crotonyl-CoA | 992-67-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 脂质和类脂质分子 - 脂肪酰基
• 英文名称: crotonyl-CoA
• 英文别名: crotonoyl-CoA；S-[2-[3-[[(2R)-4-[[[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-hydroxy-3-phosphonooxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-hydroxyphosphoryl]oxy-2-hydroxy-3,3-dimethylbutanoyl]amino]propanoylamino]ethyl] but-2-enethioate
• CAS: 992-67-6
• 化学式: C₂₅H₄₀N₇O₁₇P₃S
• 分子量: 835.617
• InChiKey: KFWWCMJSYSSPSK-CITAKDKDSA-N

物化性质

• 密度：
  1.82±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -4.8
• 重原子数：
  53
• 可旋转键数：
  21
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.6
• 拓扑面积：
  389
• 氢给体数：
  9
• 氢受体数：
  22

上下游信息

• 上游原料

  中文名称	英文名称	CAS号	化学式	分子量
  辅酶 A	coenzyme A	85-61-0	C21H36N7O16P3S	767.541

• 下游产品

  中文名称	英文名称	CAS号	化学式	分子量
  辅酶 A S-丁酸酯	butyryl coenzyme A	2140-48-9	C25H42N7O17P3S	837.632
  ——	(2S)-ethylmalonyl-CoA	79082-18-1	C26H42N7O19P3S	881.642
  ——	ethylmalonyl-CoA	6049-57-6	C26H42N7O19P3S	881.642

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  尼拉霉素 、 crotonyl-CoA 在 C-terminal hexahistidine-tagged aminoglycoside acetyltransferase(6')-APH(2") 作用下， 反应 0.5h， 生成
  参考文献：
  名称：

  探索化学酶法生成 N-酰化氨基糖苷类药物修饰酶的底物混杂性

  摘要：

  创建合成工具：我们开发了一种化学酶法，使用氨基糖苷乙酰转移酶和酰基辅酶 A 生产 N-酰化氨基糖苷。该方法能够快速生产，然后对合成上具有挑战性的氨基糖苷进行抗菌测试。

  DOI：

  10.1002/cbic.200900584
• 作为产物：
  描述：

  巴豆酸酐 、 辅酶 A 在 碳酸氢钠 作用下， 反应 1.0h， 生成 crotonyl-CoA
  参考文献：
  名称：

  植物甾醇分解代谢的双重作用还原酶可有效生产有价值的类固醇前体

  摘要：

  4-雄烯二酮（4-AD）和孕酮（PG）是合成类固醇药物的两个最重要的前体，但是它们目前的生产过程效率低下，环境问题严峻。在这项研究中，我们破译了植物甾醇分解代谢中的双重作用还原酶（mnOpccR），该酶参与两个不同的代谢分支，从而通过一个关键的中间体20-羟甲基pregn-4-ene-3-one（4-HBC）产生。分别减少3-氧代4-孕烯20-羧基CoA（3-OPC-CoA）和2-e减少3-氧代-4-孕烯20-羧基醛（3-OPA） 。新生分枝杆菌中mnOpccR的失活或过表达可以从植物甾醇中独家生产4-AD或4-HBC。通过两步合成，可以以可扩展的方式（100克规模）将4-HBC有效地转化为PG。这项研究破译了植物甾醇分解代谢的关键生物合成机制，并提供了4-AD和PG的非常有效的生产途径。

  DOI：

  10.1002/anie.202015462

文献信息

• Screening and Engineering the Synthetic Potential of Carboxylating Reductases from Central Metabolism and Polyketide Biosynthesis
  作者：Dominik M. Peter、Lennart Schada von Borzyskowski、Patrick Kiefer、Philipp Christen、Julia A. Vorholt、Tobias J. Erb

  DOI：10.1002/anie.201505282

  日期：2015.11.2

  Carboxylating enoyl‐thioester reductases (ECRs) are a recently discovered class of enzymes. They catalyze the highly efficient addition of CO2 to the double bond of α,β‐unsaturated CoA‐thioesters and serve two biological functions. In primary metabolism of many bacteria they produce ethylmalonyl‐CoA during assimilation of the central metabolite acetyl‐CoA. In secondary metabolism they provide distinct

  羧化烯酰硫酯还原酶（ECR）是最近发现的一类酶。它们催化高效添加CO 2与α，β-不饱和CoA-硫酯的双键结合，具有两个生物学功能。在许多细菌的初级代谢中，它们在吸收中央代谢物乙酰辅酶A的过程中会产生乙基丙二酰辅酶A。在次级代谢中，它们提供独特的α-羧基-酰基-硫代酯，以改变许多聚酮化合物天然产物的主链。使用各种可能的底物库系统评估了不同的ECR。我们鉴定了三个活性位点残基，以区分仅限于C4和C5-烯酰基-CoA的ECR和高度混杂的ECR，并成功地设计了一种选定的ECR作为原理证明。这项研究定义了ECR反应性的分子基础，从而可以预测和操纵天然产物多样化中的关键反应。
• [EN] ENZYMATIC PRODUCTION OF ACRYLYL-COA OR ETHYLENE FROM GLYCEROL<br/>[FR] PRODUCTION ENZYMATIQUE D'ACRYLYL-COA OU D'ÉTHYLÈNE À PARTIR DE GLYCÉROL
  申请人：GLOBAL BIOENERGIES

  公开号：WO2016097289A1

  公开（公告）日：2016-06-23

  Described is a method for the production of acrylyl-CoA from glycerol comprising the following steps: (a) the enzymatic conversion of glycerol into 3-hydroxypropionaldehyde; (b) the enzymatic conversion of said 3-hydroxypropionaldehyde into 3-hydroxypropionyl-CoA; and (c) the enzymatic conversion of said 3-hydroxypropionyl-CoA into acrylyl-CoA. Further enzymatic conversion of acrylyl-CoA into other products are disclosed. Further described is a method for the production of ethylene comprising the enzymatic conversion of propionic acid into ethylene. It is described that the enzymatic conversion of propionic acid into ethylene can be achieved by making use of a cytochrome P450 fatty acid decarboxylase or a non-heme iron oxygenase. Further, it is described that said propionic acid can be obtained by the enzymatic conversion of acrylyl-CoA into said propionic acid.

  描述了一种从甘油生产丙烯酰辅酶A的方法，包括以下步骤：(a) 将甘油酶转化为3-羟基丙醛；(b) 将所述3-羟基丙醛酶转化为3-羟基丙酰辅酶A；以及(c) 将所述3-羟基丙酰辅酶A酶转化为丙烯酰辅酶A。进一步披露了丙烯酰辅酶A的进一步酶转化为其他产品的方法。进一步描述了一种生产乙烯的方法，包括将丙酸酶转化为乙烯。描述了通过利用细胞色素P450脂肪酸脱羧酶或非血红素铁氧酶将丙酸酶转化为乙烯的方法。此外，还描述了通过将丙烯酰辅酶A酶转化为所述丙酸来获得所述丙酸的方法。
• Uncovering the Formation and Selection of Benzylmalonyl-CoA from the Biosynthesis of Splenocin and Enterocin Reveals a Versatile Way to Introduce Amino Acids into Polyketide Carbon Scaffolds
  作者：Chenchen Chang、Rong Huang、Yan Yan、Hongmin Ma、Zheng Dai、Benying Zhang、Zixin Deng、Wen Liu、Xudong Qu

  DOI：10.1021/jacs.5b00728

  日期：2015.4.1

  polyketide structural diversification. Yet, this scope is currently restricted to simple aliphatic groups due to (1) limited variety of CoA-linked extender units, which lack aromatic structures and chemical reactivity, and (2) narrow acyltransferase (AT) specificity, which is limited to aliphatic CoA-linked extender units. In this report, we uncovered and characterized the first aromatic CoA-linked

  通过生物合成工程选择性修饰碳支架对于聚酮化合物结构多样化很重要。然而，这一范围目前仅限于简单的脂肪族基团，因为 (1) CoA 连接的扩展单元种类有限，缺乏芳香结构和化学反应性，以及 (2) 酰基转移酶 (AT) 特异性窄，仅限于脂肪族 CoA连接的扩展器单元。在本报告中，我们发现并表征了来自链霉菌属中脾脏素和肠毒素的生物合成途径的第一个芳香 CoA 连接的扩展单元苄基丙二酰辅酶 A。CNQ431。其合成采用脱氨/还原羧化策略将苯丙氨酸转化为苄基丙二酰辅酶 A，从而在氨基酸和辅酶 A 连接的扩展单元合成之间建立联系。通过对其选择的表征，我们进一步验证了脾脏的 AT 结构域和抗霉素聚酮化合物合酶能够选择该扩展单元将苯基引入其双内酯支架中。参与形成这种扩展单元的生物合成机制是高度通用的，可以潜在地针对酪氨酸、组氨酸和天冬氨酸进行定制。所公开的芳香族扩展单元、面向氨基酸的合成途径和芳香族选择性 AT
• Rational Control of Polyketide Extender Units by Structure‐Based Engineering of a Crotonyl‐CoA Carboxylase/Reductase in Antimycin Biosynthesis
  作者：Lihan Zhang、Takahiro Mori、Qingfei Zheng、Takayoshi Awakawa、Yan Yan、Wen Liu、Ikuro Abe

  DOI：10.1002/anie.201506899

  日期：2015.11.2

  Bioengineering of natural product biosynthesis is a powerful approach to expand the structural diversity of bioactive molecules. However, in polyketide biosynthesis, the modification of polyketide extender units, which form the carbon skeletons, has remained challenging. Herein, we report the rational control of polyketide extender units by the structure‐based engineering of a crotonyl‐CoA carboxylase/reductase

  天然产物生物合成的生物工程是扩大生物活性分子结构多样性的有力方法。然而，在聚酮化合物的生物合成中，形成碳骨架的聚酮化合物增量剂单元的修饰仍然具有挑战性。本文中，我们报告了在抗霉素的生物合成中，通过巴豆酰-CoA羧化酶/还原酶（CCR）的基于结构的工程对聚酮化合物扩展单元的合理控制。CCR酶AntE的定点诱变，受以1.5Å分辨率解析的晶体结构的引导，通过V350G突变扩大了其底物范围，从而提供了吲哚基甲基丙二酰辅酶A。突变体A182L在常规还原过程中选择性催化了羧化反应。此外，带有AntE V350G的链霉菌菌株。这些发现加深了我们对CCRs分子机制的理解，CCRs将作为通用的生物催化剂来操纵结构单元，并为合理设计聚酮化合物的生物合成奠定了基础。
• Enzymatic Synthesis of Dilactone Scaffold of Antimycins
  作者：Moriah Sandy、Zhe Rui、Joe Gallagher、Wenjun Zhang

  DOI：10.1021/cb300416w

  日期：2012.12.21

  cluster for antimycins was recently identified, the enzymatic logic that governs the synthesis of antimycins has not yet been revealed. In this work, the biosynthetic pathway for antimycins was dissected by both genetic and enzymatic studies for the first time. A minimum set of enzymes needed for generation of the antimycin dilactone scaffold were identified, featuring a hybrid nonribosomal peptide synthetase

  抗霉素是一类天然产物，具有出色的生物活性和独特的结构，已经引起化学家半个多世纪的兴趣。抗霉素的结构骨架建立在九元双内酯环上，该环包含一个烷基，一个酰氧基，两个甲基部分和一个与3-甲酰胺基水杨酸相连的酰胺键。尽管最近鉴定了抗霉素的生物合成基因簇，但尚未揭示控制抗霉素合成的酶学逻辑。在这项工作中，首次通过遗传和酶学研究剖析了抗霉素的生物合成途径。确定了产生抗霉素双内酯支架所需的最少一组酶，顺式和反式作用成分。基于这种NRPS-PKS机械的底物混杂性，使用体外酶促全合成技术进一步生产了几种抗霉素类似物。