2',3',5'-tris(O-triethylsilyl)uridine | 190836-61-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 2',3',5'-tris(O-triethylsilyl)uridine
• 英文别名: 2',3',5'-tris-O-(triethylsilyl)uridine
• CAS: 190836-61-4
• 化学式: C₂₇H₅₄N₂O₆Si₃
• 分子量: 586.992
• InChiKey: SNDIPQDMGKESJS-VNSJUHMKSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  6.24
• 重原子数：
  38.0
• 可旋转键数：
  17.0
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.85
• 拓扑面积：
  91.78
• 氢给体数：
  1.0
• 氢受体数：
  7.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2',3',5'-tris(O-triethylsilyl)uridine 在 二氯乙酸 、 四丁基氟化铵 、 水 、 溶剂黄146 、 二甲基亚砜 、 N,N'-二环己基碳二亚胺 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 37.5h， 生成 5'-hydroxyuridine
  参考文献：
  名称：

  白霉素核苷抗生素硫庚糖核中非典型立体化学的生物合成起源

  摘要：

  白霉素是肽基硫代核苷天然产物，对临床上重要的病原体显示出抗菌活性。它们的结构以具有非典型立体化学的硫庚糖为特征，包括用 d-氨基酸部分修饰的 d-呋喃木糖环。在本文中证明，AbmH 是一种依赖于 5'-磷酸 (PLP) 的吡哆醛转醛缩酶，其催化苏式选择性醛醇型反应以生成具有 d-呋喃核糖环和 l-氨基酸部分的硫庚糖核心。L-氨基酸构型向d-氨基酸构型的转化由PLP依赖性差向异构酶AbmD催化。根据基因缺失实验，硫代呋喃糖环从 d-核糖到 d-木糖的转化似乎是由 AbmJ 介导的，AbmJ 被注释为自由基 S-腺苷-l-甲硫氨酸 (SAM) 酶。

  DOI：

  10.1021/jacs.8b12565
• 作为产物：
  描述：

  三乙基氯硅烷 、 尿嘧啶核苷 在 咪唑 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 11.0h， 以99%的产率得到2',3',5'-tris(O-triethylsilyl)uridine
  参考文献：
  名称：

  白霉素核苷抗生素硫庚糖核中非典型立体化学的生物合成起源

  摘要：

  白霉素是肽基硫代核苷天然产物，对临床上重要的病原体显示出抗菌活性。它们的结构以具有非典型立体化学的硫庚糖为特征，包括用 d-氨基酸部分修饰的 d-呋喃木糖环。在本文中证明，AbmH 是一种依赖于 5'-磷酸 (PLP) 的吡哆醛转醛缩酶，其催化苏式选择性醛醇型反应以生成具有 d-呋喃核糖环和 l-氨基酸部分的硫庚糖核心。L-氨基酸构型向d-氨基酸构型的转化由PLP依赖性差向异构酶AbmD催化。根据基因缺失实验，硫代呋喃糖环从 d-核糖到 d-木糖的转化似乎是由 AbmJ 介导的，AbmJ 被注释为自由基 S-腺苷-l-甲硫氨酸 (SAM) 酶。

  DOI：

  10.1021/jacs.8b12565

文献信息

• A Chemical Method for Site-Specific Modification of RNA:  The Convertible Nucleoside Approach
  作者：Charles R. Allerson、Swaine L. Chen、Gregory L. Verdine

  DOI：10.1021/ja962858n

  日期：1997.8.1

  for a means by which to constrain RNA structure, either to reduce its conformational flexibility or to help distinguish between alternative structural models. To address this need, we have developed chemistry that permits the site-specific introduction of functionalizable tethers into RNA. Here we report the design and synthesis of reagents for use in solid-phase RNA synthesis that allow the functionalization

  RNA结构的知识可以极大地促进对其生物学功能的理解。然而，RNA 的物理特性，尤其是其构象异质性，阻碍了高分辨率结构分析。因此，较低分辨率的方法，如生化探测、系统发育分析和分子建模，已在 RNA 科学中发挥重要作用。这种情况导致需要一种方法来约束 RNA 结构，以减少其构象灵活性或帮助区分替代结构模型。为了满足这一需求，我们开发了化学方法，允许将可功能化的系链特定于位点引入 RNA。在这里，我们报告了用于固相 RNA 合成的试剂的设计和合成，这些试剂允许 G、C 和 A 残基的碱基部分的功能化。在掺入寡核苷酸中并随后用烷基胺处理后，可转化的核苷衍生物...