benzyl (S)-3-(3-(benzyloxy)phenyl)-2-((tert-butoxycarbonyl)amino)propanoate | 162536-45-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: benzyl (S)-3-(3-(benzyloxy)phenyl)-2-((tert-butoxycarbonyl)amino)propanoate
• 英文别名: N-[(1,1-Dimethylethoxy)carbonyl]-3-(phenylmethoxy)-L-phenylalanine phenylmethyl ester；benzyl (2S)-2-[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonylamino]-3-(3-phenylmethoxyphenyl)propanoate
• CAS: 162536-45-0
• 化学式: C₂₈H₃₁NO₅
• 分子量: 461.558
• InChiKey: XMBPOSPCOWRBOY-VWLOTQADSA-N

物化性质

• 沸点：
  612.0±55.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.155±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.8
• 重原子数：
  34
• 可旋转键数：
  12
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.29
• 拓扑面积：
  73.9
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  benzyl (S)-3-(3-(benzyloxy)phenyl)-2-((tert-butoxycarbonyl)amino)propanoate 在 吡啶 、 盐酸 、 氯化亚砜 、 10% palladium hydroxide on charcoal 、 5%-palladium/activated carbon 、 氢气 、 1-羟基苯并三唑 、 caesium carbonate 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 、 N,N-二异丙基乙胺 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 N-[(dimethylamino)-3-oxo-1H-1,2,3-triazolo[4,5-b]pyridin-1-yl-methylene]-N-methylmethanaminium hexafluorophosphate 、 sodium hydroxide 作用下， 以 四氢呋喃 、 1,4-二氧六环 、 甲醇 、 二氯甲烷 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 50.0 ℃ 、344.75 kPa 条件下， 反应 96.5h， 生成 (7S,10S,13S)-N-cyclopentyl-9,12-dioxo-13-(2-oxopyrrolidin-1-yl)-10-phenethyl-2-oxa-8,11-diaza-1(1,3)-benzenacyclotetradecaphane-7-carboxamide
  参考文献：
  名称：

  作为物种选择性抗疟蛋白酶体抑制剂的大环肽的设计、合成和优化

  摘要：

  疟疾每年有超过 2 亿病例和近 50 万人死亡，对全球健康构成威胁，特别是在发展中国家。恶性疟原虫是导致最严重疾病的寄生虫，它已经对所有抗疟药物产生了耐药性。对一线抗疟药物青蒿素和青蒿素联合疗法的耐药性在东南亚普遍存在，并且在撒哈拉以南非洲地区正在出现。恶性疟原虫蛋白酶体是一个有吸引力的抗疟靶点，因为它的抑制作用可以在寄生虫生命周期的多个阶段杀死寄生虫，并恢复因 Kelch K13 突变而产生耐药性的寄生虫对青蒿素的敏感性。在这里，我们详细介绍了我们在结构分析和药代动力学特性的指导下开发非共价大环肽疟疾蛋白酶体抑制剂的努力，从而产生了一种有效的、物种选择性的、代谢稳定的抑制剂。

  DOI：

  10.1021/acs.jmedchem.2c00611
• 作为产物：
  描述：

  L-M-酪氨酸 在 caesium carbonate 作用下， 以 乙醇 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 生成 benzyl (S)-3-(3-(benzyloxy)phenyl)-2-((tert-butoxycarbonyl)amino)propanoate
  参考文献：
  名称：

  氨基二醇HIV蛋白酶抑制剂。P1 / P1'化合物的合成与构效关系：亲脂性和细胞毒性之间的关系。

  摘要：

  为了减少1的细胞毒性，合成了一系列基于P1'结构修饰的先导化合物1的HIV蛋白酶的新型氨基二醇抑制剂。我们已经观察到该系列抑制剂的亲脂性和细胞毒性之间存在高度相关性。 。发现在P1'苯基基团对位1处的适当取代导致鉴定出等价的（对酶和细胞培养均如此）化合物（10l，10m，10n和15c），这些化合物具有明显降低的细胞毒性。

  DOI：

  10.1021/jm950717a

文献信息

• [EN] MACROCYCLIC COMPOUNDS AS PROTEASOME INHIBITORS<br/>[FR] COMPOSÉS MACROCYCLIQUES UTILISÉS EN TANT QU'INHIBITEURS DU PROTÉASOME
  申请人：UNIV CORNELL

  公开号：WO2019075259A1

  公开（公告）日：2019-04-18

  The compounds of the present invention are represented by the following compounds having Formula I and Formula (I'): where the substituents R1, R2, R2', R3, R4, R5, R', R", X, Y, and Z are as defined herein and where the substituents R1, R2, R3, R4, R5, R', R", X, Y, and Z are as defined herein. These compounds are used in the treatment of bacterial infections, parasite infections, fungal infections, cancer, immunologic disorders, autoimmune disorders, neurodegenerative diseases and disorders, inflammatory disorders, or muscular dystrophy or for providing immunosuppression for transplanted organs or tissues.

  本发明的化合物由具有以下式I和式(I')的化合物表示，其中取代基R1、R2、R2'、R3、R4、R5、R'、R"、X、Y和Z如本文所定义，取代基R1、R2、R3、R4、R5、R'、R"、X、Y和Z如本文所定义。这些化合物用于治疗细菌感染、寄生虫感染、真菌感染、癌症、免疫紊乱、自身免疫性疾病、神经退行性疾病和紊乱、炎症性疾病，或肌肉萎缩症，或用于为移植的器官或组织提供免疫抑制。
• 협동 결합에 참여하는 화합물 및 그의 용도
  申请人：REVOLUTION MEDICINES, INC. 레볼루션 메디슨즈, 인크.(520190060181)

  公开号：KR20200003803A

  公开（公告）日：2020-01-10

  본 발명은 예를 들어 프리젠터 단백질 (예를 들어, FKBP 계열의 구성원, 사이클로필린 계열의 구성원, 또는 PIN1) 및 표적 단백질 (예를 들어, 진핵 표적 단백질 예컨대 포유동물 표적 단백질 또는 진균 표적 단백질 또는 원핵 표적 단백질 예컨대 박테리아 표적 단백질)에 대한 결합을 통해 생물학적 과정을 조절할 수 있는 화합물 (예를 들어, 거대환형 화합물)을 특징으로 한다. 이러한 화합물은 내인성 세포내 프리젠터 단백질, 예컨대 FKBP 또는 사이클로필린을 결합하고, 생성된 2원 복합체는 선택적으로 결합하여 세포내 표적 단백질의 활성을 조절한다. 프리젠터 단백질, 화합물 및 표적 단백질 중의 3원 복합체의 형성은 단백질-화합물 및 단백질-단백질 상호작용 모두에 의해 유도되고, 둘 모두는 표적화된 단백질의 활성의 조절을 위해 요구된다.

  本发明涉及一种通过结合主持蛋白质（例如FKBP家族成员、环肌凝蛋白家族成员或PIN1等）和靶蛋白（例如真核靶蛋白如哺乳动物靶蛋白或真菌靶蛋白或原核靶蛋白如细菌靶蛋白）来调节生物学过程的化合物（例如大环状化合物）。这些化合物结合内源性细胞内主持蛋白质，例如FKBP或环肌凝蛋白，并且生成的二聚体可以选择性地结合以调节细胞内靶蛋白的活性。主持蛋白质、化合物和靶蛋白中的三聚体形成受蛋白质-化合物和蛋白质-蛋白质相互作用的诱导，两者都是为了调节靶蛋白的活性而需要的。
• METHODS AND REAGENTS FOR ANALYZING PROTEIN-PROTEIN INTERFACES
  申请人：Revolution Medicines, Inc.

  公开号：US20210285955A1

  公开（公告）日：2021-09-16

  The present disclosure provides methods and reagents useful for analyzing protein-protein interfaces such as interfaces between a presenter protein (e.g., a member of the FKBP family, a member of the cyclophilin family, or PIN1) and a target protein. In some embodiments, the target and/or presenter proteins are intracellular proteins. In some embodiments, the target and/or presenter proteins are mammalian proteins.

  本公开提供了用于分析蛋白质-蛋白质界面的方法和试剂，例如展示蛋白质（例如FKBP家族成员、环肽酶家族成员或PIN1）与靶蛋白质之间的界面。在某些实施例中，靶蛋白质和/或展示蛋白质是细胞内蛋白质。在某些实施例中，靶蛋白质和/或展示蛋白质是哺乳动物蛋白质。
• Structure–Activity Relationship Studies of Antimalarial <i>Plasmodium</i> Proteasome Inhibitors─Part II
  作者：Hao Zhang、John Ginn、Wenhu Zhan、Annie Leung、Yi J. Liu、Akinori Toita、Rei Okamoto、Tzu-Tshin Wong、Toshihiro Imaeda、Ryoma Hara、Mayako Michino、Takafumi Yukawa、Sevil Chelebieva、Patrick K. Tumwebaze、Jeremie Vendome、Thijs Beuming、Kenjiro Sato、Kazuyoshi Aso、Philip J. Rosenthal、Roland A. Cooper、Nigel Liverton、Michael Foley、Peter T. Meinke、Carl F. Nathan、Laura A. Kirkman、Gang Lin

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.2c01651

  日期：2023.1.26

  a biphenyl ether-tethered macrocyclic scaffold. Extensive SAR studies around the P1, P3, and P5 groups and peptide backbone identified compound TDI-8414. TDI-8414 showed nanomolar antiparasitic activity, no toxicity to HepG2 cells, high selectivity against the Plasmodium proteasome over the human constitutive proteasome and immunoproteasome, improved solubility and PAMPA permeability, and enhanced metabolic

  随着对青蒿素和青蒿素联合疗法耐药性的报道越来越多，针对疟原虫蛋白酶体是抗疟开发的一种有前景的策略。我们最近报道了一种在人源化小鼠模型中具有抗疟活性的高选择性恶性疟原虫蛋白酶体抑制剂。为了平衡一系列大环化合物的渗透性与其他药物特性，我们对联苯醚系大环支架进行了进一步的构效关系研究。围绕 P1、P3 和 P5 基团以及肽主链进行的广泛 SAR 研究确定了化合物 TDI-8414。 TDI-8414 显示出纳摩尔级抗寄生虫活性，对 HepG2 细胞无毒性，相对于人类组成型蛋白酶体和免疫蛋白酶体，对疟原虫蛋白酶体具有高选择性，改善了溶解度和 PAMPA 通透性，并增强了人类和小鼠微粒体和血浆中的代谢稳定性。
• Constraining the Side Chain of C-Terminal Amino Acids in Apelin-13 Greatly Increases Affinity, Modulates Signaling, and Improves the Pharmacokinetic Profile
  作者：Kien Trân、Robin Van Den Hauwe、Xavier Sainsily、Pierre Couvineau、Jérôme Côté、Louise Simard、Marco Echevarria、Alexandre Murza、Alexandra Serre、Léa Théroux、Sabrina Saibi、Lounès Haroune、Jean-Michel Longpré、Olivier Lesur、Mannix Auger-Messier、Claude Spino、Michel Bouvier、Philippe Sarret、Steven Ballet、Éric Marsault

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.0c01941

  日期：2021.5.13