磺酸基-Cy3羧酸 | 666847-58-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吲哚及其衍生物
• 中文名称: 磺酸基-Cy3羧酸
• 中文别名: 磺基-CY3 羧酸
• 英文名称: cyanine 3
• 英文别名: Cy₃；6-[2-[3-(1-ethyl-3,3-dimethyl-5-sulfoindol-2-ylidene)prop-1-enyl]-3,3-dimethyl-5-sulfoindol-1-ium-1-yl]hexanoate
• CAS: 666847-58-1
• 化学式: C₃₁H₃₈N₂O₈S₂
• 分子量: 630.783
• InChiKey: YDNYBBRGPORVRT-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.9
• 重原子数：
  43
• 可旋转键数：
  10
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.42
• 拓扑面积：
  172
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  磺酸基-Cy3羧酸 在 N,N-二异丙基乙胺 、 三氟乙酸 作用下， 以 甲醇 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 2.0h， 生成 2-[3-[1-[6-(2-aminoethylamino)-6-oxohexyl]-3,3-dimethyl-5-sulfoindol-1-ium-2-yl]prop-2-enylidene]-1-ethyl-3,3-dimethylindole-5-sulfonate
  参考文献：
  名称：

  使用全氟化碳纳米乳液测量细胞内 pH 值

  摘要：

  我们报告了独特的全氟化碳 (PFC) 纳米乳液的合成和配方，能够通过荧光显微镜和流式细胞术测量活细胞中的细胞内 pH 值。这些纳米乳液经过配制，可在共孵育时轻松进入细胞，并含有两种与 PFC 分子共价结合的基于花青的荧光报告分子，特别是 Cy3-PFC 和 CypHer5-PFC 偶联物。纳米乳液的光谱和 pH 传感特性在体外进行了表征，并显示出配制后染料的光谱行为不变。在装载纳米乳液的大鼠 9L 神经胶质瘤细胞中，使用光学显微镜和流式细胞术纵向量化纳米乳液的局部 pH 值，并显示 pH 值在 3 小时内稳定下降至 5.5 的水平，表明纳米乳液快速吸收到酸性隔室。总体，这些试剂能够响应药理学操作实时光学检测活细胞中的细胞内 pH 值。此外，最近使用磁共振成像 (MRI) 进行体内细胞追踪的方法采用细胞内 PFC 纳米乳液探针使用 (19)F MRI 追踪细胞。然而，对这些成像探针的细胞内命运知之甚少。pH

  DOI：

  10.1021/ja407573m
• 作为产物：
  描述：

  2,3,3-三甲基-3H-吲哚-5-磺酸 在 吡啶 、 溶剂黄146 、 potassium hydroxide 作用下， 以 甲醇 、 丙醇 、 邻二氯苯 为溶剂， 反应 40.0h， 生成 磺酸基-Cy3羧酸
  参考文献：
  名称：

  Cyanine compound for labeling biomolecule and preparation method thereof

  摘要：

  揭示了一种新型的青霉素化合物，由以下的化学式1表示，用于标记生物分子，并提供了制备该化合物的方法。其中，R1、R2、R3、R4、B、m和n如上所定义。

  公开号：

  US08729276B2

文献信息

• An efficient approach to the synthesis of water-soluble cyanine dyes using poly(ethylene glycol) as a soluble support
  作者：Lin-Ling Jiang、Li-Fang Dou、Bao-Lin Li

  DOI：10.1016/j.tetlet.2007.06.060

  日期：2007.8

  An efficient synthesis approach to unsymmetrical water-soluble cyanine dyes has been established. Loading and activation of sulfoindolenium to poly(ethylene glycol) (PEG) have been achieved via a simple strategy. Cyanine dyes are released by the attack of heterocyclic carbon nucleophile and the cleavage of PEG-bound hemicyanine. The efficient approach delivers cyanine dyes in high purity without the

  建立了不对称水溶性花青染料的有效合成方法。通过一个简单的策略就可以将磺基吲哚装载并活化成聚乙二醇（PEG）。花青染料是通过杂环碳亲核试剂的攻击和与PEG结合的半菁的裂解而释放的。有效的方法可提供高纯度的花青染料，而无需进行简单的色谱分离。
• Labeling reagents and methods of their use
  申请人：Gee Kyle

  公开号：US08586743B2

  公开（公告）日：2013-11-19

  The present disclosure is directed to a reactive ester agent capable of conjugating a reporter molecule to a carrier molecule or solid support. The reactive ester agent has the general formula: wherein the variables are described throughout the application.

  本发明涉及一种反应性酯化剂，其能够将报告分子共轭到载体分子或固体支持物上。该反应性酯化剂具有以下通式： 其中，各变量在申请文件中均有描述。
• FLUORESCENCE COMPOUNDS AND PREPARATION METHOD THEREOF
  申请人：BioActs Co., Ltd.

  公开号：US20170313883A1

  公开（公告）日：2017-11-02

  Provided is a fluorescent compound represented by the following [Chemical Formula 1] and a method for preparing the same: wherein each of X, Y, R 1 , R 2 , R 3 and n is the same as defined in the specification.

  提供的是由以下化学式1表示的荧光化合物以及其制备方法：其中X、Y、R1、R2、R3和n中的每一个与规范中定义的相同。
• 一种磺基-Cy3羧酸荧光染料及其制备工艺
  申请人：江西高信前沿科技有限公司

  公开号：CN113462186A

  公开（公告）日：2021-10-01

  本发明涉及一种磺基‑Cy3羧酸荧光染料及其制备工艺，合成的磺基‑Cy3羧酸具有荧光量子产率、高发射高激发波长以及易溶于水物理化学性质稳点的特点，同时，本发明的合成方法通过同时构建苯并吲哚两侧支链，利用吲哚α位甲基活性较高的特点，在最后迈克尔与亚胺加成的时候选择性的生成了我们需要的单缩合目标产物，收率较高，通过沉淀和重结晶就能拿到纯品，而避免了C18柱分离，对后续中试放大具有一定的指导意义。
• A universal and ready-to-use heterotrifunctional cross-linking reagent for facile synthetic access to sophisticated bioconjugates
  作者：Guillaume Clavé、Hervé Volland、Mélanie Flaender、Didier Gasparutto、Anthony Romieu、Pierre-Yves Renard

  DOI：10.1039/c0ob00133c

  日期：——

  active carbamate moiety enables us to reach the targeted chemical orthogonality without the use of temporary aminooxy- and thiol protecting groups. Thus, the preparation of sophisticated bioconjugates through the sequential derivatisation of the tripod by means of copper-mediated 1,3-dipolar cycloaddition, oxime ligation and aqueous compatible mild thiol-alkylation reactions, is significantly simpler and

  我们首次描述了带有三个完全相互兼容的生物正交功能基团的原始异三功能交联剂（也称为三脚架）的合成和某些生物缀合应用。与我们最近报道的第一代三脚架相反（Org。生物摩尔。化学 ，2008，6，3065），使用叠氮基取代的亲核试剂敏感的活性氨基甲酸酯分子部分使我们能够达到目标化学正交性，而无需使用临时的氨氧基和硫醇保护基。因此，通过三脚架的连续衍生，通过铜介导的1，3-偶极环加成，肟连接和与水相容的轻度硫醇烷基化反应明显更简单，更方便。化学选择性生物缀合方案是通过基于FRET盒的制备而优化的花青 和/或 an吨荧光染料对以及随后锚定到易碎的生物分子上。该通用交联剂的适用性还通过通过SPIT-FRI方法制备适合检测黄曲霉毒素B1的生物芯片来说明。