N²,N⁶-di(quinolin-3-yl)pyridine-2,6-dicarboxamide | 737763-53-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 喹啉及其衍生物
• 英文名称: N²,N⁶-di(quinolin-3-yl)pyridine-2,6-dicarboxamide
• 英文别名: N2,N6-di(quinolin-3-yl)pyridine-2,6-dicarboxamide；2-N,6-N-di(quinolin-3-yl)pyridine-2,6-dicarboxamide
• CAS: 737763-53-0
• 化学式: C₂₅H₁₇N₅O₂
• 分子量: 419.442
• InChiKey: JMNNXFSSDFQZSJ-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 沸点：
  570.9±45.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.421±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.7
• 重原子数：
  32
• 可旋转键数：
  4
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.0
• 拓扑面积：
  96.9
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N²,N⁶-di(quinolin-3-yl)pyridine-2,6-dicarboxamide 、 碘甲烷 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 5.0h， 生成 2,6-pyridinedicarboxylic acid 2-[(1-methylquinolinio-3-yl)amide]-6-[(quinolin-3-yl)amide]iodide
  参考文献：
  名称：

  Chemical derivatives as antitelomerase agents which bind specifically to the G-quadruplex DNA structures and their application as a specific anticancer agent

  摘要：

  本发明涉及癌症治疗以及具有相当特异作用机制的新型抗癌药物。它还涉及新型化合物及其在人类治疗中的应用。

  公开号：

  US20070232572A1
• 作为产物：
  描述：

  3-氨基喹啉 、 2,6-氯甲酰吡啶 以 甲苯 为溶剂， 生成 N²,N⁶-di(quinolin-3-yl)pyridine-2,6-dicarboxamide
  参考文献：
  名称：

  Fluorescent anion sensing by bisquinolinium pyridine-2,6-dicarboxamide receptors in water

  摘要：

  我们制备了 N,N′-双（喹啉基）吡啶-2,6-二甲酰胺的三种异构体的 N-甲基喹啉基二icationic 衍生物，并以各自的 N-甲基喹啉鎓苯甲酰胺作为参照化合物，通过晶体结构、光谱和水中的酸碱特性对其进行了表征。用分光光度法测定的二羧酰胺的第一个 pKa 值介于 8.1 和 9.3 之间，对于酰胺类化合物来说是异常低的。3- (1) 和 6- 氨基喹啉 (2) 的二羧酰胺衍生物会受到卤化物、醋酸盐、焦磷酸盐和核苷酸阴离子的有效荧光淬灭，但 5- 氨基喹啉 (3) 衍生物的淬灭效果很小。二羧酰胺的 Stern-Volmer 图的形状表明存在与阴离子的基态络合，而相关的苯甲酰胺则不存在这种络合。通过分析 1 和 2 荧光淬灭效应的浓度曲线，计算出了与阴离子的关联常数 KA。核苷三磷酸酯的淬灭作用比无机阴离子的淬灭作用有效得多。即使是简单的无机阴离子也能与水中的中性酰胺 N-H 给体有效结合，这归因于酰胺的高酸度和受体的预组织刚性结构。

  DOI：

  10.1039/c3ra44363a

文献信息

• Fluorescent anion sensing by bisquinolinium pyridine-2,6-dicarboxamide receptors in water
  作者：Alejandro Dorazco-González、Marcos Flores Alamo、Carolina Godoy-Alcántar、Herbert Höpfl、Anatoly K. Yatsimirsky

  DOI：10.1039/c3ra44363a

  日期：——

  Dicationic N-methylated at quinolyl moieties derivatives of three isomers of N,N′-bis(quinolyl)pyridine-2,6-dicarboxamide, and respective N-methyl quinolinium benzamides as reference compounds, have been prepared and characterized by crystal structures, spectral and acid–base properties in water. First pKa values of dicarboxamides between 8.1 and 9.3 determined spectrophotometrically are unusually low for amides. Dicarboxamide derivatives of 3- (1) and 6-aminoquinoline (2) undergo efficient fluorescence quenching by halide, acetate, pyrophosphate and nucleotide anions but the derivative of 5-aminoquinoline (3) shows very small quenching effects. The shape of Stern–Volmer plots for dicarboxamides indicates the existence of ground state complexation with anions, which is absent for related benzamides. Association constants, KA, with anions were calculated from analysis of concentration profiles of the quenching effects on the fluorescence of 1 and 2. Quenching by nucleoside triphosphates is much more efficient than by inorganic anions. Efficient binding of even simple inorganic anions by neutral amide N–H donors in water is attributed to high acidity of amides and preorganized rigid structure of the receptors.

  我们制备了 N,N′-双（喹啉基）吡啶-2,6-二甲酰胺的三种异构体的 N-甲基喹啉基二icationic 衍生物，并以各自的 N-甲基喹啉鎓苯甲酰胺作为参照化合物，通过晶体结构、光谱和水中的酸碱特性对其进行了表征。用分光光度法测定的二羧酰胺的第一个 pKa 值介于 8.1 和 9.3 之间，对于酰胺类化合物来说是异常低的。3- (1) 和 6- 氨基喹啉 (2) 的二羧酰胺衍生物会受到卤化物、醋酸盐、焦磷酸盐和核苷酸阴离子的有效荧光淬灭，但 5- 氨基喹啉 (3) 衍生物的淬灭效果很小。二羧酰胺的 Stern-Volmer 图的形状表明存在与阴离子的基态络合，而相关的苯甲酰胺则不存在这种络合。通过分析 1 和 2 荧光淬灭效应的浓度曲线，计算出了与阴离子的关联常数 KA。核苷三磷酸酯的淬灭作用比无机阴离子的淬灭作用有效得多。即使是简单的无机阴离子也能与水中的中性酰胺 N-H 给体有效结合，这归因于酰胺的高酸度和受体的预组织刚性结构。
• New (Iso)quinolinyl-pyridine-2,6-dicarboxamide G-Quadruplex Stabilizers. A Structure-Activity Relationship Study
  作者：Enrico Cadoni、Pedro R. Magalhães、Rita M. Emídio、Eduarda Mendes、Jorge Vítor、Josué Carvalho、Carla Cruz、Bruno L. Victor、Alexandra Paulo

  DOI：10.3390/ph14070669

  日期：——

  (G4)-interactive small molecules have a wide range of potential applications, not only as drugs, but also as sensors of quadruplex structures. The purpose of this work is the synthesis of analogues of the bis-methylquinolinium-pyridine-2,6-dicarboxamide G4 ligand 360A, to identify relevant structure–activity relationships to apply to the design of other G4-interactive small molecules bearing bis-quinoline

  G-四链体（G4）相互作用的小分子具有广泛的潜在应用，不仅可以作为药物，还可以作为四链体结构的传感器。这项工作的目的是合成双甲基喹啉鎓-吡啶-2,6-二甲酰胺 G4 配体 360A 的类似物，以确定相关的结构-活性关系，以应用于其他带有双喹啉的 G4 相互作用小分子的设计或双异喹啉部分。热变性实验表明，在酰胺接头和喹啉环的氮之间具有相对 1,4 位的非甲基化衍生物是中等 G4 稳定剂，优选杂化 h-Telo G4，存在于人类端粒。与双链 DNA 相比，在喹啉/异喹啉氮甲基化时插入正电荷可提高化合物选择性稳定 G4 的能力，并优先选择平行结构。其中，在带电荷的甲基喹啉鎓/异喹啉鎓氮和酰胺接头之间具有相对1,3-位的化合物是最好的G4稳定剂。更有趣的是，这些配体在 PCR 终止试验中显示出选择性阻断 DNA 聚合和诱导杂交 h-Telo G4 的 G4 构象转换的不同能力。由 21-nt 序列形成的平行
• Recognition of Anions and Neutral Guests by Dicationic Pyridine-2,6-dicarboxamide Receptors
  作者：Alejandro Dorazco-González、Herbert Höpfl、Felipe Medrano、Anatoly K. Yatsimirsky

  DOI：10.1021/jo100037m

  日期：2010.4.2

  which allows their fluorescent sensing in the μM range. A new methodology for determination of anion binding constants to strongly acidic receptors by inhibitory effects of anions on the receptor deprotonation by an external base has been developed. High affinity and selectivity of anion complexation by dicationic pyridine-2,6-dicarboxamides is attributed to the rigid preorganized structure of receptors

  在的三种异构体的吡啶基或喹啉基部分的衍生物双阳离子N-甲基化Ñ，Ñ ' -双（吡啶基）吡啶-2,6-二甲酰胺（ø - ，米- ，和p - 1）和Ñ，Ñ N'-双（3-喹啉基）吡啶-2,6-二甲酰胺（4）在MeCN（日志强烈结合阴离子ķ在范围3.5-6.5）与氯显着的选择性- ，并且还结合中性脲和酰胺客人日志ķ范围1.1-2.8。m - 1，p - 1三氟甲磺酸盐的晶体结构，和4显示酰胺NH和吡啶鎓邻-CH基团被定向在受体裂缝内部，其四个质子形成半径为ca的圆。2.35最佳列入的Cl - 。阴离子的这些质子的结合从混合三氟甲磺酸酯/氯化物的盐的晶体结构是显而易见的p - 1，1计算（DFT / B3LYP 6-31G **）结构：有Cl所有受体的复合物1 - ，和1 H NMR滴定的结果。在o - 1吡啶鎓N-Me +的晶体结构中这些基团被定向到受体的内部，阻止了阴离子的络合，但是计算结果表
• Synthesis and characterization of <i>C</i>₂-symmetric bis(carboxamide) pincer ligands
  作者：Rufaro Razuwika、Orde Q. Munro

  DOI：10.1039/d3nj05502g

  日期：——

  Tridentate bis(carboxamide) pincers are key ligands used in catalysis, investigational medicinal inorganic compounds, and materials science. This study examined the atropisomerism of a group of bis(carboxamide) pincers with C2 symmetry to elucidate their physical, chemical, and structural behaviour, paving the way for the application of their metal complexes in different fields. One of the five compounds

  三齿双（甲酰胺）钳是催化、研究性药用无机化合物和材料科学中使用的关键配体。本研究检测了一组具有C 2对称性的双(甲酰胺)钳子的阻转异构性，以阐明其物理、化学和结构行为，为其金属配合物在不同领域的应用铺平了道路。通过 X 射线晶体学结构阐明的五种化合物之一1c具有一对分子内约束的异喹啉环取代基，并且在手性 Sohncke 空间群中以对映体纯形式结晶。 PM6 对主要阻转异构化反应坐标1c的 3-D 势能面的计算表明，最低能量构象异构体（阻转异构体）的异喹啉环相对于平面倾斜近 +30° 和 -30°。中心吡啶环。1c的 X 射线结构位于接近该能量最小值的位置。大块固体样品的圆二色性 (CD) 光谱证实存在过量的一种对映体（C 2 -对称阻转异构体），尤其是化合物1c、1e和1f。可以记录溶液中所有化合物的圆二色光谱，同样反映了一种阻转异构体的过量数量。实验光谱通过 CAM-B3LYP/def2-tzvp
• Selective G-quadruplex DNA Stabilizing Agents Based on Bisquinolinium and Bispyridinium Derivatives of 1,8-Naphthyridine
  作者：V. Dhamodharan、S. Harikrishna、C. Jagadeeswaran、K. Halder、P. I. Pradeepkumar

  DOI：10.1021/jo201816g

  日期：2012.1.6

  Various biologically relevant G-quadruplex DNA structures offer a platform for therapeutic intervention for altering the gene expression or by halting the function of proteins associated with telomeres. One of the prominent strategies to explore the therapeutic potential of quadruplex DNA structures is by stabilizing them with small molecule ligands. Here we report the synthesis of bisquinolinium and bispyridinium derivatives of 1,8-naphthyridine and their interaction with human telomeric DNA and promoter G-quadruplex forming DNAs. The interactions of ligands with quadruplex forming DNAs were studied by various biophysical, biochemical, and computational methods. Results indicated that bisquinolinium ligands bind tightly and selectively to quadruplex DNAs at low ligand concentration (similar to 0.2-0.4 mu M). Furthermore, thermal melting studies revealed that ligands imparted higher stabilization for quadruplex DNA (an increase in the T-m of up to 21 degrees C for human telomeric G-quadruplex DNA and >25 degrees C for promoter G-quadruplex DNAs) than duplex DNA (Delta T-m < 1.6 degrees C). Molecular dynamics simulations revealed that the end-stacking binding mode was favored for ligands with low binding free energy. Taken together, the results indicate that the naphthyridine-based ligands with quinolinium and pyridinium side chains form a promising class of quadruplex DNA stabilizing agents having high selectivity for quadruplex DNA structures over duplex DNA structures.