(2S)-ethylmalonyl-CoA | 79082-18-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 脂质和类脂质分子 - 脂肪酰基
• 英文名称: (2S)-ethylmalonyl-CoA
• 英文别名: (2S)-2-ethylmalonyl-CoA；(S)-ethylmalonyl-CoA；(2S)-2-[2-[3-[[(2R)-4-[[[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-hydroxy-3-phosphonooxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-hydroxyphosphoryl]oxy-2-hydroxy-3,3-dimethylbutanoyl]amino]propanoylamino]ethylsulfanylcarbonyl]butanoic acid
• CAS: 79082-18-1
• 化学式: C₂₆H₄₂N₇O₁₉P₃S
• 分子量: 881.642
• InChiKey: VUGZQVCBBBEZQE-UQCJFRAESA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -5
• 重原子数：
  56
• 可旋转键数：
  23
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.65
• 拓扑面积：
  426
• 氢给体数：
  10
• 氢受体数：
  24

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (2S)-ethylmalonyl-CoA 、 L-1-pyrroline-5-carboxylic acid 在 CarB W₇₉F 作用下， 生成 (2S,5S)-5-((R)-1-Carboxypropyl)pyrrolidine-2-carboxylic acid
  参考文献：
  名称：

  工程化羧甲基脯氨酸合酶催化的立体选择性 C-C 键形成

  摘要：

  烯醇（酸酯）与亲电试剂的反应广泛用于有机合成中，用于立体选择性 C-C 键的形成。基于蛋白质的催化剂在通过烯醇化物化学选择性形成 C-C 键的立体选择性形成方面的应用相对有限。我们描述了对巴豆酶超家族成员 5-羧甲基脯氨酸合酶的蛋白质工程研究，旨在通过控制三取代的烯醇中间体来实现立体选择性 C-C 键形成，从而产生N-杂环。活性位点取代，包括氧阴离子结合位点，能够产生取代的N-通过立体控制的烯醇化物形成和反应产生高非对映体过量的杂环。结果揭示了普遍存在的巴豆糖酶超家族作为控制烯醇化物化学的适应性催化剂的潜力。

  DOI：

  10.1038/nchem.1011
• 作为产物：
  描述：

  crotonyl-CoA 在 Streptomyces sp. SN-593 RevT carboxylating enoyl-thioester reductase 、 碳酸氢钠 、 还原型辅酶II(NADPH)四钠盐 作用下， 反应 3.0h， 生成 (2S)-ethylmalonyl-CoA 、 辅酶 A S-丁酸酯
  参考文献：
  名称：

  从中心代谢和聚酮化合物的生物合成中筛选和工程化羧化还原酶的合成潜力

  摘要：

  羧化烯酰硫酯还原酶（ECR）是最近发现的一类酶。它们催化高效添加CO 2与α，β-不饱和CoA-硫酯的双键结合，具有两个生物学功能。在许多细菌的初级代谢中，它们在吸收中央代谢物乙酰辅酶A的过程中会产生乙基丙二酰辅酶A。在次级代谢中，它们提供独特的α-羧基-酰基-硫代酯，以改变许多聚酮化合物天然产物的主链。使用各种可能的底物库系统评估了不同的ECR。我们鉴定了三个活性位点残基，以区分仅限于C4和C5-烯酰基-CoA的ECR和高度混杂的ECR，并成功地设计了一种选定的ECR作为原理证明。这项研究定义了ECR反应性的分子基础，从而可以预测和操纵天然产物多样化中的关键反应。

  DOI：

  10.1002/anie.201505282

文献信息

• Uncovering the Formation and Selection of Benzylmalonyl-CoA from the Biosynthesis of Splenocin and Enterocin Reveals a Versatile Way to Introduce Amino Acids into Polyketide Carbon Scaffolds
  作者：Chenchen Chang、Rong Huang、Yan Yan、Hongmin Ma、Zheng Dai、Benying Zhang、Zixin Deng、Wen Liu、Xudong Qu

  DOI：10.1021/jacs.5b00728

  日期：2015.4.1

  polyketide structural diversification. Yet, this scope is currently restricted to simple aliphatic groups due to (1) limited variety of CoA-linked extender units, which lack aromatic structures and chemical reactivity, and (2) narrow acyltransferase (AT) specificity, which is limited to aliphatic CoA-linked extender units. In this report, we uncovered and characterized the first aromatic CoA-linked

  通过生物合成工程选择性修饰碳支架对于聚酮化合物结构多样化很重要。然而，这一范围目前仅限于简单的脂肪族基团，因为 (1) CoA 连接的扩展单元种类有限，缺乏芳香结构和化学反应性，以及 (2) 酰基转移酶 (AT) 特异性窄，仅限于脂肪族 CoA连接的扩展器单元。在本报告中，我们发现并表征了来自链霉菌属中脾脏素和肠毒素的生物合成途径的第一个芳香 CoA 连接的扩展单元苄基丙二酰辅酶 A。CNQ431。其合成采用脱氨/还原羧化策略将苯丙氨酸转化为苄基丙二酰辅酶 A，从而在氨基酸和辅酶 A 连接的扩展单元合成之间建立联系。通过对其选择的表征，我们进一步验证了脾脏的 AT 结构域和抗霉素聚酮化合物合酶能够选择该扩展单元将苯基引入其双内酯支架中。参与形成这种扩展单元的生物合成机制是高度通用的，可以潜在地针对酪氨酸、组氨酸和天冬氨酸进行定制。所公开的芳香族扩展单元、面向氨基酸的合成途径和芳香族选择性 AT
• An Atypical Acyl‐CoA Synthetase Enables Efficient Biosynthesis of Extender Units for Engineering a Polyketide Carbon Scaffold
  作者：Mengmeng Zheng、Jun Zhang、Wan Zhang、Lu Yang、Xiaoli Yan、Wenya Tian、Zhihao Liu、Zhi Lin、Zixin Deng、Xudong Qu

  DOI：10.1002/anie.202208734

  日期：2022.10.24

  new acyl-CoA synthetase (ACS, UkaQ) with broad substrate specificity and an unusual catalytic mode was identified. Its stability and catalytic activity were remarkably improved by protein engineering, enabling it to synthesize a large variety of acyl-CoAs. In combination with permissive carboxylases, diverse extender units were synthesized and used to engineer the polyketide carbon scaffold of antimycin

  鉴定了一种具有广泛底物特异性和不寻常催化模式的新型酰基辅酶 A 合成酶（ACS，UkaQ）。蛋白质工程显着提高了其稳定性和催化活性，使其能够合成多种酰基辅酶 A。结合允许的羧化酶，合成了多种扩展单元，并用于设计抗霉素的聚酮化合物碳支架。
• Biosynthesis of Salinosporamides from α,β-Unsaturated Fatty Acids: Implications for Extending Polyketide Synthase Diversity
  作者：Yuan Liu、Christopher Hazzard、Alessandra S. Eustáquio、Kevin A. Reynolds、Bradley S. Moore

  DOI：10.1021/ja9042824

  日期：2009.8.5

  A new series of coenzyme A-tethered polyketide synthase extender units were discovered in relation to the biosynthesis of the salinosporamide family of anticancer agents from the marine bacterium Salinispora tropica. In vivo and in vitro experiments revealed that the crotonyl-CoA reductase/carboxylase SalG has broad substrate tolerance toward 2-alkenyl-CoAs that give rise to the salinosporamide C-2 substitution pattern.
• METHOD OF DIRECTING BIOSYNTHESIS OF SPECIFIC POLYKETIDES
  申请人：ABBOTT LABORATORIES

  公开号：EP0626806A1

  公开（公告）日：1994-12-07
• PROCESS FOR PREPARATION OF TACROLIMUS
  申请人：LEK Pharmaceuticals d.d.

  公开号：EP2451955A1

  公开（公告）日：2012-05-16