构是磷酸化的五糖基6-PEtN-α-D-GalpNAc-(1→6)-β-D-Galp-(1→4)-β-D-GlcpNAc-(1→3)-β-D-Galp-(1→4)-β-D-Glcp。 结果：从含间隔的乳糖衍生物开始，通过使用NIS/AgOTf作为促进剂，使用两个硫代糖苷供体（葡萄糖胺残基和半乳糖衍生物）进行连续耦合，构建了一个合适的保护的乳糖-N-新四糖四糖结构。去除非还原末端残基的硅保护基，得到一个受体，通过使用2-叠氮基溴糖和卤化物辅助耦合条件，引入了末端α-半乳糖胺基团。全局去保护后得到非磷酸化的目标五糖基，而从非还原末端残基中去除硅基团产生了一个自由的羟基，使用H-膦酸酯化学将其磷酸化，得到含磷酸乙醇胺的保护五糖基。部分去保护后得到含自由间隔氨基团但保护的磷酸乙醇胺基团的磷酸化目标五糖基。将间隔氨基团与生物素或二甲基方酸结合，去除磷酸乙醇胺基团并在二甲基方酸衍生物的情况下进一步与蛋白质反应，得到了标题共轭物。 结论：已成功合成了一种具有生物学意义的五糖基结构。目标五糖基是一种α-GalNAc取代的乳糖-N-新四糖结构，包括一个磷酸乙醇胺基团和一个间隔糖基。通过间隔糖基，构建了标题化合物的生物素和蛋白质共轭物，以便在生物实验中进一步使用。

  DOI：

  10.3762/bjoc.6.80
• 作为产物：
  描述：

  3-(N-benzyloxycarbonyl)-aminopropyl (2-acetamido-3,4-di-O-benzyl-2-deoxy-α-D-galactopyranosyl)-(1->6)-(4-O-benzyl-β-D-galactopyranosyl)-(1->4)-(2-acetamido-6-O-benzyl-2-deoxy-β-D-glucopyranosyl)-(1->3)-(2,4,6-tri-O-benzyl-β-D-galactopyranosyl)-(1->4)-2,3,6-tri-O-benzyl-β-D-glucopyranoside 在 盐酸 、 palladium 10% on activated carbon 、 氢气 作用下， 以 甲醇 、 水 为溶剂， 反应 1.0h， 以66%的产率得到3-aminopropyl (2-acetamido-2-deoxy-α-D-galactopyranosyl)-(1->6)-(β-D-galactopyranosyl)-(1->4)-(2-acetamido-2-deoxy-β-D-glucopyranosyl)-(1->3)-(β-D-galactopyranosyl)-(1->4)-β-D-glucopyranoside
  参考文献：
  名称：

  Synthesis of 6-PEtN-α-D-GalpNAc-(1–>6)-β-D-Galp-(1–>4)-β-D-GlcpNAc-(1–>3)-β-D-Galp-(1–>4)-β-D-Glcp, a Haemophilus influenzae lipopolysacharide structure, and biotin and protein conjugates thereof

  摘要：

  背景：在缺少O抗原多糖部分的细菌中，核心结构暴露在感染时免疫系统中，因此可以考虑和研究它们作为糖基共轭疫苗中的碳水化合物表面抗原。一种来自流感嗜血杆菌LPS的建议结构是磷酸化的五糖基6-PEtN-α-D-GalpNAc-(1→6)-β-D-Galp-(1→4)-β-D-GlcpNAc-(1→3)-β-D-Galp-(1→4)-β-D-Glcp。 结果：从含间隔的乳糖衍生物开始，通过使用NIS/AgOTf作为促进剂，使用两个硫代糖苷供体（葡萄糖胺残基和半乳糖衍生物）进行连续耦合，构建了一个合适的保护的乳糖-N-新四糖四糖结构。去除非还原末端残基的硅保护基，得到一个受体，通过使用2-叠氮基溴糖和卤化物辅助耦合条件，引入了末端α-半乳糖胺基团。全局去保护后得到非磷酸化的目标五糖基，而从非还原末端残基中去除硅基团产生了一个自由的羟基，使用H-膦酸酯化学将其磷酸化，得到含磷酸乙醇胺的保护五糖基。部分去保护后得到含自由间隔氨基团但保护的磷酸乙醇胺基团的磷酸化目标五糖基。将间隔氨基团与生物素或二甲基方酸结合，去除磷酸乙醇胺基团并在二甲基方酸衍生物的情况下进一步与蛋白质反应，得到了标题共轭物。 结论：已成功合成了一种具有生物学意义的五糖基结构。目标五糖基是一种α-GalNAc取代的乳糖-N-新四糖结构，包括一个磷酸乙醇胺基团和一个间隔糖基。通过间隔糖基，构建了标题化合物的生物素和蛋白质共轭物，以便在生物实验中进一步使用。

  DOI：

  10.3762/bjoc.6.80